Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Diego Marques da Costa
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22420
Resumo: O câncer colorretal (CCR) é um tipo de câncer que acomete a região do intestino grosso e reto; sendo o terceiro câncer mais comum em homens e o segundo em mulheres no mundo. A maior parte da susceptibilidade ao CCR é proveniente de variantes genéticas múltiplas, cada uma com um efeito individual que, quando combinada, causa a diversidade de risco para o desenvolvimento desse câncer. Dentre os tipos de mutações encontrados no genoma humano, as inserções e deleções (INDEL) são a segunda classe mais comum; e o entendimento deste tipo de mutação possui um potencial de impactar na expressão, na estrutura e até mesmo função da proteína. Entretanto, sabe-se relativamente pouco sobre o impacto das INDEL no risco de CCR, especialmente na população miscigenada do Brasil. Dessa forma o objetivo deste trabalho é realizar um estudo do tipo caso-controle para determinar a associação de 16 INDEL com a susceptibilidade ao CCR na população do Rio Grande do Norte. Além disso, foi também avaliado a distribuição relativa da ancestralidade entre o grupo caso e controle. Os polimorfismos e os marcadores utilizado para a distribuição da ancestralidade foram genotipados utilizando ABI PRISM 3130 e o GeneMapper ID v3.2. A análise estatística foi realizada utilizando o R v 3.1. Em relação à ancestralidade genômica, foi observada diferença significativa na distribuição da contribuição Africana entre os grupos. Em relação à análise de associação entre o polimorfismo e o risco de desenvolver CCR, foi observado que o alelo D do polimorfismo estudado no gene IL4, e o alelo I do polimorfismo do TYMS foram associados com o aumento do risco de desenvolver CCR. No presente trabalho, também foi avaliado o risco que a combinação genotípica do TYMS (rs151264360) e do IL4 (rs79071878) aumenta consideravelmente o risco de ter CCR; e foi observado que se faz necessário a presença de pelo menos 3 alelos de risco para conferir risco de ter CCR.
id UFRN_6ba4c4128da3f6d72f00af5f63dbf0c0
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/22420
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Santos, Diego Marques da Costahttp://lattes.cnpq.br/6421756747130739http://lattes.cnpq.br/6121935907512568Santos, Sidney Emanuel Batista doshttp://lattes.cnpq.br/9809924843125163Santos, Ândrea Kely Campos Ribeiro doshttp://lattes.cnpq.br/3899534338451625Silbiger, Vivian Nogueira2017-03-23T18:43:15Z2017-03-23T18:43:15Z2016-08-30SANTOS, Diego Marques da Costa. Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte. 2016. 120f. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22420O câncer colorretal (CCR) é um tipo de câncer que acomete a região do intestino grosso e reto; sendo o terceiro câncer mais comum em homens e o segundo em mulheres no mundo. A maior parte da susceptibilidade ao CCR é proveniente de variantes genéticas múltiplas, cada uma com um efeito individual que, quando combinada, causa a diversidade de risco para o desenvolvimento desse câncer. Dentre os tipos de mutações encontrados no genoma humano, as inserções e deleções (INDEL) são a segunda classe mais comum; e o entendimento deste tipo de mutação possui um potencial de impactar na expressão, na estrutura e até mesmo função da proteína. Entretanto, sabe-se relativamente pouco sobre o impacto das INDEL no risco de CCR, especialmente na população miscigenada do Brasil. Dessa forma o objetivo deste trabalho é realizar um estudo do tipo caso-controle para determinar a associação de 16 INDEL com a susceptibilidade ao CCR na população do Rio Grande do Norte. Além disso, foi também avaliado a distribuição relativa da ancestralidade entre o grupo caso e controle. Os polimorfismos e os marcadores utilizado para a distribuição da ancestralidade foram genotipados utilizando ABI PRISM 3130 e o GeneMapper ID v3.2. A análise estatística foi realizada utilizando o R v 3.1. Em relação à ancestralidade genômica, foi observada diferença significativa na distribuição da contribuição Africana entre os grupos. Em relação à análise de associação entre o polimorfismo e o risco de desenvolver CCR, foi observado que o alelo D do polimorfismo estudado no gene IL4, e o alelo I do polimorfismo do TYMS foram associados com o aumento do risco de desenvolver CCR. No presente trabalho, também foi avaliado o risco que a combinação genotípica do TYMS (rs151264360) e do IL4 (rs79071878) aumenta consideravelmente o risco de ter CCR; e foi observado que se faz necessário a presença de pelo menos 3 alelos de risco para conferir risco de ter CCR.Colorectal cancer (CRC) is a type of cancer that affects large intestine and rectum region, and this is the third most common cancer worldwide in men and the second in women. The genetic susceptibility to CRC comes from multiple genetic variants. Individually, these genetic variants have modest effect. However, theses variants, when combined, cause a wide range of risk. Among all mutations types found in the human genome, insertion-deletions (INDEL) are the second most common class, which has a potential impact on the expression, structure and protein function. However, there are a few studies about INDEL impact on CRC risk. Thus the aim of this study is to evaluate the association of 16 INDEL with CRC susceptibility in Rio Grande do Norte population. Furthermore, it was also evaluated the relative ancestry distribution between case and control groups. Polymorphism and marker used for ancestry distribution were genotyped using ABI PRISM 3130 and GeneMapper ID v 3.2. Statistical analysis was performed using the R v 3.1. Regarding the genetic ancestry, there was significant difference in the distribution of the African contribution between groups. Regarding the polymorphism association in CRC risk, it was observed that the D allele of IL4 and I allele of TYMS polymorphisms were associated with increased CRC risk. In this study, it was also evaluated the combined effect of IL4 and TYMS polymorphism in CRC risk, and it was observed that at least 3 allelic risks were necessary to confer CRC risk.porCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIAPotencial biomarcardor de riscoCâncer colorretalINDELAssociação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norteinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FARMACÊUTICASUFRNBrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALAssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdfAssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdfapplication/pdf2550610https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/1/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdfdbb4156b8f0e58c560fc278ddf36c56aMD51TEXTDiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.txtDiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.txtExtracted texttext/plain241639https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/4/DiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.txt35cd7e41a68ca80e0a2389bcb5cb0d1fMD54AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.txtAssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.txtExtracted texttext/plain241548https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/6/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.txt5dfa91743c07dbf45e4da92f83f9110bMD56THUMBNAILDiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.jpgDiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2135https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/5/DiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.jpg1ba03285e4e2d1719108c772be957ba5MD55AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.jpgAssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1266https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/7/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.jpg8d441d4e341dec1d02c161eb07bc7864MD57123456789/224202019-05-26 02:51:13.935oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/22420Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2019-05-26T05:51:13Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
title Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
spellingShingle Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
Santos, Diego Marques da Costa
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
Potencial biomarcardor de risco
Câncer colorretal
INDEL
title_short Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
title_full Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
title_fullStr Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
title_full_unstemmed Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
title_sort Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte
author Santos, Diego Marques da Costa
author_facet Santos, Diego Marques da Costa
author_role author
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.authorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6421756747130739
dc.contributor.advisorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.advisorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6121935907512568
dc.contributor.referees1.none.fl_str_mv Santos, Sidney Emanuel Batista dos
dc.contributor.referees1ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees1Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9809924843125163
dc.contributor.referees2.none.fl_str_mv Santos, Ândrea Kely Campos Ribeiro dos
dc.contributor.referees2ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees2Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3899534338451625
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Diego Marques da Costa
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Silbiger, Vivian Nogueira
contributor_str_mv Silbiger, Vivian Nogueira
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
topic CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
Potencial biomarcardor de risco
Câncer colorretal
INDEL
dc.subject.por.fl_str_mv Potencial biomarcardor de risco
Câncer colorretal
INDEL
description O câncer colorretal (CCR) é um tipo de câncer que acomete a região do intestino grosso e reto; sendo o terceiro câncer mais comum em homens e o segundo em mulheres no mundo. A maior parte da susceptibilidade ao CCR é proveniente de variantes genéticas múltiplas, cada uma com um efeito individual que, quando combinada, causa a diversidade de risco para o desenvolvimento desse câncer. Dentre os tipos de mutações encontrados no genoma humano, as inserções e deleções (INDEL) são a segunda classe mais comum; e o entendimento deste tipo de mutação possui um potencial de impactar na expressão, na estrutura e até mesmo função da proteína. Entretanto, sabe-se relativamente pouco sobre o impacto das INDEL no risco de CCR, especialmente na população miscigenada do Brasil. Dessa forma o objetivo deste trabalho é realizar um estudo do tipo caso-controle para determinar a associação de 16 INDEL com a susceptibilidade ao CCR na população do Rio Grande do Norte. Além disso, foi também avaliado a distribuição relativa da ancestralidade entre o grupo caso e controle. Os polimorfismos e os marcadores utilizado para a distribuição da ancestralidade foram genotipados utilizando ABI PRISM 3130 e o GeneMapper ID v3.2. A análise estatística foi realizada utilizando o R v 3.1. Em relação à ancestralidade genômica, foi observada diferença significativa na distribuição da contribuição Africana entre os grupos. Em relação à análise de associação entre o polimorfismo e o risco de desenvolver CCR, foi observado que o alelo D do polimorfismo estudado no gene IL4, e o alelo I do polimorfismo do TYMS foram associados com o aumento do risco de desenvolver CCR. No presente trabalho, também foi avaliado o risco que a combinação genotípica do TYMS (rs151264360) e do IL4 (rs79071878) aumenta consideravelmente o risco de ter CCR; e foi observado que se faz necessário a presença de pelo menos 3 alelos de risco para conferir risco de ter CCR.
publishDate 2016
dc.date.issued.fl_str_mv 2016-08-30
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-03-23T18:43:15Z
dc.date.available.fl_str_mv 2017-03-23T18:43:15Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SANTOS, Diego Marques da Costa. Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte. 2016. 120f. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22420
identifier_str_mv SANTOS, Diego Marques da Costa. Associação dos polimorfismos do tipo INDEL com o risco de câncer colorretal na população do Rio Grande do Norte. 2016. 120f. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22420
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.program.fl_str_mv PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/1/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/4/DiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/6/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/5/DiegoMarquesDaCostaSantos_DISSERT.pdf.jpg
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22420/7/AssociacaoPolimorfismosTipo_Santos_2016.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv dbb4156b8f0e58c560fc278ddf36c56a
35cd7e41a68ca80e0a2389bcb5cb0d1f
5dfa91743c07dbf45e4da92f83f9110b
1ba03285e4e2d1719108c772be957ba5
8d441d4e341dec1d02c161eb07bc7864
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802117675208409088