Análise metagenômica do viroma de tonsilas de búfalos da Ilha de Marajó, Pará

• Autor(a) principal: Timm, Francine Cezar Bandeira
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/251604
• topic: Sequenciamento completo do genoma; Búfalos; Viroma; Polyomavirus; Metagenômica

Dado o potencial da criação de búfalos domésticos (Bubalus bubalis) e seu crescimento recente no Brasil, nosso grupo tem focado suas atenções no estudo do viroma de bubalinos da região norte do Brasil, região que possui o maior rebanho dessa espécie no País. Como parte desse projeto, no presente trabalho foi realizada uma análise metagenômica para avaliar a diversidade viral em tonsilas palatinas de búfalos domésticos de diferentes fazendas da ilha de Marajó, Pará. Fragmentos de tonsilas de 60 bubalinos foram selecionados aleatoriamente a partir de uma amostragem de 302 animais. Genomas virais foram purificados, extraídos e amplificados randomicamente com DNA polimerase do fago phi29. Após a amplificação, os produtos foram purificados e sequenciados através da plataforma Illumina. Após a montagem de reads, os contigs virais foram submetidos ao alinhamento usando a ferramenta BLAST+. Vírus de DNA circular foram predominantes no viroma, incluindo um genoma de poliomavírus bubalino não previamente reportado. Além disso, sequências de segmentos de genomas virais representativos de membros dos gêneros Alphapolyomavirus, Gammaretrovirus, Gemykibivirus, Gemykrogvirus e Porprismacovirus foram identificados, além de outros genomas de vírus circulares ainda não classificados. Estudos futuros serão realizados para aprimorar e aprofundar o conhecimento sobre o viroma e microbioma bubalino, permitindo um melhor entendimento sobre interações vírus-hospedeiro, bem como examinar o papel de vírus bubalinos como potenciais agentes de patologias em outras espécies, incluindo o homem.