Caracterização molecular de isolados do Cowpea aphid borne mosaic virus que infectam maracujazeiro (Passiflora spp.) e feijão-caupi (Vigna unguiculata)
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Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRB |
Texto Completo: | http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2281 |
Resumo: | A ocorrência de pragas e doenças apresenta-se como um dos principais problemas a diversas culturas de grande importância agronômica. No maracujazeiro, a virose do endurecimento dos frutos e no feijão caupi, o mosaico do caupi, são as viroses mais importantes em todo mundo, causando grandes prejuízos de ordem financeira. São doenças causadas pelo Cowpea afhid-borne mosaic virus (CABMV), gênero Potyvirus. No maracujazeiro o agente etiológico foi denominado Passionfruit woodiness virus (PWV), gênero Potyvirus, e posteriormente descobriu-se que mais duas espécies do mesmo gênero causavam a mesma doença, o Cowpea aphid-borne mosaic vírus (CABMV) e o East asian passiflora virus (EAPV). No Brasil, recentes estudos têm indicado ser o CABMV o vírus prevalente como causador desta doença. Diante desse cenário, o presente trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade genética dos diferentes isolados de CABMV que infectam as culturas do maracujazeiro e feijão caupi em diferentes regiões produtoras do Brasil. O RNA total foi extraído pelo método do TRIZOL (Invitrogen) e utilizado na síntese do cDNA viral, através de reações de RT-PCR, que foram conduzidas utilizando kits comerciais, em diferentes combinações de oligonucleotídeos. Os produtos das amplificações foram clonados e encaminhados ao sequenciamento. Foram sequenciados e caracterizados sete isolados, sendo cinco provenientes do feijão caupi e dois do maracujá, e estes corresponderam a uma sequência de 838 nucleotídeos que codificam parte da proteína de Inclusão Cilíndrica (CI) e a sequência parcial do gene da proteína 6K2. As sequências de aminoácidos e nucleotídeos revelaram identidade elevada, variando de 91 a 99% e 84 a 99% respectivamente, demonstrando uma baixa variabilidade genética entre os isolados deste estudo. |
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2023-05-16T17:30:51Z2023-05-16T17:30:51Z2012-11-21http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2281A ocorrência de pragas e doenças apresenta-se como um dos principais problemas a diversas culturas de grande importância agronômica. No maracujazeiro, a virose do endurecimento dos frutos e no feijão caupi, o mosaico do caupi, são as viroses mais importantes em todo mundo, causando grandes prejuízos de ordem financeira. São doenças causadas pelo Cowpea afhid-borne mosaic virus (CABMV), gênero Potyvirus. No maracujazeiro o agente etiológico foi denominado Passionfruit woodiness virus (PWV), gênero Potyvirus, e posteriormente descobriu-se que mais duas espécies do mesmo gênero causavam a mesma doença, o Cowpea aphid-borne mosaic vírus (CABMV) e o East asian passiflora virus (EAPV). No Brasil, recentes estudos têm indicado ser o CABMV o vírus prevalente como causador desta doença. Diante desse cenário, o presente trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade genética dos diferentes isolados de CABMV que infectam as culturas do maracujazeiro e feijão caupi em diferentes regiões produtoras do Brasil. O RNA total foi extraído pelo método do TRIZOL (Invitrogen) e utilizado na síntese do cDNA viral, através de reações de RT-PCR, que foram conduzidas utilizando kits comerciais, em diferentes combinações de oligonucleotídeos. Os produtos das amplificações foram clonados e encaminhados ao sequenciamento. Foram sequenciados e caracterizados sete isolados, sendo cinco provenientes do feijão caupi e dois do maracujá, e estes corresponderam a uma sequência de 838 nucleotídeos que codificam parte da proteína de Inclusão Cilíndrica (CI) e a sequência parcial do gene da proteína 6K2. As sequências de aminoácidos e nucleotídeos revelaram identidade elevada, variando de 91 a 99% e 84 a 99% respectivamente, demonstrando uma baixa variabilidade genética entre os isolados deste estudo.The occurrence of pests and diseases is presented as one of the main problems the diverse cultures of great agronomic importance. In passion, the fruit woodiness virus and cowpea, cowpea mosaic, viruses are the most important in the world, causing great financial losses. Are caused by Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV). In passionfruit etiologic agent was named Passionfruit woodiness virus (PWV), genus Potyvirus, and later it was discovered that two more species of the same genus were causing the same disease, the Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV) and East Asian Passiflora virus (EAPV). In Brazil, recent studies have indicated the CABMV be prevalent as the virus that causes this disease. Given this scenario, the present work was to study the genetic variability of different isolates of CABMV that infect cultures of cowpea and passion fruit in different producing regions of Brazil. Total RNA was extracted using the TRIZOL (Invitrogen) and used in the synthesis of viral cDNA through RT-PCR reactions that were conducted using commercial kits, for different combinations of oligonucleotides. The products of amplification were cloned and sent to sequencing. Were sequenced and characterized seven isolates, five cowpea and from the two passion fruit, and these corresponded to a sequence of 838 nucleotides encoding part of the protein Insertion Cylindrical (CI) and partial sequence of the protein gene 6K2. The nucleotide and amino acid sequences revealed high identity, ranging from 91 to 99% and 84-99% respectively, showing a low genetic variability among isolates of this study.porUniversidade Federal do Recôncavo da BahiaUFRBBrasilCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e BiológicasCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETALCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALCowpea afhid-borne mosaic virus - (CABMV)PassionfruitCowpeaGenetic variabilityCowpea afhid-borne mosaic virus (CABMV)MaracujáFeijão-caupiVariabilidade genéticaCaracterização molecular de isolados do Cowpea aphid borne mosaic virus que infectam maracujazeiro (Passiflora spp.) e feijão-caupi (Vigna unguiculata)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisBachareladoSouza, Jorge Teodoro deAbreu, Emanuel Felipe MedeirosBarbosa, Cristiane de JesusOliveira, Saulo Alves Santos deBarbosa, Alessandra Oliveirainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRBinstname:Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)instacron:UFRBORIGINALCaracterizacao_Molecular_Isolados_Cowpea_TCC_2012.pdfCaracterizacao_Molecular_Isolados_Cowpea_TCC_2012.pdfapplication/pdf968665http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2281/1/Caracterizacao_Molecular_Isolados_Cowpea_TCC_2012.pdff21bfc328dcd59adafec4a07ef92e243MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81930http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2281/2/license.txt17dd64d7a271c2bbd8e88fd80624d4a1MD52123456789/22812023-05-16 14:30:51.951oai:ri.ufrb.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufrb.edu.br/oai/requestnutin.cidoc@proplan.ufrb.edu.bropendoar:27582023-05-16T17:30:51Repositório Institucional da UFRB - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)false |
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Caracterização molecular de isolados do Cowpea aphid borne mosaic virus que infectam maracujazeiro (Passiflora spp.) e feijão-caupi (Vigna unguiculata) Barbosa, Alessandra Oliveira CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETAL CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL Cowpea afhid-borne mosaic virus (CABMV) Maracujá Feijão-caupi Variabilidade genética Cowpea afhid-borne mosaic virus - (CABMV) Passionfruit Cowpea Genetic variability |
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