Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2007 |
Outros Autores: | , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/129224 |
Resumo: | Foi avaliado um método baseado em PCR do gene do RNAr 16S, desenvolvido com a finalidade de um diagnóstico molecular rápido na identificação das espécies filogeneticamente relacionadas Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii, isoladas de nódulos de soja, visando ao seu emprego na identificação de estirpes mais competitivas e com maior capacidade de fixação de nitrogênio para uso na formulação de inoculantes comerciais. O método usado foi capaz de discriminar dez estirpes-padrão pertencentes a essas duas espécies de Bradyrhizobium, assim como identificar eficientemente 37 estirpes isoladas de lavouras cultivadas com soja. |
id |
UFRGS-2_768cf7c06133df26a4caebd213ade28d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:www.lume.ufrgs.br:10183/129224 |
network_acronym_str |
UFRGS-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFRGS |
repository_id_str |
|
spelling |
Giongo, AdrianaSilveira, Adriana Ambrosini daFreire, Joao Ruy JardimBodanese-Zanettini, Maria HelenaPassaglia, Luciane Maria Pereira2015-11-09T16:30:34Z20070100-204Xhttp://hdl.handle.net/10183/129224000613464Foi avaliado um método baseado em PCR do gene do RNAr 16S, desenvolvido com a finalidade de um diagnóstico molecular rápido na identificação das espécies filogeneticamente relacionadas Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii, isoladas de nódulos de soja, visando ao seu emprego na identificação de estirpes mais competitivas e com maior capacidade de fixação de nitrogênio para uso na formulação de inoculantes comerciais. O método usado foi capaz de discriminar dez estirpes-padrão pertencentes a essas duas espécies de Bradyrhizobium, assim como identificar eficientemente 37 estirpes isoladas de lavouras cultivadas com soja.A 16S rRNA gene PCR-based assay was developed aiming at a fast molecular diagnostic method to differentiate the two phylogenetically closely related species Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii, isolated from soybean nodules, in order to identify those more competitive and comprising greater nitrogen fixation ability for use in the formulation of commercial inoculants. The assay used was able to discriminate ten reference strains belonging to these two Bradyrhizobium species, as well as to efficiently identify 37 strains isolated from fields cultivated with soybean.application/pdfporPesquisa Agropecuária Brasileira: 1977. Brasília. Vol. 42, n. 9 (set. 2007), p. 1361-1364Reação em cadeia da polimeraseBradyrhizobium japonicumBradyrhizobium elkaniidiversidade de rizóbiosinoculantes comerciaisPCRAmplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia speciesinfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT000613464.pdf.txt000613464.pdf.txtExtracted Texttext/plain13823http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/2/000613464.pdf.txt4a13964776fccddccd104bdcedb01c16MD52ORIGINAL000613464.pdf000613464.pdfTexto completoapplication/pdf130350http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/1/000613464.pdfd60b31eeaf38689e52aaad4e1bb02d97MD51THUMBNAIL000613464.pdf.jpg000613464.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1801http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/3/000613464.pdf.jpgb23bad5bebbff7894d648c805537a11cMD5310183/1292242018-10-24 09:12:29.845oai:www.lume.ufrgs.br:10183/129224Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2018-10-24T12:12:29Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
title |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
spellingShingle |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species Giongo, Adriana Reação em cadeia da polimerase Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium elkanii diversidade de rizóbios inoculantes comerciais PCR |
title_short |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
title_full |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
title_fullStr |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
title_full_unstemmed |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
title_sort |
Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species |
author |
Giongo, Adriana |
author_facet |
Giongo, Adriana Silveira, Adriana Ambrosini da Freire, Joao Ruy Jardim Bodanese-Zanettini, Maria Helena Passaglia, Luciane Maria Pereira |
author_role |
author |
author2 |
Silveira, Adriana Ambrosini da Freire, Joao Ruy Jardim Bodanese-Zanettini, Maria Helena Passaglia, Luciane Maria Pereira |
author2_role |
author author author author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Giongo, Adriana Silveira, Adriana Ambrosini da Freire, Joao Ruy Jardim Bodanese-Zanettini, Maria Helena Passaglia, Luciane Maria Pereira |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Reação em cadeia da polimerase Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium elkanii |
topic |
Reação em cadeia da polimerase Bradyrhizobium japonicum Bradyrhizobium elkanii diversidade de rizóbios inoculantes comerciais PCR |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
diversidade de rizóbios inoculantes comerciais PCR |
description |
Foi avaliado um método baseado em PCR do gene do RNAr 16S, desenvolvido com a finalidade de um diagnóstico molecular rápido na identificação das espécies filogeneticamente relacionadas Bradyrhizobium japonicum e B. elkanii, isoladas de nódulos de soja, visando ao seu emprego na identificação de estirpes mais competitivas e com maior capacidade de fixação de nitrogênio para uso na formulação de inoculantes comerciais. O método usado foi capaz de discriminar dez estirpes-padrão pertencentes a essas duas espécies de Bradyrhizobium, assim como identificar eficientemente 37 estirpes isoladas de lavouras cultivadas com soja. |
publishDate |
2007 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2007 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2015-11-09T16:30:34Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/other |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10183/129224 |
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv |
0100-204X |
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv |
000613464 |
identifier_str_mv |
0100-204X 000613464 |
url |
http://hdl.handle.net/10183/129224 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv |
Pesquisa Agropecuária Brasileira: 1977. Brasília. Vol. 42, n. 9 (set. 2007), p. 1361-1364 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFRGS instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) instacron:UFRGS |
instname_str |
Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) |
instacron_str |
UFRGS |
institution |
UFRGS |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFRGS |
collection |
Repositório Institucional da UFRGS |
bitstream.url.fl_str_mv |
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/2/000613464.pdf.txt http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/1/000613464.pdf http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/129224/3/000613464.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
4a13964776fccddccd104bdcedb01c16 d60b31eeaf38689e52aaad4e1bb02d97 b23bad5bebbff7894d648c805537a11c |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1801224889015730176 |