LAPOGE Database - estrutura relacional de banco de dados biológicos para armazenamento e sistematização de informações genéticas e epidemiológicas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Nascimento, Leticia do
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/174993
Resumo: TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.
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spelling Universidade Federal de Santa CatarinaNascimento, Leticia doMarrero, Andrea Rita2017-04-19T22:28:34Z2017-04-19T22:28:34Z2016-07-08https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/174993TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.O Laboratório de Polimorfimos Genéticos – LAPOGE da UFSC foi implantado há 22 anos e é base para a formação de alunos de graduação e pós-graduação, além de estágios e vivências. O impressionante volume de dados gerados neste tempo fez crescer a necessidade de um sistema de organização dos dados coletados para todos os participantes das diversas pesquisas executadas neste tempo. Neste sentido, este trabalho propõe a implementação de um banco de dados relacional adequado ao LAPOGE, além do levantamento dos trabalhos realizados e questionários utilizados para levantamento de informações do participante doador da amostra. Durante o levantamento de dados, foi possível encontrar um total de 49 produções. Dentre estas, 34 trabalhos de conclusão de curso de graduação, 12 dissertações de mestrado e 3 teses de doutorado, que utilizaram um total de 158 marcadores. Além disso, notou-se uma grande quantidade de questionários diferentes gerados ao longo dos trabalhos; para garantir uma maior precisão na coleta de dados e diminuir a margem de erro, foram levantadas todas as perguntas comuns utilizadas durante a coleta dos dados biológicos e criado um novo questionário unificado e padronizado. O LAPOGEDb (LAPOGE Database) foi tabulado para armazenar dados em MySQL com interface PHP. Os dados são criptografados e o acesso é restrito a usuários com cadastro autorizado. Está depositado no servidor da Universidade Federal de Santa Catarina que executa três cópias diárias de segurança (backup). A estrutura relacional foi organizada em dez abas e a interface final é do tipo “amigável” onde não é exigido ao usuário nenhum conhecimento de programação. Foram implementadas as abas de Dados Pessoais, Dados Familiais, Dados Biológicos, Dados Epidemiológicos, Dados médicos, Marcadores genéticos, Amostra biológica e as abas específicas de Artrite, Psoríase, Lúpus e Câncer de Mama. O sistema de cadastro permite o acesso às informações, mas mantém sigilosas aquelas previstas pelo Comitê de Ética. A página de busca (que será implementada) permitirá coletar informações combinadas de todas as categorias e emitirá output em formato de uso para programas de análises. Dado o volume de informações, o LAPOGEDb inicia uma nova forma de organização e consulta de dados produzidos pelo LAPOGE UFSC.88 p.Florianópolis, SC.Genética Epidemiológicaorganização de dadosmarcadores genéticosLAPOGE Database - estrutura relacional de banco de dados biológicos para armazenamento e sistematização de informações genéticas e epidemiológicasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSCinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALTCC Leticia Nascimento.pdfTCC Leticia Nascimento.pdfapplication/pdf2112366https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/174993/1/TCC%20Leticia%20Nascimento.pdf91d4b1eeb31b90c88320bcc8552c9c5dMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81383https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/174993/2/license.txt11ee89cd31d893362820eab7c4d46734MD52123456789/1749932017-04-19 19:28:34.897oai:repositorio.ufsc.br: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ório de PublicaçõesPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732017-04-19T22:28:34Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
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