Identificação molecular e resistência antimicrobiana de Escherichia coli patogênicas e Salmonella sp. isoladas de suínos criados no estado do Pará.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: MONGER, Suellen da Gama Barbosa
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRA
Texto Completo: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1734
Resumo: CAPES
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spelling Identificação molecular e resistência antimicrobiana de Escherichia coli patogênicas e Salmonella sp. isoladas de suínos criados no estado do Pará.Escherichia coliSalmonellaSuínosResistência antimicrobianaEnteropatógenosEnteropathogensAntimicrobial resistanceSwineCAPESNa região Norte, a suinocultura caracteriza-se como fonte complementar de renda, e com pouca atenção aos cuidados higiênico-sanitários, o que favorece as infecções bacterianas entéricas responsáveis por grande impacto na suinocultura e algumas na saúde coletiva. No ecossistema amazônico, pouco se conhece a respeito de enterobactérias em suínos destinados ao abate. Deste modo, objetivou-se investigar a ocorrência de Escherichia coli patogênicas e Salmonella sp. em suínos criados no Estado do Pará, determinar os fatores de risco, além de verificar o perfil de resistência à antimicrobianos das cepas patogênicas. Foram colhidas 200 amostras de fezes (swab retal) de suínos procedentes de 15 propriedades localizadas na Mesorregião Metropolitana de Belém e do Nordeste Paraense e processadas no Laboratório de Enterobactérias do Instituto Evandro Chagas, Ananindeua, PA. Para isolamento de E. coli, as amostras foram semeadas nos caldos EC e GN, incubadas e a seguir semeada em Ágar MacConkey. As colônias suspeitas foram identificadas em TSI (Triple Sugar Iron Agar) para posterior caracterização bioquímica. A caracterização do patótipo foi realizada a partir da amplificação através da técnica da PCR (Polymerase Chain Reaction) Multiplex. Para o isolamento de Salmonella sp., amostras foram inoculadas nos caldos de enriquecimento Selenito Cistina e Rappaport e, após incubação, foram semeadas nos meios de cultura seletivosindicadores Salmonella-Shigella (SS) e em ágar Xilose-Lisina-Descarboxilato (XLD). Colônias suspeitas foram identificadas em TSI para posterior identificação bioquímica e confirmados por PCR. A susceptibilidade aos agentes antimicrobianos dos isolados foi avaliada utilizando o sistema automatizado VITEK® 2 Compact (bioMérieux). Os dados foram tabulados e avaliados através de software estatístico Statistical Analysis System (SAS, 2019), utilizando-se o teste estatístico qui-quadrado (χ 2) com nível de significância de 5%. Para determinar os fatores de risco, os resultados das fichas foram tabulados e o teste odds ratios utilizado para cada variável investigada, calculadas considerando como variável dependente o status do animal (positivo ou negativo) para a bactéria patogênica. Das 200 amostras de suabes fecais, 40,5% apresentaram E. coli patogênicas isoladas e identificadas pela PCR, destas, 26% de E. coli enteropatogênicas (EPEC), 11% E. coli enterohemorrágicas (EHEC), 11% E. coli enteroinvasoras (EIEC), além de 3% (6/200) com Salmonella sp.. Em relação aos fatores de risco pesquisados, somente a presença de outras espécies animais e o material dos galpões do tipo madeira foram considerados estatisticamente significativos. Entre os isolados de E. coli considerados patogênicos, 72,62% demonstraram sensibilidade para todos os antimicrobianos testados, 27,38% resistência para pelo menos 1 antimicrobiano testado e 26,19% das amostras apresentaram multirresistência. As maiores resistências foram para Ampicilina (22,62%), Trimetoprim Sulfametoxazol (19,04%), Cefalotina (16,66%) e Ácido nalidíxico (13,09%). Ademais, 7,14% para Ciprofloxacina, 5,95% para Cefuroxima, 3,57% para Nitrofurantoína, 2,38% para Ceftriaxona, para Norfloxacina e para Amoxilina e 1,9% para Ertapenem. Deste modo, foi possível verificar a ocorrência de E. coli patogênicas e Salmonella sp. em suínos criados no Estado do Pará; chamando atenção a heterogeneidade dos animais acometidos. Além disso, observou-se resistência dessas cepas patogênicas surgindo uma grande preocupação a respeito da seleção de genes de resistência em bactérias presentes na microbiota de animais utilizadas como fonte de alimento.In the northern region, pig farming is characterized as a complementary source of income, and with little attention to hygienic-sanitary care, which favors enteric bacterial infections that have a great impact on pig farming and some on collective health. In the Amazonian ecosystem, little is known about enterobacteria in slaughter pigs. Thus, the objective was to investigate the occurrence of pathogenic Escherichia coli and Salmonella sp. in pigs raised in the State of Pará, to determine the risk factors, besides verifying the antimicrobial resistance profile of pathogenic strains. 200 swine fecal swab samples were collected from 15 farms located in the Metropolitan Mesoregion of Belém and Northeast Paraense and processed at the Evandro Chagas Institute Enterobacterial Laboratory, Ananindeua, PA. For E. coli isolation, samples were sown in EC and GN broths, incubated and then seeded on MacConkey Agar. Suspected colonies were identified on TSI (Triple Sugar Iron Agar) for further biochemical characterization. The characterization of the pathotype was performed from amplification by PCR (Polymerase Chain Reaction) Multiplex technique. For isolation of Salmonella sp., Samples were inoculated into the Selenite Cystine and Rappaport enrichment broths and, after incubation, were sown in the selective culture media-indicators Salmonella-Shigella (SS) and on Xylose-LysineDescarboxylate (XLD) agar. . Suspicious colonies were identified on TSI for later biochemical identification and confirmed by PCR. The susceptibility to antimicrobial agents of the isolates was evaluated using the automated VITEK® 2 Compact system (bioMérieux). Data were tabulated and evaluated using statistical software Statistical Analysis System (SAS, 2019), using the chi-square statistical test (χ2) with a significance level of 5%. To determine the risk factors, the results of the records were tabulated and the odds ratios test used for each investigated variable, calculated considering as dependent variable the animal status (positive or negative) for the pathogenic bacterium. Of the 200 fecal swab specimens, 40.5% had pathogenic isolated E. coli identified by PCR, of which 26% enteropathogenic E. coli (EPEC), 11% enterohemorrhagic E. coli (EHEC), 11% E. coli enteroinvasoras (EIEC), in addition to 3% (6/200) with Salmonella sp .. Regarding the risk factors investigated, only the presence of other animal species and the material of the wood type houses were considered statistically significant. Among the E. coli isolates considered pathogenic, 72.62% showed sensitivity for all tested antimicrobials, 27.38% resistance for at least 1 tested antimicrobial and 26.19% of the samples showed multidrug resistance. The highest resistances were for Ampicillin (22.62%), Trimethoprim Sulfamethoxazole (19.04%), Cephalothin (16.66%) and Nalidixic Acid (13.09%). In addition, 7.14% for Ciprofloxacin, 5.95% for Cefuroxime, 3.57% for Nitrofurantoin, 2.38% for Ceftriaxone, Norfloxacin and Amoxiline and 1.9% for Ertapenem. Thus, it was possible to verify the occurrence of pathogenic E. coli and Salmonella sp. in pigs raised in the state of Pará; calling attention to the heterogeneity of the affected animals. In addition, resistance of these pathogenic strains was observed and there was a great concern regarding the selection of resistance genes in bacteria present in the microbiota of animals used as a food source.UFRA - Campus Belémhttp://lattes.cnpq.br/9266281009742277PEREIRA, Washington Luiz AssunçãoROCHA, Daniela Cristiane da Cruzhttp://lattes.cnpq.br/4294679098531496https://orcid.org/0000-0003-1385-7540MONGER, Suellen da Gama Barbosa2022-10-21T20:24:39Z2022-10-21T20:24:39Z2019info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfMONGER, Suellen da Gama Barbosa. Identificação molecular e resistência antimicrobiana de Escherichia coli patogênicas e Salmonella sp. isoladas de suínos criados no estado do Pará. Orientador: Washington Luiz Assunção Pereira. 2019. Tese (Doutorado em Saúde e Produção animal na Amazônia) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, 2019. Disponível em: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1734. Acesso em: .http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/1734Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United Stateshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFRAinstname:Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)instacron:UFRA2022-10-21T20:29:23Zoai:repositorio.ufra.edu.br:123456789/1734Repositório Institucionalhttp://repositorio.ufra.edu.br/jspui/PUBhttp://repositorio.ufra.edu.br/oai/requestrepositorio@ufra.edu.br || riufra2018@gmail.comopendoar:2022-10-21T20:29:23Repositório Institucional da UFRA - Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)false
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