Estudo genético de duas populações de Odontesthes bonariensis através de marcadores microssatélites.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Tavares, Rafael Aldrighi
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
Texto Completo: http://repositorio.ufpel.edu.br/handle/ri/2636
Resumo: Divergency and genetic variability of two populations (Brazil and Argentina) were identified through polymorphism of six microsatellite markers. Eighty Five animals from the two populations were studied, 40 animals collected from Chascomus lake in Buenos Aires, Argentina and 45 from Chasqueiro Dam in Arroio Grande, Rio Grande do Sul, Brazil. The collected material was muscle and caudal fin fragments, stored in 95% ethanol and kept at -20 ºC. Three different protocols for DNA extraction were tested: 1) Phenol Chloroform; 2) Sodium chloride 3) Ammonia acetate (modified Sodium chloride). Six microsatellite loci were analyzed by allelic frequency, observed heterozygosis, expected genetic diversity according to Hardy-Weinberg equilibrium, number of alleles per locus, percentage of polymorphic loci and Wright fixation. The results showed that the microsatellites analyzed presented high polymorphism. The number of alleles varied from 4 to 15. A total of 49 alleles were obtained from all the samples. Fst value between the two populations was 0.1303, that is, the populations presented moderate genetic differentiation (P<0.05). It was concluded that due to the high polymorphism analyzed in the six microsatellite loci, they can be an efficient tool for genetic variation studies of O. bonariensis and the significant genetic differentiation in the populations analyzed can provide basis for further genetic improvement programs.
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The collected material was muscle and caudal fin fragments, stored in 95% ethanol and kept at -20 ºC. Three different protocols for DNA extraction were tested: 1) Phenol Chloroform; 2) Sodium chloride 3) Ammonia acetate (modified Sodium chloride). Six microsatellite loci were analyzed by allelic frequency, observed heterozygosis, expected genetic diversity according to Hardy-Weinberg equilibrium, number of alleles per locus, percentage of polymorphic loci and Wright fixation. The results showed that the microsatellites analyzed presented high polymorphism. The number of alleles varied from 4 to 15. A total of 49 alleles were obtained from all the samples. Fst value between the two populations was 0.1303, that is, the populations presented moderate genetic differentiation (P<0.05). It was concluded that due to the high polymorphism analyzed in the six microsatellite loci, they can be an efficient tool for genetic variation studies of O. bonariensis and the significant genetic differentiation in the populations analyzed can provide basis for further genetic improvement programs.Foram Identificadas a divergência e a variabilidade genética de duas populações de peixe-rei (Brasil e Argentina), através do polimorfismo de seis marcadores microssatélites. Oitenta e cinco (85) animais de duas populações de peixe-rei, 40 animais coletados na lagoa de Chascomus, localizado na Província de Buenos Aires, Argentina e 45 animais coletados na barragem do Chasqueiro localizado no município de Arroio Grande, estado do Rio Grande do Sul, Brasil. O material coletado foi de fragmentos de músculo e nadadeira caudal, sendo armazenados em etanol 95% e preservados a -20ºC. Foram testados 3 protocolos diferentes para extração de DNA: 1) Fenol Clorofórmio; 2) Cloreto de Sódio e 3) Acetato de Amônia (Cloreto de Sódio modificado). Seis loci de microssatélites foram analisados através das frequências alélicas, heterozigosidade observada, diversidade gênica esperada segundo o equilíbrio de Hardy-Weinberg, número de alelos por locus, porcentagem de loci polimórficos e índice de fixação de Wright. Os resultados mostram que os microssatélites analisados apresentaram alto polimorfismo. Os números de alelos variaram de 4 a 15. Para todas as amostras foi obtido um total de 49 alelos, com uma média de 8,16 alelos por locus. O valor de Fst entre as duas populações foi de 0,1303, ou seja, as populações apresentam moderada diferenciação genética (P<0,05). Foi concluído que através do alto polimorfismo analisado nos seis loci de microssatélites, estes fornecem uma ferramenta eficiente para estudo da variação genética de O. bonariensis e a diferenciação genética significante nas populações analisadas pode fornecer a base para futuros programas de melhoramento genético.application/pdfporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaUFPelBRFaculdade de Agronomia Eliseu MacielMelhoramento genéticoMarcadores molecularesPeixes nativosGenetic improvementMolecular markersNative fishCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIAEstudo genético de duas populações de Odontesthes bonariensis através de marcadores microssatélites.Genetic analysis of two populations of Odontesthes bonariensis using microsatellite markers.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELORIGINALDissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdfapplication/pdf1215276http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/2636/1/Dissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdff18757551e48ae3dac612f8369f4fdbaMD51open accessTEXTDissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.txtDissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.txtExtracted Texttext/plain99164http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/2636/2/Dissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.txt2540d346f6d58d7113f2ef26c3fa4bcbMD52open accessTHUMBNAILDissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.jpgDissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1355http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/2636/3/Dissertacao_Rafael_Aldrighi_Tavares.pdf.jpgbeb51e851a5dd5a76f2a7a740cd3d1d4MD53open access123456789/26362022-12-19 18:41:41.708open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:123456789/2636Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2022-12-19T21:41:41Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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