Identificação do sítio de ligação ao DNA da proteína NtrX de Herbaspirillum seropedicae

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bonato, Paloma
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/30312
Resumo: Orientadora: Roseli Wassem
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spelling Bonato, PalomaMonteiro, Rose Adele, 1973-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Curso de Graduação em Ciências BiológicasWassem, Roseli, 1972-2022-09-05T16:42:49Z2022-09-05T16:42:49Z2009https://hdl.handle.net/1884/30312Orientadora: Roseli WassemCoorientadora: Rose Adele MonteiroMonografia (Bacharelado) - Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Curso de Graduação em Ciências BiológicasResumo : Herbaspirillum seropedicae é uma bactéria fixadora de nitrogênio endofítica, membro da classe ß-Proteobacteria. Recentemente, duas novas proteínas do sistema Ntr foram identificadas neste microrganismo: NtrX e NtrY, as quais são membros da família do sistema de dois componentes. NtrY é uma histidina quinase que fosforila o seu par regulador NtrX em resposta a um sinal metabólico. A proteína NtrX de H. seropedicae apresenta 27,1 kDa e contém dois domínios principais: o regulador de resposta, que recebe o sinal de NtrY, e o que contém o motivo hélice-volta-hélice associado com ligação ao DNA, mas não apresenta o domínio de interação com o fator s 54 (AAA), comum em proteínas homólogas de outros organismos. NtrX ativa a transcrição de genes envolvidos com o metabolismo de nitrato, mas o mecanismo de ativação e sítio de interação ao DNA não são conhecidos. Ensaios de footprinting com DNAse I utilizando fragmentos de DNA contendo a região promotora do operon narXL marcada com fluoróforos revelaram que a região entre 100 a 180 pares de base da origem de tradução de narX foi protegida pela proteína NtrX. Além disso, algumas bandas desta região foram hiper-reativas sugerindo uma distorção do DNA e maior exposição à digestão por DNAse. Ensaios de footprinting com DNAse I utilizando a região promotora de narXL marcada com 32P confirmaram os resultados anteriores. Ensaios de retardamento de banda em gel mostraram que a região promotora do operon narXL apresenta um sítio de ligação ao fator s70 .1 recurso online : PDF.application/pdfExigências do sistema: Adobe Acrobat ReaderHerbaspirillumIdentificação do sítio de ligação ao DNA da proteína NtrX de Herbaspirillum seropedicaeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALMonografia Paloma Bonato.pdfapplication/pdf922381https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/30312/1/Monografia%20Paloma%20Bonato.pdf049f66f313602d0789a2da4eb49618b7MD51open accessTEXTMonografia Paloma Bonato.pdf.txtExtracted Texttext/plain78046https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/30312/2/Monografia%20Paloma%20Bonato.pdf.txt7bcc8f7c96eb4b5af33a54b8a645cb42MD52open accessTHUMBNAILMonografia Paloma Bonato.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1088https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/30312/3/Monografia%20Paloma%20Bonato.pdf.jpg2522717bcccdf7a8e0aababd2e713956MD53open access1884/303122022-09-05 13:42:49.365open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/30312Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-09-05T16:42:49Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
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