Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: John, Elisa Beatriz de Oliveira
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/126838
Resumo: Paredes celulares de plantas são estruturas complexas e dinâmicas, compostas principalmente por polissacarídeos e glicoproteínas. As glicoproteínas ricas em hidroxiprolina (HRGP), por exemplo, são encontradas nas paredes celulares de plantas e algas verdes, relacionando-se ao crescimento e desenvolvimento vegetal. A formação pós-traducional de hidroxiprolina nestas proteínas é catalisada pelas prolil-4-hidroxilases (P4H) que oxidam repetições do tipo PPPP, assim, também assumem papel importante no desenvolvimento das plantas. Em Arabidopsis thaliana, existem pelo menos 13 tipos de P4Hs com diferentes perfis de expressão, sendo P4H5, P4H2 e P4H13 os mais expressos em pelos radiculares, estruturas das plantas com um papel importante para a absorção de nutrientes. Neste contexto, o presente trabalho buscou caracterizar a complexação de P4Hs a uma HRPG denominada extensina (EXT), particularmente a preferência sobre os resíduos de prolina nas repetições PPPP, empregando técnicas de modelagem comparativa e dinâmica molecular. Os resultados obtidos indicaram um importante efeito estabilizador da EXT sobre P4H5. Adicionalmente, foram encontradas áreas de maior mobilidade na enzima, como uma alça que cobre o sítio catalítico e parece estar envolvida no acesso do substrato ao sítio ativo. Ainda, certos resíduos de prolina parecem estar em posições preferenciais para a catálise, uma vez que o comportamento conformacional da enzima P4H5 é modificado conforme diferentes resíduos de prolina da repetição PPPP são alinhados ao sítio catalítico da enzima.
id UFRGS-2_33862c9048b82b6b0e319c901f550711
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/126838
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling John, Elisa Beatriz de OliveiraVerli, Hugo2015-09-16T01:57:10Z2014http://hdl.handle.net/10183/126838000972322Paredes celulares de plantas são estruturas complexas e dinâmicas, compostas principalmente por polissacarídeos e glicoproteínas. As glicoproteínas ricas em hidroxiprolina (HRGP), por exemplo, são encontradas nas paredes celulares de plantas e algas verdes, relacionando-se ao crescimento e desenvolvimento vegetal. A formação pós-traducional de hidroxiprolina nestas proteínas é catalisada pelas prolil-4-hidroxilases (P4H) que oxidam repetições do tipo PPPP, assim, também assumem papel importante no desenvolvimento das plantas. Em Arabidopsis thaliana, existem pelo menos 13 tipos de P4Hs com diferentes perfis de expressão, sendo P4H5, P4H2 e P4H13 os mais expressos em pelos radiculares, estruturas das plantas com um papel importante para a absorção de nutrientes. Neste contexto, o presente trabalho buscou caracterizar a complexação de P4Hs a uma HRPG denominada extensina (EXT), particularmente a preferência sobre os resíduos de prolina nas repetições PPPP, empregando técnicas de modelagem comparativa e dinâmica molecular. Os resultados obtidos indicaram um importante efeito estabilizador da EXT sobre P4H5. Adicionalmente, foram encontradas áreas de maior mobilidade na enzima, como uma alça que cobre o sítio catalítico e parece estar envolvida no acesso do substrato ao sítio ativo. Ainda, certos resíduos de prolina parecem estar em posições preferenciais para a catálise, uma vez que o comportamento conformacional da enzima P4H5 é modificado conforme diferentes resíduos de prolina da repetição PPPP são alinhados ao sítio catalítico da enzima.application/pdfporProlil hidroxilasesHidroxiprolinaParede celularEnzimasBiologia estrutural de prolil-4-hidroxilasesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de Ciências Básicas da SaúdePorto Alegre, BR-RS2014Biomedicinagraduaçãoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000972322.pdf000972322.pdfTexto completoapplication/pdf1075368http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/1/000972322.pdf8789b6da69f11479a0a7aeb5172c56a8MD51TEXT000972322.pdf.txt000972322.pdf.txtExtracted Texttext/plain73251http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/2/000972322.pdf.txt548226a90a2bbc3fd9af66393644c7e4MD52THUMBNAIL000972322.pdf.jpg000972322.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1012http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/3/000972322.pdf.jpg83489d10aeb0f0bdc8c25125ed6587b8MD5310183/1268382023-07-12 03:34:30.121056oai:www.lume.ufrgs.br:10183/126838Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2023-07-12T06:34:30Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
title Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
spellingShingle Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
John, Elisa Beatriz de Oliveira
Prolil hidroxilases
Hidroxiprolina
Parede celular
Enzimas
title_short Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
title_full Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
title_fullStr Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
title_full_unstemmed Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
title_sort Biologia estrutural de prolil-4-hidroxilases
author John, Elisa Beatriz de Oliveira
author_facet John, Elisa Beatriz de Oliveira
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv John, Elisa Beatriz de Oliveira
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Verli, Hugo
contributor_str_mv Verli, Hugo
dc.subject.por.fl_str_mv Prolil hidroxilases
Hidroxiprolina
Parede celular
Enzimas
topic Prolil hidroxilases
Hidroxiprolina
Parede celular
Enzimas
description Paredes celulares de plantas são estruturas complexas e dinâmicas, compostas principalmente por polissacarídeos e glicoproteínas. As glicoproteínas ricas em hidroxiprolina (HRGP), por exemplo, são encontradas nas paredes celulares de plantas e algas verdes, relacionando-se ao crescimento e desenvolvimento vegetal. A formação pós-traducional de hidroxiprolina nestas proteínas é catalisada pelas prolil-4-hidroxilases (P4H) que oxidam repetições do tipo PPPP, assim, também assumem papel importante no desenvolvimento das plantas. Em Arabidopsis thaliana, existem pelo menos 13 tipos de P4Hs com diferentes perfis de expressão, sendo P4H5, P4H2 e P4H13 os mais expressos em pelos radiculares, estruturas das plantas com um papel importante para a absorção de nutrientes. Neste contexto, o presente trabalho buscou caracterizar a complexação de P4Hs a uma HRPG denominada extensina (EXT), particularmente a preferência sobre os resíduos de prolina nas repetições PPPP, empregando técnicas de modelagem comparativa e dinâmica molecular. Os resultados obtidos indicaram um importante efeito estabilizador da EXT sobre P4H5. Adicionalmente, foram encontradas áreas de maior mobilidade na enzima, como uma alça que cobre o sítio catalítico e parece estar envolvida no acesso do substrato ao sítio ativo. Ainda, certos resíduos de prolina parecem estar em posições preferenciais para a catálise, uma vez que o comportamento conformacional da enzima P4H5 é modificado conforme diferentes resíduos de prolina da repetição PPPP são alinhados ao sítio catalítico da enzima.
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-09-16T01:57:10Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/126838
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000972322
url http://hdl.handle.net/10183/126838
identifier_str_mv 000972322
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/1/000972322.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/2/000972322.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/126838/3/000972322.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 8789b6da69f11479a0a7aeb5172c56a8
548226a90a2bbc3fd9af66393644c7e4
83489d10aeb0f0bdc8c25125ed6587b8
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1815447152928751616