Análise filogenética da variante Delta do SARS-CoV-2 circulante no Estado do Rio Grande do Norte

• Autor(a) principal: Dantas, Maria Eduarda Pessoa Lopes
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
• Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/46392
• topic: SARS-CoV-2; Coronavírus; Análise filogenética; Rio Grande do Norte; Phylogenetic analysis

O coronavírus 2 associado a síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) é classificado no gênero Betacoronavirus e subgênero Sarbecovírus. Esse vírus é o agente etiológico causador da doença COVID-19, a qual consiste em uma infecção respiratória potencialmente grave, que surgiu no final de 2019, se estabeleceu como pandemia no início de 2020 e permanece até os dias de hoje. De acordo com a Organização Mundial de Saúde, a variante Delta do SARS-CoV-2, detectada pela primeira vez na Índia em outubro de 2020, se espalhou por muitos países rapidamente e foi o principal fator causador da terceira onda da pandemia do vírus em julho de 2021. O objetivo desse trabalho foi realizar a análise filogenética e filogeográfica da variante delta do SARS-CoV-2 no Rio Grande do Norte, a fim de conhecer sua filodinâmica. Para isso, amostras de secreção nasal provenientes de pacientes suspeitos da infecção por SARS-CoV-2, das diversas regiões do Rio Grande do Norte, passaram pelo processo de extração do RNA viral e foram submetidas à transcrição reversa seguida da amplificação pela Reação em Cadeia da Polimerase em tempo real no Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte. Em seguida, as amostras positivas foram enviadas para o Instituto Oswaldo Cruz (Rio de Janeiro), para a caracterização molecular através do sequenciamento genético e depositadas na plataforma Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID), onde foram coletados os dados para a análise filogenética e filogeográfica. Essa análise indicou que a variante delta teve várias introduções no Brasil em momentos e locais diferentes em agosto de 2021, no Amazonas e no Amapá. Nesse mesmo período ela foi detectada no Rio Grande do Norte, nos municípios de Parnamirim, Equador, Extremoz, Canguaretama, Macaíba, Parazinho, Natal, Touros e Cerro Corá. Há uma hipótese de que essa variante do vírus foi introduzida em São Paulo e no Rio de Janeiro, onde teve início a transmissão comunitária e de lá se disseminou pelo país. Esse estudo demonstrou que essa variante se propagou rapidamente por todas as regiões do Brasil, assim como ocorreu em outros países. Isso mostra que o comportamento epidemiológico do vírus é o mesmo em escala global, daí a importância da vigilância molecular e análise da evolução de forma contínua.