Sequenciamento parcial do Replicon pAZ6 de Azospirillum brasilense FP2

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andreazza, Ana Paula
Data de Publicação: 2004
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/78534
Resumo: Orientadores: Dr. Emanuel M. de Souza e Dr.ª Cynthia M. T. Fadel Picheth
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spelling Andreazza, Ana PaulaFadel-Picheth, Cyntia Maria Telles, 1957-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Ciências (Bioquímica)Souza, Emanuel Maltempi de, 1964-2022-09-06T21:06:09Z2022-09-06T21:06:09Z2004BROCHhttps://hdl.handle.net/1884/78534Orientadores: Dr. Emanuel M. de Souza e Dr.ª Cynthia M. T. Fadel PichethDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Curso de Pós-Graduação em Bioquímica e Biologia MolecularInclui referências: p. 76-94Resumo: A organização genômica das alfa-proteobactérias é altamente variável e geralmente muito complexa. O genoma da rizobactéria A. brasilense é composto de vários replicons variando de 100 a 3000 kb. Quatro destes replicons hibridizam com a sonda do gene 16S rDNA, sugerindo que A. brasilense possui vários cromossomos. O perfil eletroforético em campo pulsado do DNA intacto de Azospirillum brasilense estirpe FP2 obtido neste trabalho revelou dois novos replicons (de 745 e 785 kb), que não haviam sido descritos anteriormente, sugerindo que o tamanho genoma do Azospirillum brasilense estirpe FP2 é de aproximadamente 8,2 Mpb. O replicon de 630 Kb, denominado pAZ6, de A. brasilense é o menor da estirpe FP2 que hibridiza com a sonda do gene 16S rDNA. Neste estudo foi realizado o seqüenciamento parcial deste replicon. O pAZ6 foi isolado e purificado por eletroforese em campo pulsado utilizando o sistema CHEF-DRIII (Bio-Rad) e, posteriormente, o DNA extraído do gel de agarose foi amplificado usando o sistema TempliPhi (Amersham Biosciences), uma técnica não-PCR. O DNA amplificado foi utilizado para construir uma biblioteca genômica no vetor pCR4Blunt-TOPO. Os plasmídeos (1858) foram seqüenciados e as leituras de seqüências montadas em contíguos pelos programas PHRED/PHRAP e, em seguida, os contíguos formados foram analisados utilizando os programas FramePlot e BlastP. Os resultados revelaram que o replicon pAZ6 apresenta genes envolvidos em processos biossintéticos (parede celular, de vitamina BI2, lipídeos e nucleotídeos), metabolismo de piruvato, produção de energia, degradação de aminoácidos, metabolismo de carboidratos e de lipídeos, regulação transcricional, metabolismo nitrogenado, transporte de solutos e quimiotaxia. A categoria funcional mais representada entre os prováveis produtos gênicos do replicon foi a de transportadores. Os resultados sugerem fortemente que o replicon pAZ6 é parte essencial do genoma de A. brasilense estirpe FP2.ix, 94 f. : il., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalBioquímicaAzospirillum brasilenseTesesBioquímicaSequenciamento parcial do Replicon pAZ6 de Azospirillum brasilense FP2info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALD - D - ANA PAULA ANDREAZZA.pdfapplication/pdf9702457https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/78534/1/D%20-%20D%20-%20ANA%20PAULA%20ANDREAZZA.pdfd3ecc34be86aab5086331975a166d2b3MD51open access1884/785342022-09-06 18:06:09.426open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/78534Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-09-06T21:06:09Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
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