Viroma de mosquitos (Diptera: Culicidae) silvestres da região noroeste do Rio Grande do Sul, Brasil

• Autor(a) principal: Melgarejo, Alanis Silva
• Data de Publicação: 2024
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/274700
• topic: Insetos; Mosquitos; Culicidae; Viroma; Sequenciamento de nova geração; Rio Grande do Sul, Noroeste; Mosquitoes; Virome; High-throughput sequencing

Os mosquitos (Diptera: Culicidae) são vetores de várias arboviroses de importância em saúde pública e possuem uma ampla diversidade de Vírus Específicos de Insetos (ISVs). Porém, há necessidade de mais estudos para compreender e identificar a diversidade viral presente nestes insetos. Logo, a exploração do viroma por meio de metagenômica é fundamental para entender as interações entre vetores/hospedeiros e vírus. Nesse contexto, o presente projeto visa detectar vírus a partir de metagenômica de mosquitos silvestres coletados na região noroeste do Rio Grande do Sul, Brasil. Para isso, 489 mosquitos de diferentes espécies foram coletados em Derrubadas e Santo Antônio das Missões com o apoio do Centro Estadual de Vigilância em Saúde (CEVS). Para este estudo, foi utilizado um n amostral de 90 indivíduos divididos entre as espécies de Psorophora ferox e Culex spp.. Os mosquitos foram identificados, agrupados em pools por espécie com até 30 indivíduos, seguidos de clarificação, filtragem e ultracentrifugação. Os ácidos nucleicos foram extraídos e, posteriormente, as amostras passaram por vários processos de amplificação e enriquecimento em reações com as polimerase Taq e Klenow utilizando primers K-random-s e K-s. O sequenciamento de alto desempenho foi realizado com Illumina Miseq no CDCT e gerou, em média, 342.782 reads, resultando na montagem de 787 contigs. Os pools apresentaram uma média de 82% de reads não classificados, 14% de reads bacterianas, 4% de reads de eucariotos e 1,5% de reads virais. No que tange às reads virais, aproximadamente 80% consistiam em sequências virais não caracterizadas, designadas como "matéria viral escura". Em todos os pools, foram identificadas famílias associadas à contaminação, sendo elas: Retroviridae, Togaviridae, Coronaviridae, Orthoherpesviridae e Poxviridae. Além disso, observou-se uma notável abundância de bacteriófagos, frequentemente detectados em diversos estudos de metagenômica. A média de sequências virais identificadas entre os pools de mosquitos foi de 1,5%, abrangendo as seguintes famílias virais: Dicistroviridae, Microviridae, Narnaviridae, Phenuiviridae, Hypoviridae, Mitoviridae, Nairoviridae, Pospiviroidae e a Ordem Reovirales. Este estudo oferece informações valiosas sobre a diversidade viral em mosquitos, destacando tanto as oportunidades quanto as limitações da metagenômica nesse contexto. O esperado é que esta pesquisa possa servir como um ponto de partida para estudos adicionais e contribuir para a compreensão mais aprofundada das interações entre mosquitos e vírus.