Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2014 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFS |
DOI: | 10.1590/S0100-67622014000400005. |
Texto Completo: | http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/11824 |
Resumo: | The studies of genetic diversity in natural populations are essential to the elaboration of conservation strategies. Thus, this work was carried out to genetically characterize natural populations of Ziziphus joazeiro Mart., by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers, located in the region of Baixo São Francisco, Sergipe. 20 primers were used and, from the observed polymorphism, the genetic similarity ( ), the characterization of genetic variability and the percentage of polymorphism were estimated by Jaccard’s coefficient. The Mantel test was performed to evaluate the correlation between the genetic similarity and the geographic distance and the gene flow was also estimated. The observed polymorphism in the Z. joazeiro populations ranged from 58.1 to 66.5% and the genetic similarity from 44 to 54%. The genetic similarity observed is not correlated with the geographic distance. The values observed to the Nei’s genetic diversity, to the Shannon’s index, and to the parameters HS, HT and GST were considered high and similar to those found in other forest species. The percentage of polymorphic loci was considered low. The highest genetic identity was observed between the populations of Canindé do São Francisco, and Santana do São Francisco and the highest genetic distance between the populations of Canhoba and Canindé do São Francisco. The gene flow was higher than 1. Based on the results it can be stated that there is high genetic variability between the populations, and genetic structuring may be occurring. |
id |
UFS-2_8a9b8b856aa470a17d5e88a4f70f34a4 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ufs.br:riufs/11824 |
network_acronym_str |
UFS-2 |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFS |
spelling |
Gois, Itamara BomfimFerreira, Robério AnastácioSilva-Mann, RenataPantaleao, Silmara de MoraesGois, Camila Bomfim deOliveira, Rodrigo Santana Caldas de2019-08-23T18:47:54Z2019-08-23T18:47:54Z2014-08GOIS, I. B. et al. Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD. Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 38, n. 4, p. 621-630, jul./ago. 2014. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622014000400005. Disponível em: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-67622014000400005. Acesso em: 23 ago. 2019.1806-9088http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/11824Creative Commons Atribuição-NãoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)The studies of genetic diversity in natural populations are essential to the elaboration of conservation strategies. Thus, this work was carried out to genetically characterize natural populations of Ziziphus joazeiro Mart., by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers, located in the region of Baixo São Francisco, Sergipe. 20 primers were used and, from the observed polymorphism, the genetic similarity ( ), the characterization of genetic variability and the percentage of polymorphism were estimated by Jaccard’s coefficient. The Mantel test was performed to evaluate the correlation between the genetic similarity and the geographic distance and the gene flow was also estimated. The observed polymorphism in the Z. joazeiro populations ranged from 58.1 to 66.5% and the genetic similarity from 44 to 54%. The genetic similarity observed is not correlated with the geographic distance. The values observed to the Nei’s genetic diversity, to the Shannon’s index, and to the parameters HS, HT and GST were considered high and similar to those found in other forest species. The percentage of polymorphic loci was considered low. The highest genetic identity was observed between the populations of Canindé do São Francisco, and Santana do São Francisco and the highest genetic distance between the populations of Canhoba and Canindé do São Francisco. The gene flow was higher than 1. Based on the results it can be stated that there is high genetic variability between the populations, and genetic structuring may be occurring.Os estudos de diversidade genética em populações naturais são imprescindíveis para a elaboração de estratégias de conservação. Assim, este trabalho foi realizado com o objetivo de caracterizar geneticamente, por meio de marcadores Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., localizadas na região do Baixo São Francisco sergipano. Foram empregados 20 oligonucleotídeos e, a partir do polimorfismo observado, foram estimadas a porcentagem de polimorfismo, a variabilidade genética e a similaridade genética (Sgij), por meio do coeficiente de Jaccard. O teste de Mantel foi realizado para avaliar a correlação entre a similaridade genética e a distância geográfica; sendo o fluxo gênico também estimado. O polimorfismo observado nas populações de Z. joazeiro variou de 58,1 a 66,5% e a similaridade genética, de 44 a 54%. A similaridade genética não está correlacionada com a distância geográfica, e os valores observados para o índice de diversidade genética de Nei, para o índice de Shannon e para os parâmetros HS, HT e GST foram considerados altos e semelhantes aos encontrados em outras espécies arbóreas. A porcentagem de locos polimórficos foi considerada baixa. Maior identidade genética foi encontrada entre as populações de Canindé do São Francisco e Santana do São Francisco; e a maior distância genética entre as populações de Canhoba e Canindé do São Francisco. O fluxo gênico foi maior que 1. Com base nos resultados, pode-se afirmar que há alta variabilidade genética entre as populações e que estas podem estar geneticamente estruturadas.Viçosa, MGporSociedade de Investigações FlorestaisRevista ÁrvoreJoazeiroMarcadores molecularesGenética de populaçõesMolecular markersGenetics of populationsVariabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPDGenetic variability in natural populations of Ziziphus joazeiro Mart., by RAPD molecular markersinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/articlereponame:Repositório Institucional da UFSinstname:Universidade Federal de Sergipe (UFS)instacron:UFSinfo:eu-repo/semantics/openAccessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81475https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/1/license.txt098cbbf65c2c15e1fb2e49c5d306a44cMD51ORIGINALVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdfVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdfapplication/pdf356090https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/2/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdff14b591eb4dc60c237695a5f858ebc97MD52TEXTVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.txtVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.txtExtracted texttext/plain39152https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/3/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.txt2bda90b258275ebf6c8f97c6f4776015MD53THUMBNAILVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.jpgVariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1463https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/4/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.jpg71a35389e96068d945df600af5311573MD54riufs/118242019-08-30 17:04:10.138oai:ufs.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://ri.ufs.br/oai/requestrepositorio@academico.ufs.bropendoar:2019-08-30T20:04:10Repositório Institucional da UFS - Universidade Federal de Sergipe (UFS)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv |
Genetic variability in natural populations of Ziziphus joazeiro Mart., by RAPD molecular markers |
title |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
spellingShingle |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD Gois, Itamara Bomfim Joazeiro Marcadores moleculares Genética de populações Molecular markers Genetics of populations Gois, Itamara Bomfim Joazeiro Marcadores moleculares Genética de populações Molecular markers Genetics of populations |
title_short |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
title_full |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
title_fullStr |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
title_full_unstemmed |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
title_sort |
Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD |
author |
Gois, Itamara Bomfim |
author_facet |
Gois, Itamara Bomfim Gois, Itamara Bomfim Ferreira, Robério Anastácio Silva-Mann, Renata Pantaleao, Silmara de Moraes Gois, Camila Bomfim de Oliveira, Rodrigo Santana Caldas de Ferreira, Robério Anastácio Silva-Mann, Renata Pantaleao, Silmara de Moraes Gois, Camila Bomfim de Oliveira, Rodrigo Santana Caldas de |
author_role |
author |
author2 |
Ferreira, Robério Anastácio Silva-Mann, Renata Pantaleao, Silmara de Moraes Gois, Camila Bomfim de Oliveira, Rodrigo Santana Caldas de |
author2_role |
author author author author author |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Gois, Itamara Bomfim Ferreira, Robério Anastácio Silva-Mann, Renata Pantaleao, Silmara de Moraes Gois, Camila Bomfim de Oliveira, Rodrigo Santana Caldas de |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Joazeiro Marcadores moleculares Genética de populações |
topic |
Joazeiro Marcadores moleculares Genética de populações Molecular markers Genetics of populations |
dc.subject.eng.fl_str_mv |
Molecular markers Genetics of populations |
description |
The studies of genetic diversity in natural populations are essential to the elaboration of conservation strategies. Thus, this work was carried out to genetically characterize natural populations of Ziziphus joazeiro Mart., by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers, located in the region of Baixo São Francisco, Sergipe. 20 primers were used and, from the observed polymorphism, the genetic similarity ( ), the characterization of genetic variability and the percentage of polymorphism were estimated by Jaccard’s coefficient. The Mantel test was performed to evaluate the correlation between the genetic similarity and the geographic distance and the gene flow was also estimated. The observed polymorphism in the Z. joazeiro populations ranged from 58.1 to 66.5% and the genetic similarity from 44 to 54%. The genetic similarity observed is not correlated with the geographic distance. The values observed to the Nei’s genetic diversity, to the Shannon’s index, and to the parameters HS, HT and GST were considered high and similar to those found in other forest species. The percentage of polymorphic loci was considered low. The highest genetic identity was observed between the populations of Canindé do São Francisco, and Santana do São Francisco and the highest genetic distance between the populations of Canhoba and Canindé do São Francisco. The gene flow was higher than 1. Based on the results it can be stated that there is high genetic variability between the populations, and genetic structuring may be occurring. |
publishDate |
2014 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2014-08 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2019-08-23T18:47:54Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2019-08-23T18:47:54Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
GOIS, I. B. et al. Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD. Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 38, n. 4, p. 621-630, jul./ago. 2014. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622014000400005. Disponível em: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-67622014000400005. Acesso em: 23 ago. 2019. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/11824 |
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv |
1806-9088 |
dc.identifier.license.pt_BR.fl_str_mv |
Creative Commons Atribuição-NãoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) |
identifier_str_mv |
GOIS, I. B. et al. Variabilidade genética em populações naturais de Ziziphus joazeiro Mart., por meio de marcadores moleculares RAPD. Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 38, n. 4, p. 621-630, jul./ago. 2014. DOI: http://dx.doi.org/10.1590/S0100-67622014000400005. Disponível em: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-67622014000400005. Acesso em: 23 ago. 2019. 1806-9088 Creative Commons Atribuição-NãoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) |
url |
http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/11824 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv |
Revista Árvore |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade de Investigações Florestais |
publisher.none.fl_str_mv |
Sociedade de Investigações Florestais |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFS instname:Universidade Federal de Sergipe (UFS) instacron:UFS |
instname_str |
Universidade Federal de Sergipe (UFS) |
instacron_str |
UFS |
institution |
UFS |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFS |
collection |
Repositório Institucional da UFS |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/1/license.txt https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/2/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/3/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.txt https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/11824/4/VariabilidadeGeneticaZiziphusJoazeiro.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
098cbbf65c2c15e1fb2e49c5d306a44c f14b591eb4dc60c237695a5f858ebc97 2bda90b258275ebf6c8f97c6f4776015 71a35389e96068d945df600af5311573 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFS - Universidade Federal de Sergipe (UFS) |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio@academico.ufs.br |
_version_ |
1822219015624327168 |
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv |
10.1590/S0100-67622014000400005. |