História evolutiva de Petunia intergrifolia subsp. depauperata
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2008 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/275348 |
Resumo: | O gênero Petunia Juss (Solanaceae) é endêmico da América do Sul e tem grande importância econômica devido ao seu uso ornamental. A espécie P. integrifolia apresenta uma das maiores distribuições do gênero, estando presente em diferentes regiões. As populações naturais apresentam grande variação nos caracteres florais, vegetativos e no habitat e, por isso, provocam muitas divergências taxonômicas a respeito de sua classificação. Análises genéticas realizadas anteriormente verificaram que a espécie Petunia integrifolia está dividida em dois taxa infra-específicos: Petunia integrifolia subsp. integrifolia e Petunia integrifolia subsp. depauperata, sendo esta característica de ambientes de alta salinidade. Populações de Petunia integrifolia subsp. depauperata estão distribuídas ao longo de toda a Planície Costeira do Rio Grande do Sul e litoral catarinense. Os objetivos deste trabalho foram: estabelecer relações evolutivas e filogeográficas em Petunia integrifolia subsp. depauperata; determinar o grau de variabilidade genética e a dinâmica populacional desta linhagem ao longo de toda a distribuição. Para tanto, o DNA de 190 indivíduos, distribuídos em 56 localidades, foi amplificado por PCR, utilizando primers específicos para os espagadores intergênicos plastidiais trnS-trnG e trnH-psbA. Os produtos de PCR foram seqüenciados automaticamente e as seqüências alinhadas no programa GeneDoc. Os haplótipos foram determinados com o programa DnaSP e suas relações filogenéticas inferidas pelo programa Network. Para avaliar a possibilidade de expansão populacional foram realizados testes de neutralidade utilizando o programa Arlequin. A fim de detectar grupos geograficamente homogêneos, que se diferenciam geneticamente uns dos outros, foram feitas análises no programa SAMOVA. Foram encontrados 16 haplótipos e a network não apresentou uma estruturação geográfica gradual no relacionamento entre eles, mas uma estruturação em três grupos geográficos distintos: Centro, Sul e Norte, que também foram recuperados pela análise com o programa SAMOVA. Os resultados obtidos sugerem que a colonização da Planície Costeira se deu por eventos subseqüentes de ocupação, influenciados pelas oscilações marinhas ocorridas durante o Pleistoceno e o Holoceno. Este cenário de instabilidade ocasionou ondas de extinção com subseqüente expansão e recolonização destas populações na Planície Costeira, de forma que o padrão genético observado atualmente para esta linhagem é resultado destes eventos. |
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Fregonezi, Aline Mitcheli Carvalho RamosFreitas, Loreta Brandão deLorenz-Lemke, Aline Pedroso2024-05-11T06:37:30Z2008http://hdl.handle.net/10183/275348000648714O gênero Petunia Juss (Solanaceae) é endêmico da América do Sul e tem grande importância econômica devido ao seu uso ornamental. A espécie P. integrifolia apresenta uma das maiores distribuições do gênero, estando presente em diferentes regiões. As populações naturais apresentam grande variação nos caracteres florais, vegetativos e no habitat e, por isso, provocam muitas divergências taxonômicas a respeito de sua classificação. Análises genéticas realizadas anteriormente verificaram que a espécie Petunia integrifolia está dividida em dois taxa infra-específicos: Petunia integrifolia subsp. integrifolia e Petunia integrifolia subsp. depauperata, sendo esta característica de ambientes de alta salinidade. Populações de Petunia integrifolia subsp. depauperata estão distribuídas ao longo de toda a Planície Costeira do Rio Grande do Sul e litoral catarinense. Os objetivos deste trabalho foram: estabelecer relações evolutivas e filogeográficas em Petunia integrifolia subsp. depauperata; determinar o grau de variabilidade genética e a dinâmica populacional desta linhagem ao longo de toda a distribuição. Para tanto, o DNA de 190 indivíduos, distribuídos em 56 localidades, foi amplificado por PCR, utilizando primers específicos para os espagadores intergênicos plastidiais trnS-trnG e trnH-psbA. Os produtos de PCR foram seqüenciados automaticamente e as seqüências alinhadas no programa GeneDoc. Os haplótipos foram determinados com o programa DnaSP e suas relações filogenéticas inferidas pelo programa Network. Para avaliar a possibilidade de expansão populacional foram realizados testes de neutralidade utilizando o programa Arlequin. A fim de detectar grupos geograficamente homogêneos, que se diferenciam geneticamente uns dos outros, foram feitas análises no programa SAMOVA. Foram encontrados 16 haplótipos e a network não apresentou uma estruturação geográfica gradual no relacionamento entre eles, mas uma estruturação em três grupos geográficos distintos: Centro, Sul e Norte, que também foram recuperados pela análise com o programa SAMOVA. Os resultados obtidos sugerem que a colonização da Planície Costeira se deu por eventos subseqüentes de ocupação, influenciados pelas oscilações marinhas ocorridas durante o Pleistoceno e o Holoceno. Este cenário de instabilidade ocasionou ondas de extinção com subseqüente expansão e recolonização destas populações na Planície Costeira, de forma que o padrão genético observado atualmente para esta linhagem é resultado destes eventos.The genus Petunia Juss (Solanaceae) is endemic in South America and has great economic importance because of its ornamental use. The specie P. integrifolia presents one of the largest distributions of genus and it is present in different regions. The natural populations show wide variation in floral and vegetative characters, and habitat, and because of this there are many differences concerning their taxonomic classification. Analysis carried out genetic previously found that the species Petunia integrifolia is divided into two taxa infraespecific: Petunia integrifolia subsp. integrifolia e Petunia integrifolia subsp. depauperata. The last one is characteristic of environments of high salinity and distributed throughout the Coastal Plain of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. The aims of this study were: to establish evolutionary and phylogeographyc relationships of Petunia integrifolia subsp. depauperata; to determine the genetic variability and population dynamics throughout of the lineage distribution. The DNA of 190 individuals distributed in 56 localities was amplified by PCR using specific primers from the plastidial intergenic spacers trnS-trnG e trnH-psbA. PCR products were sequenced in automatic sequencer, and the sequences aligned in GeneDoc program. The haplotypes were determined by DnaSP program and their phylogenetic relationships inferred by Network. To evaluate the possibility of population expanding, neutrality tests were performed using the Arlequin pakage. In order to detect geographically homogeneous groups that are differentiated from each other genetically, analyses were made in the SAMOVA program. It found 16 haplotypes and the network did not present a geographic structure gradually in the relationship between the haplotypes, but was structured in three distinct geographic groups: Central, South and North, which also were referred by SAMOVA. Through the results we can infer that the colonization of the Coastal Plain was given by subsequent events of occupation, influenced by fluctuations marine during the Pleistocene and Holocene. This instable scenario produced recurrent extinction and recolonization by these populations in the Coastal Plain, so that the genetic pattern seen today for this lineage is a result of these events.application/pdfporPetunia integrifoliaFilogenéticaHistória evolutiva de Petunia intergrifolia subsp. depauperatainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPorto Alegre, BR-RS2008Ciências Biológicas: Ênfase Molecular, Celular e Funcional: Bachareladograduaçãoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT000648714.pdf.txt000648714.pdf.txtExtracted Texttext/plain93588http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/275348/2/000648714.pdf.txt4b9beeef1f2a6c7541ea802dc06286c4MD52ORIGINAL000648714.pdfTexto completoapplication/pdf9028854http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/275348/1/000648714.pdf9f7d6e1113c35243e18e8037dcdebd21MD5110183/2753482024-05-12 06:42:15.010158oai:www.lume.ufrgs.br:10183/275348Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2024-05-12T09:42:15Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
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