Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Francinaldo Leite da
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/13070
Resumo: Flowering is controlled by several environmental and endogenous factors, usually associated with a complex network of metabolic mechanisms. The gene characterization in Arabidopsis model has provided much information about the genetic and molecular mechanisms that control flowering process. Some of these genes had been found in rice and maize. However, in sugarcane this processe is not well known. It is known that early flowering may reduce its production up to 60% at northeast conditions. Considering the impact of early flowering in sugarcane production, the aim of this work was to make the gene characterization of two cDNAs previously identified in subtractive cDNA libraries: scPKCI and scSHAGGY. The in silico analysis showed that these two cDNAs presented both their sequence and functional catalytic domains conserved. The results of transgenic plants containing the overexpression of the gene cassette scPKCI in sense orientation showed that this construction had a negative influence on the plant development as it was observed a decrease in plant height and leaf size. For the scPKCI overexpression in antisense orientation it was observed change in the number of branches from T1 transgenic plants, whereas transgenic T2 plants showed slow development during germination and initial stages of development. The other cDNA analyzed had homology to SHAGGY protein. The overexpression construct in sense orientation did not shown any effect on development. The only difference observed it was an increase in stigma structure. These results allowed us to propose a model how these two genes may be interact and affect floweringdevelopment.
id UFRN_153f644a087cb7e97462676a12f4de8d
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/13070
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Silva, Francinaldo Leite dahttp://lattes.cnpq.br/1239745530214820http://lattes.cnpq.br/4808910380593455Lima, João Paulo Matos Santoshttp://lattes.cnpq.br/3289758851760692Vidal, Márcia Soareshttp://lattes.cnpq.br/3036544314910366Scortecci, Kátia Castanho2014-12-17T14:10:23Z2012-01-302014-12-17T14:10:23Z2011-05-16SILVA, Francinaldo Leite da. Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY. 2011. 90 f. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2011.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/13070Flowering is controlled by several environmental and endogenous factors, usually associated with a complex network of metabolic mechanisms. The gene characterization in Arabidopsis model has provided much information about the genetic and molecular mechanisms that control flowering process. Some of these genes had been found in rice and maize. However, in sugarcane this processe is not well known. It is known that early flowering may reduce its production up to 60% at northeast conditions. Considering the impact of early flowering in sugarcane production, the aim of this work was to make the gene characterization of two cDNAs previously identified in subtractive cDNA libraries: scPKCI and scSHAGGY. The in silico analysis showed that these two cDNAs presented both their sequence and functional catalytic domains conserved. The results of transgenic plants containing the overexpression of the gene cassette scPKCI in sense orientation showed that this construction had a negative influence on the plant development as it was observed a decrease in plant height and leaf size. For the scPKCI overexpression in antisense orientation it was observed change in the number of branches from T1 transgenic plants, whereas transgenic T2 plants showed slow development during germination and initial stages of development. The other cDNA analyzed had homology to SHAGGY protein. The overexpression construct in sense orientation did not shown any effect on development. The only difference observed it was an increase in stigma structure. These results allowed us to propose a model how these two genes may be interact and affect floweringdevelopment.A floração é controlada por diversos fatores como condições ambientais e fatores endógenos que se associam em uma rede de mecanismos bastante complexos. A caracterização funcional de alguns genes realizada no modelo vegetal A. thaliana tem fornecido muitas informações a respeito dos mecanismos genéticos e bioquímicos que controlam a floração. Existem muitos homólogos descritos em diversas espécies, inclusive em plantas de interesse agronômico, como: arroz e milho. Em cana-de-açúcar pouco se sabe sobre esse processo, embora o estudo nessa cultura seja muito importante, uma vez que a floração precoce pode acarretar perdas substanciais no teor de sacarose que podem chegar a até 40% da produção. Com isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a função de dois cDNAs, identificados anteriormente em bibliotecas subtrativas scPKCI e scSHAGGY, por meio de análises in silico e a superexpressão gênica nas orientações senso e antisenso utilizando plantas de Nicotiana tabacum. Os resultados obtidos com a análise in silico permitiram observar que os dois cDNAs encontram-se bem conservados, com domínios catalíticos funcionais. Os resultados das plantas transgênicas contendo o cassete de superexpressão do gene scPKCI na orientação senso mostrou que esta construção influenciou negativamente no desenvolvimento normal de plantas de tabaco transgênicas acarretando a diminuição da altura média das plantas e da área foliar. Para superexpressão de scPKCI em orientação antissenso, foi observado alterações no número de ramificações das plantas transgênicas T1, enquanto que as plantas transgênicas T2 apresentaram o início do desenvolvimento atrasado. Para o outro cDNA analisado, os resultados obtidos mostraram que a superexpressão do cDNA scSHAGGY na orientação senso não alterou o desenvolvimento das plantas, porém a planta apresentou um aumento no tamanho da estrutura floral do gineceu em 100% das flores analisadas (dez flores em seis plantas). Os nossos resultados juntamente com resultados existentes na literatura com outras plantas permitem propor que os cDNAs scPKCI e scSHAGGY estariam envolvidos no processo de floração em cana-de-açúcar.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal do Rio Grande do NortePrograma de Pós-Graduação em Ciências BiológicasUFRNBRBiodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.SuperexpressãoTabacoGenes da floraçãoFloweringSugarcaneFlowering networkCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASCaracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGYinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALCaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdfapplication/pdf2544554https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/1/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdfb9889e7b0f272a12f69ccee6cb6a3d3bMD51TEXTFrancinaldoLS_DISSERT.pdf.txtFrancinaldoLS_DISSERT.pdf.txtExtracted texttext/plain143226https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/6/FrancinaldoLS_DISSERT.pdf.txt7784bb671de1f1600724c35cd78f6085MD56CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.txtCaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.txtExtracted texttext/plain143226https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/8/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.txt7784bb671de1f1600724c35cd78f6085MD58THUMBNAILFrancinaldoLS_DISSERT.pdf.jpgFrancinaldoLS_DISSERT.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2768https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/7/FrancinaldoLS_DISSERT.pdf.jpg64dd4387030b9ec46e2b84b8b16db24eMD57CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.jpgCaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2768https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/9/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.jpg64dd4387030b9ec46e2b84b8b16db24eMD59123456789/130702019-02-08 01:20:45.069oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/13070Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2019-02-08T04:20:45Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.por.fl_str_mv Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
title Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
spellingShingle Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
Silva, Francinaldo Leite da
Superexpressão
Tabaco
Genes da floração
Flowering
Sugarcane
Flowering network
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
title_short Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
title_full Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
title_fullStr Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
title_full_unstemmed Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
title_sort Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY
author Silva, Francinaldo Leite da
author_facet Silva, Francinaldo Leite da
author_role author
dc.contributor.authorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1239745530214820
dc.contributor.advisorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.advisorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4808910380593455
dc.contributor.referees1.pt_BR.fl_str_mv Lima, João Paulo Matos Santos
dc.contributor.referees1ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees1Lattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3289758851760692
dc.contributor.referees2.pt_BR.fl_str_mv Vidal, Márcia Soares
dc.contributor.referees2ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees2Lattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3036544314910366
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Francinaldo Leite da
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Scortecci, Kátia Castanho
contributor_str_mv Scortecci, Kátia Castanho
dc.subject.por.fl_str_mv Superexpressão
Tabaco
Genes da floração
topic Superexpressão
Tabaco
Genes da floração
Flowering
Sugarcane
Flowering network
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
dc.subject.eng.fl_str_mv Flowering
Sugarcane
Flowering network
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
description Flowering is controlled by several environmental and endogenous factors, usually associated with a complex network of metabolic mechanisms. The gene characterization in Arabidopsis model has provided much information about the genetic and molecular mechanisms that control flowering process. Some of these genes had been found in rice and maize. However, in sugarcane this processe is not well known. It is known that early flowering may reduce its production up to 60% at northeast conditions. Considering the impact of early flowering in sugarcane production, the aim of this work was to make the gene characterization of two cDNAs previously identified in subtractive cDNA libraries: scPKCI and scSHAGGY. The in silico analysis showed that these two cDNAs presented both their sequence and functional catalytic domains conserved. The results of transgenic plants containing the overexpression of the gene cassette scPKCI in sense orientation showed that this construction had a negative influence on the plant development as it was observed a decrease in plant height and leaf size. For the scPKCI overexpression in antisense orientation it was observed change in the number of branches from T1 transgenic plants, whereas transgenic T2 plants showed slow development during germination and initial stages of development. The other cDNA analyzed had homology to SHAGGY protein. The overexpression construct in sense orientation did not shown any effect on development. The only difference observed it was an increase in stigma structure. These results allowed us to propose a model how these two genes may be interact and affect floweringdevelopment.
publishDate 2011
dc.date.issued.fl_str_mv 2011-05-16
dc.date.available.fl_str_mv 2012-01-30
2014-12-17T14:10:23Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-12-17T14:10:23Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVA, Francinaldo Leite da. Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY. 2011. 90 f. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2011.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/13070
identifier_str_mv SILVA, Francinaldo Leite da. Caracterização funcional de dois cDNAs de cana-de- açúcar : PKCI e SHAGGY. 2011. 90 f. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2011.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/13070
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Biodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/1/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/6/FrancinaldoLS_DISSERT.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/8/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/7/FrancinaldoLS_DISSERT.pdf.jpg
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13070/9/CaracterizacaoFuncionalDoiscDNAs_Silva_2011.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv b9889e7b0f272a12f69ccee6cb6a3d3b
7784bb671de1f1600724c35cd78f6085
7784bb671de1f1600724c35cd78f6085
64dd4387030b9ec46e2b84b8b16db24e
64dd4387030b9ec46e2b84b8b16db24e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802117831195623424