BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andreatta, Anderson
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/36582
Resumo: Orientador : Prof. Dr. Alessandro Brawerman
id UFPR_969a6eb768076c542df5af280c1e7d3e
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/36582
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Brawerman, Alessandro, 1977-Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em BioinformáticaAndreatta, Anderson2022-12-02T17:17:43Z2022-12-02T17:17:43Z2013https://hdl.handle.net/1884/36582Orientador : Prof. Dr. Alessandro BrawermanDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Educação Profissional e Tecnológica, Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. Defesa: Curitiba, 09/05/2013Inclui referênciasÁrea de concetração: BioinformáticaResumo:No desenvolvimento de software para a área de Bioinformática, pesquisadores consideram vários fatores para definir as tecnologias e metodologias utilizadas em um determinado projeto, não sendo raro encontrar soluções com finalidades iguais ou similares utilizando diferentes tecnologias. Com a proposta de fortalecer a comunidade de Bioinformática, o framework BAK4BIO - Brazilian Army Knife for Bioinformatics é um conjunto de ferramentas para a construção de aplicativos para a plataformaWeb e Mobile. É composto por uma série de subsistemas, os quais possibilitam ao usuário final buscar informações nos principais bancos de dados biológicos; iniciar e supervisionar processos de Bioinformática em ambiente computacional de alto desempenho - BAK4BIO Cluster; e gerenciar arquivos relacionados a entrada e saída de processos nas nuvens - BAK4BIO BOX. Tudo isto provendo a mobilidade necessária para seus usuários, ao permitir com que todos os processos sejam iniciados a partir de um aplicativo desenvolvido para Android - o BAK4BIO Droid. Existe também módulo BAK4BIO Server, responsável por centralizar o recebimento de requisições do módulo Droid e encaminhar para o destino correto, atuando como um proxy. Finalmente, o BAK4BIO Web, criado para interagir com as soluções do framework via Web. A carência de frameworks para o desenvolvimento de ferramentas em Bioinformática encontrada na literatura demonstra que, a existência do BAK4BIO contribui para a integração entre diferentes trabalhos científicos e o coloca em destaque por seu pioneirismo em âmbito nacional na área de mobilidade. Com destaque ao módulo BAK4BIO Droid, disponível na Google PlayStore e utilizado pela comunidade científica em vários países desde o seu lançamento. Palavras-chave: Framework; Dispositivos Móveis; Integração de sistemas; Acesso a bases biológicas; Ferramentas Biológicas. xiiiAbstract: Software development for Bioinformatics, researchers consider several factors to dene the technologies and methods used in a given project, it isn't uncommon nd solutions with similar purposes using diferent technologies. With the proposal to strengthen the Bioinformatic's community, the framework BAK4BIO - Brazilian Army Knife for Bioinformatics is a set of tools for building applications for the Web and Mobile platforms. It consists of a number of subsystems, which enable the user to retrieve information on major biological databases; initiate and supervise Bioinformatics processes in highperformance computing environment - BAK4BIO Cluster, and manage related to input and output processes in clouds - BAK4BIO BOX. All this providing the necessary mobility to users by allowing that all processes start from an application developed for Android - BAK4BIO Droid. There is also BAK4BIO Server module, responsible for centralizing the receipt of requests from the Droid module and forward to the correct destination, acting as a proxy. Finally, the Web BAK4BIO designed to interact with the framework via Web solutions The lack of frameworks for the development of Bioinformatics tools found in the literature shows that the existence of BAK4BIO contributes to the integration of dierent scientic studies and highlights in for his pioneering nationwide in the area of mobility. Highlighting the BAK4BIO Droid unit, available in Google PlayStore and used by the scientic community in several countries since its launch. Key-words: Framework, Mobile Devices, System's Integration, Access to biological bases; Biological Tools. xiv66p. : il. algumas color., tabs., grafs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesBioinformáticaDispositivos moveisFramework (Programa de computador)BioinformáticaBAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformaticsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - ANDERSON ANDREATTA.pdfapplication/pdf2740324https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/1/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdfbbaa8baa02d7434c131f6e3a9d232bbaMD51open accessTEXTR - D - ANDERSON ANDREATTA.pdf.txtExtracted Texttext/plain112601https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/2/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdf.txtd14544edda7b594b602b8bcf96aa08fdMD52open accessTHUMBNAILR - D - ANDERSON ANDREATTA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1172https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/3/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdf.jpg2199d27d346aad6aa95ed1185aed6cf2MD53open access1884/365822022-12-02 14:17:43.378open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/36582Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-12-02T17:17:43Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
title BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
spellingShingle BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
Andreatta, Anderson
Teses
Bioinformática
Dispositivos moveis
Framework (Programa de computador)
Bioinformática
title_short BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
title_full BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
title_fullStr BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
title_full_unstemmed BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
title_sort BAK4BIO framework - Brasilian Army Knife for bioinformatics
author Andreatta, Anderson
author_facet Andreatta, Anderson
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Brawerman, Alessandro, 1977-
Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em Bioinformática
dc.contributor.author.fl_str_mv Andreatta, Anderson
dc.subject.por.fl_str_mv Teses
Bioinformática
Dispositivos moveis
Framework (Programa de computador)
Bioinformática
topic Teses
Bioinformática
Dispositivos moveis
Framework (Programa de computador)
Bioinformática
description Orientador : Prof. Dr. Alessandro Brawerman
publishDate 2013
dc.date.issued.fl_str_mv 2013
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-12-02T17:17:43Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-12-02T17:17:43Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/36582
url https://hdl.handle.net/1884/36582
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 66p. : il. algumas color., tabs., grafs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/1/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/2/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36582/3/R%20-%20D%20-%20ANDERSON%20ANDREATTA.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv bbaa8baa02d7434c131f6e3a9d232bba
d14544edda7b594b602b8bcf96aa08fd
2199d27d346aad6aa95ed1185aed6cf2
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860931930554368

Registros relacionados