Estimação da probabilidade de mutação através da história familiar

• Autor(a) principal: Schneider, Silvana
• Data de Publicação: 2010
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/29096
• topic: Estatistica : Medicina : Aplicacao; Estatística : Genética : Aplicação

As mutações em genes são necessárias para gerar diversidade, porém muitas estão associadas a doenças genéticas herdadas, e as que ocorrem em células somáticas são fontes de muitos cânceres humanos (Griffiths, 2008). Em 2007 foram listadas um pouco mais de 3.900 doenças com padrões mendelianos de herança, sendo que 85% delas são conhecidas por serem causadas por mutações em mais de 1.990 genes (Nussbaum, 2008). A presença de mutações nesses genes proporciona um aumento do número de casos da doença em síndromes específicas e em grupos de fenótipos (Chen, 2004), e, sabe-se que a característica singular da doença genética é sua tendência a recorrer dentro das famílias (Griffiths, 2008). Portanto, diante do que foi exposto, somado ao custo elevado do teste genético para as mutações germinativas (por exemplo, para o gene BRCA1 é de R$ 7.600, Fleury Medicina e Saúde, 2010), existe a necessidade de se obter a probabilidade de mutação através da história familiar do probando (Parmigiani, 1998). A probabilidade inicial de um indivíduo ser portador da mutação no gene em estudo é a estimativa da frequência populacional da mutação no gene. Aplicando-se a fórmula de Bayes e o teorema da probabilidade total à história familiar do indivíduo, a probabilidade dele possuir mutação dado a sua história familiar pode ser obtida. Foram criadas funções em linguagem de programação R para que essa probabilidade pudesse ser calculada. A motivação deste trabalho foi poder calcular a probabilidade de mutação dos genes que estão mais associados ao Câncer de Mama (CM), BRCA1 e BRCA2, cujos valores estão em um exemplo apresentado. Os cálculos foram feitos para incorporar a informação de dois genes, mas as fórmulas podem ser estendidas para mais genes ou para apenas um.