Análise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativa
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/20649 |
Resumo: | Introdução: Como alternativa para a redução dos recursos necessários para a descoberta de uma nova tecnologia, um novo fármaco ou medicamento, os estudos in silico se apresentam como uma alternativa para acelerar e baratear este processo. Apesar do grande potencial demonstrado pelos métodos da bioinformática, atualmente existem poucos artigos que comparam diretamente estes métodos frente a métodos in vivo, o que é de suma importância para o desenvolvimento dos métodos e modelos. Objetivos: Realizar uma revisão integrativa, apontando a aplicabilidade e a confiabilidade dos estudos in silico em relação aos estudos in vivo utilizados na descoberta e no desenvolvimento de novas tecnologias farmacêuticas, além de identificar os métodos mais utilizados e as possíveis falhas e melhorias. Métodos: Foi realizado um levantamento de artigos através da busca nas bases de dados Science Direct e Springer, utilizando como palavras-chave os termos “in vivo”, “in silico”, “drugs prediction” e ”correlation” os quais foram pesquisados apenassimultaneamente.Os critérios de inclusão foram: artigos publicados em inglês ou português, artigos originais e completos, publicados de Janeiro de 2021 até 31/01/2022 e que comparavam os estudos in vivo e in silico. Foram excluídos artigos que tinham o texto completo indisponível, artigos duplicados, artigos que não comparem ou avaliem estudos in silico e in vivo simultaneamente, frente a cenários semelhantes. Resultados e discussão: Foram encontrados um total de 344 artigos durante a pesquisa utilizando as palavras chaves e após aplicados os critérios de inclusão e exclusão 18 artigos foram selecionados e analisados. Todos os artigos analisados tiveram os resultados in silico confirmados quando testados em ensaios in vivo, já os métodos mais utilizados foram respectivamente ADMET (Absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade) (13), docking molecular (9), QSAR (Relação estrutura-atividade quantitativa (5) e docking inverso (1). Foram observadas diferentes formas de utilizar as metodologias de predição, sendo a mais frequente a triagem de candidatos partindo da estrutura de um alvo molecular e utilizando o docking com o objetivo de encontrar os candidatos com as características estéreo químicas mais adequadas. Outros estudos realizaram análises QSAR e ADMET para confirmar a atividade frente ao alvo molecular ou para mensurar parâmetros farmacocinéticos importantes. Esses métodos demonstraram potencial para auxiliar a elucidação de mecanismos de ação, além do aperfeiçoamento das moléculas e investigação de parâmetros farmacocinéticos. Limitações e melhorias também foram identificadas, como a necessidade de dados prévios que auxiliem a modelagem molecular e outros parâmetros utilizados pelos softwares, além da identificação de variáveis de importância. Conclusão: As evidências encontradas nos artigos relacionados aos métodos in silico comparadas aos métodos in vivo demonstram que esses estudos possuem uma vasta aplicabilidade. Portanto é necessário que haja mais estudos que relacionem diretamente os resultados obtidos através de ensaios in vivo aos resultados provenientes de ensaios in silico, para que ocorra aperfeiçoamentos destes métodos. |
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Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) – Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.http://hdl.handle.net/11422/20649Submitted by Nadia Mattos (nadiamattos@macae.ufrj.br) on 2023-05-24T15:13:25Z No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5)Approved for entry into archive by Lia Baião Feder (liabaiao@macae.ufrj.br) on 2023-05-30T18:17:17Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5)Made available in DSpace on 2023-05-30T18:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MFCosta.pdf: 426239 bytes, checksum: 0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572 (MD5) Previous issue date: 2022-11-30Introdução: Como alternativa para a redução dos recursos necessários para a descoberta de uma nova tecnologia, um novo fármaco ou medicamento, os estudos in silico se apresentam como uma alternativa para acelerar e baratear este processo. Apesar do grande potencial demonstrado pelos métodos da bioinformática, atualmente existem poucos artigos que comparam diretamente estes métodos frente a métodos in vivo, o que é de suma importância para o desenvolvimento dos métodos e modelos. Objetivos: Realizar uma revisão integrativa, apontando a aplicabilidade e a confiabilidade dos estudos in silico em relação aos estudos in vivo utilizados na descoberta e no desenvolvimento de novas tecnologias farmacêuticas, além de identificar os métodos mais utilizados e as possíveis falhas e melhorias. Métodos: Foi realizado um levantamento de artigos através da busca nas bases de dados Science Direct e Springer, utilizando como palavras-chave os termos “in vivo”, “in silico”, “drugs prediction” e ”correlation” os quais foram pesquisados apenassimultaneamente.Os critérios de inclusão foram: artigos publicados em inglês ou português, artigos originais e completos, publicados de Janeiro de 2021 até 31/01/2022 e que comparavam os estudos in vivo e in silico. Foram excluídos artigos que tinham o texto completo indisponível, artigos duplicados, artigos que não comparem ou avaliem estudos in silico e in vivo simultaneamente, frente a cenários semelhantes. Resultados e discussão: Foram encontrados um total de 344 artigos durante a pesquisa utilizando as palavras chaves e após aplicados os critérios de inclusão e exclusão 18 artigos foram selecionados e analisados. Todos os artigos analisados tiveram os resultados in silico confirmados quando testados em ensaios in vivo, já os métodos mais utilizados foram respectivamente ADMET (Absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade) (13), docking molecular (9), QSAR (Relação estrutura-atividade quantitativa (5) e docking inverso (1). Foram observadas diferentes formas de utilizar as metodologias de predição, sendo a mais frequente a triagem de candidatos partindo da estrutura de um alvo molecular e utilizando o docking com o objetivo de encontrar os candidatos com as características estéreo químicas mais adequadas. Outros estudos realizaram análises QSAR e ADMET para confirmar a atividade frente ao alvo molecular ou para mensurar parâmetros farmacocinéticos importantes. Esses métodos demonstraram potencial para auxiliar a elucidação de mecanismos de ação, além do aperfeiçoamento das moléculas e investigação de parâmetros farmacocinéticos. Limitações e melhorias também foram identificadas, como a necessidade de dados prévios que auxiliem a modelagem molecular e outros parâmetros utilizados pelos softwares, além da identificação de variáveis de importância. Conclusão: As evidências encontradas nos artigos relacionados aos métodos in silico comparadas aos métodos in vivo demonstram que esses estudos possuem uma vasta aplicabilidade. Portanto é necessário que haja mais estudos que relacionem diretamente os resultados obtidos através de ensaios in vivo aos resultados provenientes de ensaios in silico, para que ocorra aperfeiçoamentos destes métodos.porUniversidade Federal do Rio de JaneiroUFRJBrasilInstituto de Ciências FarmacêuticasCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIATecnologia farmacêuticaSimulação por computadorBiologia computacionalMétodosTechnology, pharmaceuticalComputer simulationComputational biologyMethodsAnálise dos métodos in silico frente à estudo in vivo: uma revisão integrativainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisabertoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81853http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/2/license.txtdd32849f2bfb22da963c3aac6e26e255MD52ORIGINALMFCosta.pdfMFCosta.pdfapplication/pdf426239http://pantheon.ufrj.br:80/bitstream/11422/20649/1/MFCosta.pdf0e98f95036ae1028a2a9006a80d5c572MD5111422/206492023-11-30 00:00:48.948oai:pantheon.ufrj.br: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Repositório de PublicaçõesPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestopendoar:2023-11-30T03:00:48Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
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