Análise genômica e perfil de virulência de Escherichia coli endometrial patogênica (EnPEC)

• Autor(a) principal: Lopes, Cassiane Elisabete
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/249493
• topic: Fatores de virulência; Resistência a antimicrobianos; Escherichia coli; Piometra; E. coli; Pyometra; Virulence profile; Pathogenicity; Genomic sequencing; Pets

A piometra é uma infecção do trato reprodutivo frequentemente diagnosticada na rotina clínica de animais de companhia. A patogênese da infecção ainda é pouco compreendida, porém fatores hormonais e a virulência bacteriana parecem ser importantes para o desenvolvimento da enfermidade. Escherichia coli endometrial patogênica (EnPEC) é o agente bacteriano mais comumente isolado de piometra em cadelas e gatas, no entanto esse patotipo é o menos estudado dentre o grupo de E. coli extraintestinais patogênicas (ExPEC). Estudos anteriores apontam que isolados de E. coli de piometra originam-se da microbiota intestinal e possuem genes de virulência normalmente encontrados em E. coli uropatogênicas (UPEC). Portanto, o objetivo desse trabalho é compreender o perfil de virulência de EnPECs para melhor caracterizar a patogenicidade desse patotipo. Para isso, o primeiro sequenciamento de genoma de um isolado EnPEC (E. coli_LBV005/17) foi realizado e o genoma analisado. A partir disso, genes de virulência foram selecionados e buscados em uma coleção de 45 isolados de EnPEC, sendo os mesmos também atribuídos aos filo-grupos de Clermont empregando-se a técnica de PCR multiplex. Ademais, o perfil de susceptibilidade dos isolados foi determinando pela técnica de disco-difusão em ágar. Uma ampla gama de genes de virulência, não apenas relacionados à UPEC, mas também à E. coli intestinais, foram identificados no genoma analisado. Interessantemente, a análise de MLST in silico classificou o isolado E. coli_LBV005/17 como E. coli ST131, um clone pandêmico multirresistente. Tanto o isolado E. coli_LBV005/17, quanto a maioria dos isolados EnPEC (68,8%) foram incluídos no filo-grupo B2 de Clermont. Dentre o perfil de virulência dos isolados testados, podemos destacar o gene fimA, como o mais frequente relacionado à adesão (98%); a presença dos genes codificantes de toxinas artA e cdtA, pela primeira vez relatados em isolados EnPEC; e a ampla distribuição do sistema de captação de ferro por enterobactina. Com relação à resistência antimicrobiana, apenas cinco isolados (11%) exibiram resistência múltipla in vitro, embora E. coli_LBV005/17 seja um isolado multirresistente. Por fim, os resultados demonstram o forte potencial patogênico de EnPEC e lançam alguns esclarecimentos e possibilidades para a melhor caracterização da patogenicidade desse patotipo.