Análise de cDNAs identificados em bibliotecas substrativas de cDNA para floração de variedades de cana-de-açúcar cultivadas no Rio Grande do Norte(RN): fator de transição NAC, Calmodulina e Fosfatidiltransferase
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Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRN |
Texto Completo: | https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/13077 |
Resumo: | The flowering is a physiological process that it is vital for plants. This physiological process has been well studied in the plant model Arabidopsis, but in sugarcane this process is not well known. The transition of the shoot apical meristem from vegetative to flowering is a critical factor for plant development. At Brazil northeastern region, the transition to flowering in sugarcane has an important effect as it may reduce up to 60% its production. This is a consequence of the sugar translocation from stalks to the shoot apical meristem which is necessary during the flowering process. Therefore, the aim of this work was to explore and analyze cDNAs previously identified using subtractive cDNA libraries. The results showed that these cDNAs showed differential expression profile in varieties of sugarcane (early x late flowering). The in silico analysis suggested that these cDNAs had homology to calmodulin, NAC transcription factor and phosphatidylinositol, a SEC14, which were described in the literature as having a role in the process of floral development. To better understand the role of the cDNA homologous to calmodulin, tobacco plants were transformed with overexpression cassettes in sense and antissense orientation. Plants overexpressing the cassette in sense orientation did not flowered, while plants overexpressing the cassette in the antissense orientation produced flowers. The data obtained in this study suggested the possible role from CAM sequence, SEC14 and NAC in the induction/floral development pathway in sugarcane, this is the first study in order to analyze these genes in the sugarcane flowering process. |
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The transition of the shoot apical meristem from vegetative to flowering is a critical factor for plant development. At Brazil northeastern region, the transition to flowering in sugarcane has an important effect as it may reduce up to 60% its production. This is a consequence of the sugar translocation from stalks to the shoot apical meristem which is necessary during the flowering process. Therefore, the aim of this work was to explore and analyze cDNAs previously identified using subtractive cDNA libraries. The results showed that these cDNAs showed differential expression profile in varieties of sugarcane (early x late flowering). The in silico analysis suggested that these cDNAs had homology to calmodulin, NAC transcription factor and phosphatidylinositol, a SEC14, which were described in the literature as having a role in the process of floral development. To better understand the role of the cDNA homologous to calmodulin, tobacco plants were transformed with overexpression cassettes in sense and antissense orientation. Plants overexpressing the cassette in sense orientation did not flowered, while plants overexpressing the cassette in the antissense orientation produced flowers. The data obtained in this study suggested the possible role from CAM sequence, SEC14 and NAC in the induction/floral development pathway in sugarcane, this is the first study in order to analyze these genes in the sugarcane flowering process.A floração é um processo fisiológico que demanda um alto gasto energético, e é vital para a planta, pois é dela que depende sua propagação genética. Este processo fisiológico tem sido bem estudado no modelo vegetal Arabidopsis, mas em cana-deaçúcar não é muito conhecido. A transição do meristema apical no processo de floração é um fator crítico no ciclo de desenvolvimento da planta. No nordeste brasileiro, a transição para a floração na cana-de-açúcar tem um efeito dramático, pois pode reduzir em até 60% a produção de açúcar ou etanol. Isso porque, o florescimento da cana resulta na isoporização do colmo que é caracterizado pela translocação do açúcar presente no colmo para os ápices meristemáticos com a finalidade de suprir a necessidade energética durante o processo de floração. Portanto, o objetivo desse trabalho foi de prospectar e analisar cDNAs de cana-deaçúcar que possam estar associados à floração utilizando ferramentas de bioinformática e de transgenia. Os resultados mostraram que os cDNAs em estudo apontaram um perfil de expressão diferencial em variedades de cana-de-açúcar. As análises in silico sugeriram que os cDNAs estudados apresentam similaridade para calmodulina, fator de transcrição NAC e fosfatidilinositol, uma SEC14, as quais foram descritas na literatura como tendo um papel no processo de desenvolvimento floral. Para entender melhor o papel do cDNA homólogo à calmodulina, plantas de tabaco foram transformadas com cassetes de superexpressão nas orientações sense e antisense contendo o promotor 35S. Plantas superexpressando o cassete na orientação senso não floresceram, enquanto que plantas superexpressando o cassete na orientação antissense apresentaram o desenvolvimento reprodutivo. Os dados obtidos nesse trabalho apontam para o possível papel de CAM, NAC e SEC14 na via de indução/desenvolvimento floral em cana-de-açúcar, sendo um dos primeiros trabalhos a se estudar esses genes no processo de floração nesse organismoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal do Rio Grande do NortePrograma de Pós-Graduação em Ciências BiológicasUFRNBRBiodiversidade; Biologia Estrutural e Funcional.Análise in silicoSuperexpressãoFloraçãoIn silico analysisOverexpressionFloweringCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASAnálise de cDNAs identificados em bibliotecas substrativas de cDNA para floração de variedades de cana-de-açúcar cultivadas no Rio Grande do Norte(RN): fator de transição NAC, Calmodulina e Fosfatidiltransferaseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALAnáliseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdfapplication/pdf2384968https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13077/1/An%c3%a1liseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdfcf4765fd0b42fd627fcb0ce0d604be1eMD51TEXTValeskaDSS_DISSERT.pdf.txtValeskaDSS_DISSERT.pdf.txtExtracted texttext/plain142515https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13077/6/ValeskaDSS_DISSERT.pdf.txt205fabe9abecc0525e3804f1d7b90f89MD56AnáliseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.txtAnáliseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.txtExtracted texttext/plain142515https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13077/8/An%c3%a1liseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.txt205fabe9abecc0525e3804f1d7b90f89MD58THUMBNAILValeskaDSS_DISSERT.pdf.jpgValeskaDSS_DISSERT.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg1233https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13077/7/ValeskaDSS_DISSERT.pdf.jpgad0bb2d3ac5d03b43e9bae8d145b907cMD57AnáliseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.jpgAnáliseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg1233https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/13077/9/An%c3%a1liseCDNAsIdentificados_Souza_2011.pdf.jpgad0bb2d3ac5d03b43e9bae8d145b907cMD59123456789/130772019-02-08 01:28:41.536oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/13077Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2019-02-08T04:28:41Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false |
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The flowering is a physiological process that it is vital for plants. This physiological process has been well studied in the plant model Arabidopsis, but in sugarcane this process is not well known. The transition of the shoot apical meristem from vegetative to flowering is a critical factor for plant development. At Brazil northeastern region, the transition to flowering in sugarcane has an important effect as it may reduce up to 60% its production. This is a consequence of the sugar translocation from stalks to the shoot apical meristem which is necessary during the flowering process. Therefore, the aim of this work was to explore and analyze cDNAs previously identified using subtractive cDNA libraries. The results showed that these cDNAs showed differential expression profile in varieties of sugarcane (early x late flowering). The in silico analysis suggested that these cDNAs had homology to calmodulin, NAC transcription factor and phosphatidylinositol, a SEC14, which were described in the literature as having a role in the process of floral development. To better understand the role of the cDNA homologous to calmodulin, tobacco plants were transformed with overexpression cassettes in sense and antissense orientation. Plants overexpressing the cassette in sense orientation did not flowered, while plants overexpressing the cassette in the antissense orientation produced flowers. The data obtained in this study suggested the possible role from CAM sequence, SEC14 and NAC in the induction/floral development pathway in sugarcane, this is the first study in order to analyze these genes in the sugarcane flowering process. |
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