Dissimilaridade genética em cinco cultivares de Ricinus communis L. através de marcadores RAPD
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRB |
Texto Completo: | http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2300 |
Resumo: | A mamoneira é uma oleaginosa de grande importância econômica. No Brasil é uma planta típica de região semi-árida, representando no Nordeste 90% da área plantada. A grande variabilidade apresentada por esta cultura é observada em características botânicas e agronômicas podendo ser avaliada, também, através de polimorfismo de DNA, com o emprego de marcadores moleculares, tais como RAPD. A técnica de marcadores de DNA, conhecida como RAPD, tem sido usada para estimar a diversidade genética aumentando a eficiência dos programas de melhoramento genético. Sendo assim, o presente estudo objetivou a utilização de marcadores RAPD para fins da avaliação da dissimilaridade genética entre cinco cultivares de mamoneira . Para tanto, DNA total foi extraído e quantificado do tecido foliar Ricinus communis L. Um total de vinte primers aleatórios foi usado na genotipagem das cultivares. Por se tratar de um marcador dominante, a leitura se deu por (0) ausência ou (1) presença de banda no gel de agarose 1,5%. Foi identificado um total de 202 marcadores, sendo 74 polimórficos (36,6%) e 128 monomórficos (63,4%). O primer OPD 05 gerou 18 bandas (o maior número entre os iniciadores utilizados) e o primer OPD 03, apenas 5. A dissimilaridade genética entre as cultivares foi calculada a partir do coeficiente de Jaccard utilizando-se o método de agrupamento UPGMA com auxílio do programa GENE. Um dendograma foi gerado a partir do Programa MEGA4. Através das análises, foi possível observar a formação de dois grandes grupos: GRUPO I formado pelas cultivares EBDA MPA 17, EBDA MPA 18, EBDA MPA 26 e EBDA MPA 31 e o GRUPO II constituído pela cultivar EBDA MPA 11. As cultivares EBDA MPA 11 e EBDA MPA 26 foram as mais divergentes. Assim, observa-se que há divergência genética entre as cultivares avaliadas. As combinações promissoras são esperadas entre as cultivares EBDA MPA 11 e EBDA MPA 26. Os marcadores moleculares do tipo RAPD são eficientes para caracterizar a variabilidade genética existente entre genótipos de mamona. |
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2023-05-16T19:11:14Z2023-05-16T19:11:14Z2010-12-17http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2300A mamoneira é uma oleaginosa de grande importância econômica. No Brasil é uma planta típica de região semi-árida, representando no Nordeste 90% da área plantada. A grande variabilidade apresentada por esta cultura é observada em características botânicas e agronômicas podendo ser avaliada, também, através de polimorfismo de DNA, com o emprego de marcadores moleculares, tais como RAPD. A técnica de marcadores de DNA, conhecida como RAPD, tem sido usada para estimar a diversidade genética aumentando a eficiência dos programas de melhoramento genético. Sendo assim, o presente estudo objetivou a utilização de marcadores RAPD para fins da avaliação da dissimilaridade genética entre cinco cultivares de mamoneira . Para tanto, DNA total foi extraído e quantificado do tecido foliar Ricinus communis L. Um total de vinte primers aleatórios foi usado na genotipagem das cultivares. Por se tratar de um marcador dominante, a leitura se deu por (0) ausência ou (1) presença de banda no gel de agarose 1,5%. Foi identificado um total de 202 marcadores, sendo 74 polimórficos (36,6%) e 128 monomórficos (63,4%). O primer OPD 05 gerou 18 bandas (o maior número entre os iniciadores utilizados) e o primer OPD 03, apenas 5. A dissimilaridade genética entre as cultivares foi calculada a partir do coeficiente de Jaccard utilizando-se o método de agrupamento UPGMA com auxílio do programa GENE. Um dendograma foi gerado a partir do Programa MEGA4. Através das análises, foi possível observar a formação de dois grandes grupos: GRUPO I formado pelas cultivares EBDA MPA 17, EBDA MPA 18, EBDA MPA 26 e EBDA MPA 31 e o GRUPO II constituído pela cultivar EBDA MPA 11. As cultivares EBDA MPA 11 e EBDA MPA 26 foram as mais divergentes. Assim, observa-se que há divergência genética entre as cultivares avaliadas. As combinações promissoras são esperadas entre as cultivares EBDA MPA 11 e EBDA MPA 26. Os marcadores moleculares do tipo RAPD são eficientes para caracterizar a variabilidade genética existente entre genótipos de mamona.Castor beean is an oilseed of great economic importance. This plant in Brazil is a typical plant from the semi-arid region, whis represents 90% Northeast of the planted area. The great variability shown by this crop is seen in botanical and agronomic characteristics and can be also evaluated by DNA polymorphism, with the use of molecular markers such as RAPD. The technique of DNA markers, known as RAPD, has been used to estimate genetic diversity by increasing the efficiency in breeding programs. Thus, this study aimed to RAPD markers for assessing the genetic dissimilary vergence among five cultivars of castor beans. Ofel DNA was extracted and quantified from Ricinus communis L. Leaf tissue a total of twenty random primers were used for genotiping cultivars. Since it is a dominant marker, bands were by (0) given (1) for presence a 1.5% agarose gel. We a total of 202 markers (74 polymorphic (36.6%) and 128 monomorphic (63.4%) bands). Werk The OPD 05 primer generated 18 bands, the largest number among the initiators used, and the primer OPD 03, only 5. The genetic cliss between cultivars was calculated using the Jaccard's coefficient UPGMA clustering method and the GENE software. A dendrogram was generated by the MEGA4 Program. Chemical analysis identificd the formation of two groups: using Group I, formed by cultivars EBDA MPA 17, MPA 18 EBDA, EBDA EBDA and MPA 26 MPA 31 and group II consisting of 11 cultivars EBDA MPA. Cultivars EBDA EBDA MPA MPA 11 and 26 were the most dissimilaridad. Thus, it is observed that there is among cultivars. Promising combinations are expected between cultivars EBDA EBDA MPA 11 and MPA 26. Molecular markers such as RAPD are effective to characterize the genetic variability among castor genotypes.porUniversidade Federal do Recôncavo da BahiaUFRBBrasilCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e BiológicasCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETALCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALRicinus communisRAPD markersGenetic diversityRicinus communisMarcadores RAPDDivergência genéticaDissimilaridade genética em cinco cultivares de Ricinus communis L. através de marcadores RAPDinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisBachareladoMachado, Edna LoboMoreira, Ricardo Franco CunhaFonteles, Soraia Barreto AguiarBastos, Leila Andradeinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRBinstname:Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)instacron:UFRBORIGINALDissimilaridade_Genetica_Cinco_TCC_2010.pdfDissimilaridade_Genetica_Cinco_TCC_2010.pdfapplication/pdf1737030http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2300/1/Dissimilaridade_Genetica_Cinco_TCC_2010.pdf25f81d69143b4d05f599b5343603ea25MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81930http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2300/2/license.txt17dd64d7a271c2bbd8e88fd80624d4a1MD52123456789/23002023-05-16 16:11:14.654oai:ri.ufrb.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufrb.edu.br/oai/requestnutin.cidoc@proplan.ufrb.edu.bropendoar:27582023-05-16T19:11:14Repositório Institucional da UFRB - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)false |
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