Biologia de sistemas aplicada a possíveis novas associações de múltiplos genes na osteogênese imperfeita

• Autor(a) principal: Pezzi, Eduarda Heidrich
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/239225
• topic: Doenças ósseas; Osteogênese imperfeita; Biologia de sistemas; Osteogenesis imperfecta; Gene; Systems biology

Osteogênese imperfeita (OI) é um grupo de doenças ósseas com heterogeneidade fenotípica e genética. Atualmente, apresenta uma classificação de 21 tipos estando associada à diferentes genes. Acredita-se que ainda existam outros genes e variantes que podem estar associadas a OI. Assim, o objetivo do presente estudo foi buscar associações de múltiplos genes com OI. Foram utilizadas análises de interação de rede, expressão e co-expressão gênica, métodos de bioinformática aplicados a biologia de sistemas para processar os dados. A primeira abordagem realizada com genes relacionados aos principais fenótipos de OI, conforme dados disponíveis no HPO, acabou gerando uma rede de interação muito grande e pouco conclusiva. Seguimos para uma segunda abordagem, em que analisamos a co-expressão gênica de osteoblastos comparada a células mesenquimais. Ao analisar as vias de GO e KEGG dos genes co-expressos já associados à OI se destacaram ontologias de ossificação e vias de adesão focal. Por fim, verificamos a expressão diferencial dos genes em ossos de camundongo. Ao cruzarmos a lista dos genes diferencialmente expressos com os genes relacionados a ossificação e adesão focal encontramos 13 genes presentes em ambos, COL1A1, COL1A2, CREB3L1, MMP2, FBN2, IHH, COL11A2, COL2A1, COL11A1,SOX9, SATB2, PHEX e GLI2. Os três primeiros genes já são associados à OI, no entando, os demais seriam possíveis candidatos a serem associados, sendo necessário estudos in vivo e funcionais para averiguar a hipótese.