Identificação de patógenos com genoma de DNA em um metagenoma de sêmen humano

• Autor(a) principal: Oliveira, Maryana Thalyta Ferreira Câmara
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
• Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/46797
• topic: Microbioma humano; Análise seminal; Metagenômica; Infertilidade masculina; Diagnóstico; Reprodução assistida; Human microbiome; Seminal analysis; Metagenomic; Male infertility; Diagnosis; Assisted reproduction

A infertilidade é um fator crescente mundialmente e tem gerado uma grande demanda pela reprodução assistida. Entre os principais fatores etiológicos, responsáveis por essa infertilidade, estão as condições infecciosas e inflamatórias. Um total de 50% de toda infertilidade descrita, em combinação ou isoladamente, é devido à infertilidade do fator masculino. Neste estudo, a abordagem metagenômica e a PCR foram utilizadas para a identificação de potenciais patógenos, com genoma de DNA, em amostras seminais de pacientes em tratamento de reprodução assistida. Para a análise, o DNA de um pool de sêmen foi avaliado por sequenciamento shotgun e os fragmentos foram processados e alinhados usando BLASTn. Na caracterização taxonômica, aproximadamente 25 gêneros e 120 espécies de bactérias foram detectadas na amostra seminal e a Gardnerella vaginalis foi a espécie bacteriana que apresentou o maior número de hits. Também neste estudo foram identificadas 4 espécies de vírus, incluindo HERVs, HHV-5 e HPV-16 e 2 espécies de protozoários, sendo elas Plasmodium vivax e Toxoplasma gondii. Na detecção molecular, o HPV e Toxoplasma gondii foram negativos, entretanto, um padrão de bandas positivas foi detectado para este último com os primers 18S. Por fim, constatou-se que, como a pesquisa do microbioma seminal é uma abordagem de crescente interesse científico, os resultados obtidos poderão ser prospectados em estudos futuros para que sejam desenvolvidos protocolos moleculares que facilitem a identificação desses patógenos.