Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nóbrega, L.M.M.
Data de Publicação: 2016
Outros Autores: Montagner, Francisco, Ribeiro, A.C., Mayer, Marcia Pinto Alves, Gomes, Brenda Paula Figueiredo de Almeida
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/147393
Resumo: O objetivo deste estudo foi investigar a composição bacteriana de canais radiculares associados com abscesso apical agudo através de identificação molecular (16S rRNA) de bactérias cultiváveis. Duzentas e vinte cepas, de 20 casos, isoladas por cultura foram submetidas a extração de DNA e amplificação do gene 16S rRNA (PCR), seguido de sequenciamento. As sequências de nucleotídeos obtidas foram comparadas com o banco de dados (GenBank) do National Center of Biotechnology Information através do BLAST. Cepas não identificadas pelo sequenciamento foram submetidas à clonagem. Associação de achados microbiológicos e características clínicas e associação entre espécies bacterianas também foram investigadas. Cinquenta e nove bactérias cultiváveis diferentes foram identificadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA, pertencentes a 6 filos, numa média de 6 espécies por canal. Método molecular permitiu identificação de 99% das cepas isoladas. As bactérias mais frequentes foram Prevotella spp., Pseudoramibacter alactolyticus, Parvimonas micra, Dialister invisus, Filifactor alocis, Peptostreptococcus stomatis. Associação positiva foi encontrada entre Prevotella buccae e Pseudoramibacter alactolyticus, e entre Parvimonas micra e Prevotella nigrescens (p<0,05). Foi concluído que a microbiota de canais radiculares infectados associados com abscesso apical agudo é diversa e heterogênea, composta principalmente por anaeróbios Gram-negativos, pertencentes aos filos Firmicutes e Bacteroidetes.
id UFRGS-2_216b1e483b7b8d0858e7bbe0de601c9f
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/147393
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Nóbrega, L.M.M.Montagner, FranciscoRibeiro, A.C.Mayer, Marcia Pinto AlvesGomes, Brenda Paula Figueiredo de Almeida2016-08-19T02:16:21Z20160103-6440http://hdl.handle.net/10183/147393000994329O objetivo deste estudo foi investigar a composição bacteriana de canais radiculares associados com abscesso apical agudo através de identificação molecular (16S rRNA) de bactérias cultiváveis. Duzentas e vinte cepas, de 20 casos, isoladas por cultura foram submetidas a extração de DNA e amplificação do gene 16S rRNA (PCR), seguido de sequenciamento. As sequências de nucleotídeos obtidas foram comparadas com o banco de dados (GenBank) do National Center of Biotechnology Information através do BLAST. Cepas não identificadas pelo sequenciamento foram submetidas à clonagem. Associação de achados microbiológicos e características clínicas e associação entre espécies bacterianas também foram investigadas. Cinquenta e nove bactérias cultiváveis diferentes foram identificadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA, pertencentes a 6 filos, numa média de 6 espécies por canal. Método molecular permitiu identificação de 99% das cepas isoladas. As bactérias mais frequentes foram Prevotella spp., Pseudoramibacter alactolyticus, Parvimonas micra, Dialister invisus, Filifactor alocis, Peptostreptococcus stomatis. Associação positiva foi encontrada entre Prevotella buccae e Pseudoramibacter alactolyticus, e entre Parvimonas micra e Prevotella nigrescens (p<0,05). Foi concluído que a microbiota de canais radiculares infectados associados com abscesso apical agudo é diversa e heterogênea, composta principalmente por anaeróbios Gram-negativos, pertencentes aos filos Firmicutes e Bacteroidetes.The objective of this study was to investigate the bacterial composition present in root canals of teeth associated with acute apical abscess by molecular identification (16S rRNA) of cultivable bacteria. Two hundred and twenty strains isolated by culture from 20 root canals were subjected to DNA extraction and amplification of the 16S rRNA gene (PCR), followed by sequencing. The resulting nucleotide sequences were compared to the GenBank database from the National Center of Biotechnology Information through BLAST. Strains not identified by sequencing were submitted to clonal analysis. The association of microbiological findings with clinical features and the association between microbial species were also investigated. Fifty-nine different cultivable bacteria were identified by 16S rRNA gene sequencing, belonging to 6 phyla, with an average number of 6 species per root canal. Molecular approaches allowed identification of 99% of isolates. The most frequently identified bacteria were Prevotella spp., Pseudoramibacter alactolyticus, Parvimonas micra, Dialister invisus, Filifactor alocis, and Peptostreptococcus stomatis. Positive association was found between Prevotella buccae and Pseudoramibacter alactolyticus and between Parvimonas micra and Prevotella nigrescens (both p<0.05). It was concluded that the microbiota of infected root canals associated with acute apical abscess is diverse and heterogeneous, composed mainly of anaerobic Gram-negative bacteria, with the great majority belonging to the phyla Firmicutes and Bacteroidetes.application/pdfengBrazilian dental journal. Ribeirão Preto. Vol. 27, no. 3 (June 2016), p. 318-324EndodontiaBactériasCanais radiculares : BacteriologiaRoot canalsEndodonticsMicroorganismsAbscessSequencingMolecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscessinfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000994329.pdf000994329.pdfTexto completo (inglês)application/pdf181196http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/1/000994329.pdf64ef120e36492845655662b8b6de0023MD51TEXT000994329.pdf.txt000994329.pdf.txtExtracted Texttext/plain36268http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/2/000994329.pdf.txt60a6ca45f1e7ebf2432de7bbb479e8b4MD52THUMBNAIL000994329.pdf.jpg000994329.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2094http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/3/000994329.pdf.jpgf43cff7308c028a4bf354407ac53cfc5MD5310183/1473932018-10-29 08:36:49.662oai:www.lume.ufrgs.br:10183/147393Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2018-10-29T11:36:49Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
title Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
spellingShingle Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
Nóbrega, L.M.M.
Endodontia
Bactérias
Canais radiculares : Bacteriologia
Root canals
Endodontics
Microorganisms
Abscess
Sequencing
title_short Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
title_full Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
title_fullStr Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
title_full_unstemmed Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
title_sort Molecular identification of cultivable bacteria from infected root canals associated with acute apical abscess
author Nóbrega, L.M.M.
author_facet Nóbrega, L.M.M.
Montagner, Francisco
Ribeiro, A.C.
Mayer, Marcia Pinto Alves
Gomes, Brenda Paula Figueiredo de Almeida
author_role author
author2 Montagner, Francisco
Ribeiro, A.C.
Mayer, Marcia Pinto Alves
Gomes, Brenda Paula Figueiredo de Almeida
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Nóbrega, L.M.M.
Montagner, Francisco
Ribeiro, A.C.
Mayer, Marcia Pinto Alves
Gomes, Brenda Paula Figueiredo de Almeida
dc.subject.por.fl_str_mv Endodontia
Bactérias
Canais radiculares : Bacteriologia
topic Endodontia
Bactérias
Canais radiculares : Bacteriologia
Root canals
Endodontics
Microorganisms
Abscess
Sequencing
dc.subject.eng.fl_str_mv Root canals
Endodontics
Microorganisms
Abscess
Sequencing
description O objetivo deste estudo foi investigar a composição bacteriana de canais radiculares associados com abscesso apical agudo através de identificação molecular (16S rRNA) de bactérias cultiváveis. Duzentas e vinte cepas, de 20 casos, isoladas por cultura foram submetidas a extração de DNA e amplificação do gene 16S rRNA (PCR), seguido de sequenciamento. As sequências de nucleotídeos obtidas foram comparadas com o banco de dados (GenBank) do National Center of Biotechnology Information através do BLAST. Cepas não identificadas pelo sequenciamento foram submetidas à clonagem. Associação de achados microbiológicos e características clínicas e associação entre espécies bacterianas também foram investigadas. Cinquenta e nove bactérias cultiváveis diferentes foram identificadas pelo sequenciamento do gene 16S rRNA, pertencentes a 6 filos, numa média de 6 espécies por canal. Método molecular permitiu identificação de 99% das cepas isoladas. As bactérias mais frequentes foram Prevotella spp., Pseudoramibacter alactolyticus, Parvimonas micra, Dialister invisus, Filifactor alocis, Peptostreptococcus stomatis. Associação positiva foi encontrada entre Prevotella buccae e Pseudoramibacter alactolyticus, e entre Parvimonas micra e Prevotella nigrescens (p<0,05). Foi concluído que a microbiota de canais radiculares infectados associados com abscesso apical agudo é diversa e heterogênea, composta principalmente por anaeróbios Gram-negativos, pertencentes aos filos Firmicutes e Bacteroidetes.
publishDate 2016
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-08-19T02:16:21Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2016
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/other
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/147393
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 0103-6440
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000994329
identifier_str_mv 0103-6440
000994329
url http://hdl.handle.net/10183/147393
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv Brazilian dental journal. Ribeirão Preto. Vol. 27, no. 3 (June 2016), p. 318-324
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/1/000994329.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/2/000994329.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/147393/3/000994329.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 64ef120e36492845655662b8b6de0023
60a6ca45f1e7ebf2432de7bbb479e8b4
f43cff7308c028a4bf354407ac53cfc5
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801224907065917440