Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Costa, Matheus Freitas
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRJ
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11422/20649
Resumo: Introdução: Como alternativa para a redução dos recursos necessários para a descoberta de uma nova tecnologia, um novo fármaco ou medicamento, os estudos in silico se apresentam como uma alternativa para acelerar e baratear este processo. Apesar do grande potencial demonstrado pelos métodos da bioinformática, atualmente existem poucos artigos que comparam diretamente estes métodos frente a métodos in vivo, o que é de suma importância para o desenvolvimento dos métodos e modelos. Objetivos: Realizar uma revisão integrativa, apontando a aplicabilidade e a confiabilidade dos estudos in silico em relação aos estudos in vivo utilizados na descoberta e no desenvolvimento de novas tecnologias farmacêuticas, além de identificar os métodos mais utilizados e as possíveis falhas e melhorias. Métodos: Foi realizado um levantamento de artigos através da busca nas bases de dados Science Direct e Springer, utilizando como palavras-chave os termos “in vivo”, “in silico”, “drugs prediction” e ”correlation” os quais foram pesquisados apenassimultaneamente.Os critérios de inclusão foram: artigos publicados em inglês ou português, artigos originais e completos, publicados de Janeiro de 2021 até 31/01/2022 e que comparavam os estudos in vivo e in silico. Foram excluídos artigos que tinham o texto completo indisponível, artigos duplicados, artigos que não comparem ou avaliem estudos in silico e in vivo simultaneamente, frente a cenários semelhantes. Resultados e discussão: Foram encontrados um total de 344 artigos durante a pesquisa utilizando as palavras chaves e após aplicados os critérios de inclusão e exclusão 18 artigos foram selecionados e analisados. Todos os artigos analisados tiveram os resultados in silico confirmados quando testados em ensaios in vivo, já os métodos mais utilizados foram respectivamente ADMET (Absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade) (13), docking molecular (9), QSAR (Relação estrutura-atividade quantitativa (5) e docking inverso (1). Foram observadas diferentes formas de utilizar as metodologias de predição, sendo a mais frequente a triagem de candidatos partindo da estrutura de um alvo molecular e utilizando o docking com o objetivo de encontrar os candidatos com as características estéreo químicas mais adequadas. Outros estudos realizaram análises QSAR e ADMET para confirmar a atividade frente ao alvo molecular ou para mensurar parâmetros farmacocinéticos importantes. Esses métodos demonstraram potencial para auxiliar a elucidação de mecanismos de ação, além do aperfeiçoamento das moléculas e investigação de parâmetros farmacocinéticos. Limitações e melhorias também foram identificadas, como a necessidade de dados prévios que auxiliem a modelagem molecular e outros parâmetros utilizados pelos softwares, além da identificação de variáveis de importância. Conclusão: As evidências encontradas nos artigos relacionados aos métodos in silico comparadas aos métodos in vivo demonstram que esses estudos possuem uma vasta aplicabilidade. Portanto é necessário que haja mais estudos que relacionem diretamente os resultados obtidos através de ensaios in vivo aos resultados provenientes de ensaios in silico, para que ocorra aperfeiçoamentos destes métodos.
id UFRJ_dbc203e3aec180334c06c9748c1a7135
oai_identifier_str oai:pantheon.ufrj.br:11422/20649
network_acronym_str UFRJ
network_name_str Repositório Institucional da UFRJ
repository_id_str
spelling Costa, Matheus Freitashttp://lattes.cnpq.br/907769409840788616303584799http://lattes.cnpq.br/9777181820353687Todeschini, Vítorhttp://lattes.cnpq.br/7772590613565656Resende, Daniel Karlhttp://lattes.cnpq.br/5564071590531814Sangoi, Maximiliano da Silva2023-05-30T18:17:17Z2023-11-30T03:00:48Z2022-11-30COSTA, Matheus Freitas. Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa. 2022. 46 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) – Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.http://hdl.handle.net/11422/20649Submitted by Nadia Mattos (nadiamattos@macae.ufrj.br) on 2023-05-24T15:13:25Z No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5)Approved for entry into archive by Lia Baião Feder (liabaiao@macae.ufrj.br) on 2023-05-30T18:17:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5)Made available in DSpace on 2023-05-30T18:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5) Previous issue date: 2022-11-30Introdução: Como alternativa para a redução dos recursos necessários para a descoberta de uma nova tecnologia, um novo fármaco ou medicamento, os estudos in silico se apresentam como uma alternativa para acelerar e baratear este processo. Apesar do grande potencial demonstrado pelos métodos da bioinformática, atualmente existem poucos artigos que comparam diretamente estes métodos frente a métodos in vivo, o que é de suma importância para o desenvolvimento dos métodos e modelos. Objetivos: Realizar uma revisão integrativa, apontando a aplicabilidade e a confiabilidade dos estudos in silico em relação aos estudos in vivo utilizados na descoberta e no desenvolvimento de novas tecnologias farmacêuticas, além de identificar os métodos mais utilizados e as possíveis falhas e melhorias. Métodos: Foi realizado um levantamento de artigos através da busca nas bases de dados Science Direct e Springer, utilizando como palavras-chave os termos “in vivo”, “in silico”, “drugs prediction” e ”correlation” os quais foram pesquisados apenassimultaneamente.Os critérios de inclusão foram: artigos publicados em inglês ou português, artigos originais e completos, publicados de Janeiro de 2021 até 31/01/2022 e que comparavam os estudos in vivo e in silico. Foram excluídos artigos que tinham o texto completo indisponível, artigos duplicados, artigos que não comparem ou avaliem estudos in silico e in vivo simultaneamente, frente a cenários semelhantes. Resultados e discussão: Foram encontrados um total de 344 artigos durante a pesquisa utilizando as palavras chaves e após aplicados os critérios de inclusão e exclusão 18 artigos foram selecionados e analisados. Todos os artigos analisados tiveram os resultados in silico confirmados quando testados em ensaios in vivo, já os métodos mais utilizados foram respectivamente ADMET (Absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade) (13), docking molecular (9), QSAR (Relação estrutura-atividade quantitativa (5) e docking inverso (1). Foram observadas diferentes formas de utilizar as metodologias de predição, sendo a mais frequente a triagem de candidatos partindo da estrutura de um alvo molecular e utilizando o docking com o objetivo de encontrar os candidatos com as características estéreo químicas mais adequadas. Outros estudos realizaram análises QSAR e ADMET para confirmar a atividade frente ao alvo molecular ou para mensurar parâmetros farmacocinéticos importantes. Esses métodos demonstraram potencial para auxiliar a elucidação de mecanismos de ação, além do aperfeiçoamento das moléculas e investigação de parâmetros farmacocinéticos. Limitações e melhorias também foram identificadas, como a necessidade de dados prévios que auxiliem a modelagem molecular e outros parâmetros utilizados pelos softwares, além da identificação de variáveis de importância. Conclusão: As evidências encontradas nos artigos relacionados aos métodos in silico comparadas aos métodos in vivo demonstram que esses estudos possuem uma vasta aplicabilidade. Portanto é necessário que haja mais estudos que relacionem diretamente os resultados obtidos através de ensaios in vivo aos resultados provenientes de ensaios in silico, para que ocorra aperfeiçoamentos destes métodos.porUniversidade Federal do Rio de JaneiroUFRJBrasilInstituto de Ciências FarmacêuticasCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIATecnologia farmacêuticaSimulação por computadorBiologia computacionalMétodosTechnology, pharmaceuticalComputer simulationComputational biologyMethodsAnálise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD52ORIGINALMFCosta.pdfMFCosta.pdfapplication/pdf426239http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/1/MFCosta.pdf0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572MD5111422/206492023-11-30 00:00:48.948oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:00:48Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
title Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
spellingShingle Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
Costa, Matheus Freitas
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
Tecnologia farmacêutica
Simulação por computador
Biologia computacional
Métodos
Technology, pharmaceutical
Computer simulation
Computational biology
Methods
title_short Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
title_full Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
title_fullStr Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
title_full_unstemmed Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
title_sort Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
author Costa, Matheus Freitas
author_facet Costa, Matheus Freitas
author_role author
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9077694098407886
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv 16303584799
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9777181820353687
dc.contributor.author.fl_str_mv Costa, Matheus Freitas
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Todeschini, Vítor
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7772590613565656
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Resende, Daniel Karl
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5564071590531814
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Sangoi, Maximiliano da Silva
contributor_str_mv Todeschini, Vítor
Resende, Daniel Karl
Sangoi, Maximiliano da Silva
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
topic CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
Tecnologia farmacêutica
Simulação por computador
Biologia computacional
Métodos
Technology, pharmaceutical
Computer simulation
Computational biology
Methods
dc.subject.por.fl_str_mv Tecnologia farmacêutica
Simulação por computador
Biologia computacional
Métodos
Technology, pharmaceutical
Computer simulation
Computational biology
Methods
description Introdução: Como alternativa para a redução dos recursos necessários para a descoberta de uma nova tecnologia, um novo fármaco ou medicamento, os estudos in silico se apresentam como uma alternativa para acelerar e baratear este processo. Apesar do grande potencial demonstrado pelos métodos da bioinformática, atualmente existem poucos artigos que comparam diretamente estes métodos frente a métodos in vivo, o que é de suma importância para o desenvolvimento dos métodos e modelos. Objetivos: Realizar uma revisão integrativa, apontando a aplicabilidade e a confiabilidade dos estudos in silico em relação aos estudos in vivo utilizados na descoberta e no desenvolvimento de novas tecnologias farmacêuticas, além de identificar os métodos mais utilizados e as possíveis falhas e melhorias. Métodos: Foi realizado um levantamento de artigos através da busca nas bases de dados Science Direct e Springer, utilizando como palavras-chave os termos “in vivo”, “in silico”, “drugs prediction” e ”correlation” os quais foram pesquisados apenassimultaneamente.Os critérios de inclusão foram: artigos publicados em inglês ou português, artigos originais e completos, publicados de Janeiro de 2021 até 31/01/2022 e que comparavam os estudos in vivo e in silico. Foram excluídos artigos que tinham o texto completo indisponível, artigos duplicados, artigos que não comparem ou avaliem estudos in silico e in vivo simultaneamente, frente a cenários semelhantes. Resultados e discussão: Foram encontrados um total de 344 artigos durante a pesquisa utilizando as palavras chaves e após aplicados os critérios de inclusão e exclusão 18 artigos foram selecionados e analisados. Todos os artigos analisados tiveram os resultados in silico confirmados quando testados em ensaios in vivo, já os métodos mais utilizados foram respectivamente ADMET (Absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade) (13), docking molecular (9), QSAR (Relação estrutura-atividade quantitativa (5) e docking inverso (1). Foram observadas diferentes formas de utilizar as metodologias de predição, sendo a mais frequente a triagem de candidatos partindo da estrutura de um alvo molecular e utilizando o docking com o objetivo de encontrar os candidatos com as características estéreo químicas mais adequadas. Outros estudos realizaram análises QSAR e ADMET para confirmar a atividade frente ao alvo molecular ou para mensurar parâmetros farmacocinéticos importantes. Esses métodos demonstraram potencial para auxiliar a elucidação de mecanismos de ação, além do aperfeiçoamento das moléculas e investigação de parâmetros farmacocinéticos. Limitações e melhorias também foram identificadas, como a necessidade de dados prévios que auxiliem a modelagem molecular e outros parâmetros utilizados pelos softwares, além da identificação de variáveis de importância. Conclusão: As evidências encontradas nos artigos relacionados aos métodos in silico comparadas aos métodos in vivo demonstram que esses estudos possuem uma vasta aplicabilidade. Portanto é necessário que haja mais estudos que relacionem diretamente os resultados obtidos através de ensaios in vivo aos resultados provenientes de ensaios in silico, para que ocorra aperfeiçoamentos destes métodos.
publishDate 2022
dc.date.issued.fl_str_mv 2022-11-30
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-05-30T18:17:17Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-11-30T03:00:48Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv COSTA, Matheus Freitas. Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa. 2022. 46 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) – Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11422/20649
identifier_str_mv COSTA, Matheus Freitas. Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa. 2022. 46 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) – Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.
url http://hdl.handle.net/11422/20649
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRJ
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Instituto de Ciências Farmacêuticas
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRJ
instname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron:UFRJ
instname_str Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron_str UFRJ
institution UFRJ
reponame_str Repositório Institucional da UFRJ
collection Repositório Institucional da UFRJ
bitstream.url.fl_str_mv http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/2/license.txt
http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/1/MFCosta.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv dd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255
0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1784097298269077504