Otimização de um protocolo de fixação e marcação para estudo do Rhodnius prolixus usando microtomografia síncrotron
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/13327 |
Resumo: | Ao longo dos anos, a técnica de microtomografia utilizando luz síncrotron mostrou ser uma ótima ferramenta para o estudo das estruturas internas e externas do Rhodnius prolixus, principal inseto vetor do Tripanossoma cruzi, agente etiológico da Doença de Chagas. No entanto, os primeiros trabalhos mostraram que a visualização de algumas estruturas pode variar com o tipo de feixe utilizado e com a tratamento realizado na amostra. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um protocolo para identificar o melhor tratamento de amostra quanto à fixação e marcação através da avaliação de parâmetros de qualidade de imagem, permitindo assim uma precisa segmentação das estruturas da cabeça do Rhodnius prolixus em dois períodos diferentes da ninfa de 5º estágio (no jejum e na muda). As amostras foram testadas com diferentes tipos de combinações de fixadores e marcadores. A escolha do melhor protocolo foi feita através de análises qualitativas (através da observação das imagens) e quantitativas (através do cálculo de parâmetros de qualidade de imagem, como contraste e razão sinal-ruído). As medidas foram realizadas no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS), Campinas-Brasil, e no Laboratório Síncrotron ELETTRA, Trieste-Itália. |
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Souza, Gabriela Senahttp://lattes.cnpq.br/8303849011697171http://lattes.cnpq.br/1713621191170491Nogueira, Liebert Parreirashttp://lattes.cnpq.br/0959207063786712Barroso, Regina Cély RodriguesGonçalves, Marcos Vinicius ColaçoGonzales, Marcelo SalabertArchilha, Nathaly LopesLima, Alan Miranda Monteiro deBraz, Delson2020-10-23T22:41:53Z2023-11-30T03:01:43Z2019-02http://hdl.handle.net/11422/13327Ao longo dos anos, a técnica de microtomografia utilizando luz síncrotron mostrou ser uma ótima ferramenta para o estudo das estruturas internas e externas do Rhodnius prolixus, principal inseto vetor do Tripanossoma cruzi, agente etiológico da Doença de Chagas. No entanto, os primeiros trabalhos mostraram que a visualização de algumas estruturas pode variar com o tipo de feixe utilizado e com a tratamento realizado na amostra. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um protocolo para identificar o melhor tratamento de amostra quanto à fixação e marcação através da avaliação de parâmetros de qualidade de imagem, permitindo assim uma precisa segmentação das estruturas da cabeça do Rhodnius prolixus em dois períodos diferentes da ninfa de 5º estágio (no jejum e na muda). As amostras foram testadas com diferentes tipos de combinações de fixadores e marcadores. A escolha do melhor protocolo foi feita através de análises qualitativas (através da observação das imagens) e quantitativas (através do cálculo de parâmetros de qualidade de imagem, como contraste e razão sinal-ruído). As medidas foram realizadas no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS), Campinas-Brasil, e no Laboratório Síncrotron ELETTRA, Trieste-Itália.During the years microtomography using synchrotron light technique has proved to be an excellent tool to study the internal and external structures of Rhodnius prolixus, main insect vector of Tripanossoma cruzi, and the etiologic agent of Chagas Disease. However, the first works have shown that the visualization of some structures can vary according to the type of beam and sample treatment. The objective of this work is to develop a protocol to identify the best fixation and staining sample treatment by the evaluation of the image quality parameters, allowing the segmentation of different structures of Rhodnius prolixus in two different periods of 5th instar (unfed and ecdysis). The samples were tested with different combinations of fixatives and staining. The choice of the best protocol was done with qualitative analyses (through the observation of the images) and quantitative analyses (through the calculation of image quality parameters, such as contrast and signal-to-noise ratio). The measurements were performed at the Brazilian Synchrotron Light Source (LNLS), Campinas-Brazil, and at ELETTRA Synchrotron Facility, Trieste-Italy.Submitted by Moreno Barros (moreno@ct.ufrj.br) on 2020-10-23T22:41:53Z No. of bitstreams: 1 GabrielaSenaSouza.pdf: 9114555 bytes, checksum: 5b82c5e0b4b4d864468b51b491cad645 (MD5)Made available in DSpace on 2020-10-23T22:41:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GabrielaSenaSouza.pdf: 9114555 bytes, checksum: 5b82c5e0b4b4d864468b51b491cad645 (MD5) Previous issue date: 2019-02porUniversidade Federal do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Engenharia NuclearUFRJBrasilInstituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-Graduação e Pesquisa de EngenhariaCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA NUCLEAR::APLICACOES DE RADIOISOTOPOSMicrotomografiaRadiação SíncrotronRhodnius prolixusOtimização de um protocolo de fixação e marcação para estudo do Rhodnius prolixus usando microtomografia síncrotroninfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJORIGINALGabrielaSenaSouza.pdfGabrielaSenaSouza.pdfapplication/pdf6913435http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/13327/3/GabrielaSenaSouza.pdfade4e889787dd9551b969631c9d07e41MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/13327/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD5211422/133272023-11-30 00:01:43.362oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:01:43Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
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