Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Moura, Sayonara Stéfane Tavares de
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216699
Resumo: Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020.
id UFSC_cf8f5811319c696f555000c106d2d44e
oai_identifier_str oai:repositorio.ufsc.br:123456789/216699
network_acronym_str UFSC
network_name_str Repositório Institucional da UFSC
repository_id_str 2373
spelling Universidade Federal de Santa CatarinaMoura, Sayonara Stéfane Tavares deFerreira, Fabienne AntunesRobl, Diogo2020-10-21T21:32:56Z2020-10-21T21:32:56Z2020370279https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216699Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020.A resistência aos antimicrobianos é um dos maiores problemas para saúde pública, por isso muitos estudos se esforçam na busca por novas alternativas de tratamento para infecções causadas por microrganismos resistentes. Fungos endofíticos tem se mostrado como uma abordagem promissora na busca de biomoléculas com potencial antimicrobiano. O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antimicrobiana de 49 fungos endofíticos isolados de diversas espécies de plantas no Brasil. Inicialmente, uma triagem da atividade foi realizada pelo método de bloco de difusão em ágar e demonstrou que 7 isolados identificados como Penicillium sp. (5 isolados), Aspergillus sp. (1 isolado) e Trichoderma sp. (1 isolado; DR19) exibiram halo de inibição para pelo menos uma das cepas padrão testadas. Buscando a identificação de espécies fúngicas com escassez de dados na literatura com relação à produção de antimicrobianos, foram adicionadas mais 3 amostras de fungos endofíticos no estudo: Paecilomyces sp. (DR26), Alternaria sp. (DR45) e Annulohypoxylon stygium (DR47). Assim, os 4 isolados fungicos DR19, DR26, DR45 e DR47 foram selecionados entre a coleção. Sobrenadantes concentrados de cada cultura líquida fúngica foram testados quanto sua atividade antimicrobiana pelo método de difusão em ágar. O fungo DR47 foi o que apresentou maior potencial de atividade antimicrobiana, apresentando halo de inibição contra duas cepas de Staphylococcus aureus, e contra uma cepa de Candida albicans em todas as condições testadas. Devido ao potencial antimicrobiano apresentado pelo isolado fúngico DR47, um extrato fúngico foi preparado com acetato de etila em um meio de cultivo em estado sólido. Em seguida, o extrato foi testado quanto a sua atividade antimicrobiana, apresentando halo inibitório contra três cepas estafilocócicas e a cepa de C. albicans, além de uma cepa clínica de MRSA. Desta forma, uma análise do genoma do isolado DR47 (A. stygium DR47) foi realizada e possibilitou a identificação de possíveis clusters biossintéticos associados a atividade antimicrobiana. Os resultados obtidos com a análise genômica encontraram porcentagens de similaridade para 15 clusters biossintéticos de moléculas já conhecidas. Entre eles, 6 clusters apresentaram 100% de similaridade. Entre as moléculas codificadas por estes clusters, foram reportados desde compostos utilizados como corante alimentar, por exemplo, a Monascorubrina e também micotoxinas, como a Fusarina. A associação de ferramentas genéticas para exploração in silico e de testes antimicrobianos in vrito possibilitou neste estudo demonstrar que o fungo A. stygium, representa uma nova fonte promissora na busca de compostos contra patógenos humanos, visto que, ele é ainda pouco explorado quanto as suas atividades biológicas. Sendo assim, a identificação de novas moléculas com potencial antimicrobiano pode contribuir, no futuro, na ampliação das opções de tratamentos contra as infecções microbianas, especialmente causadas por microrganismos resistentes, contribuindo para diminuição das taxas de mortalidade e morbidade relacionadas a estes microrganismos.Abstract: Antimicrobial resistance is a great challenge for public health. Therefore, many studies are striving to find new treatment alternatives for infections caused by resistant microorganisms. Endophytic fungi have been an interesting source in the search for biomolecules showing antimicrobial potential. This study aimed to evaluate the antimicrobial activity of 49 endophytic fungi isolated of plants from Brazil. Initially, the fungi collection was screened using the method of agar block diffusion against standard microbial strains. 7 fungi showed an inhibition halo against at least one of the tested strains. The fungi were identified as Penicillium sp. (5 isolates), Aspergillus sp. (1 isolate) e Trichoderma sp. (1 isolate; DR19). In order to explore fungi genders that are rarely studied as producers of antimicrobial compounds, the isolate of Trichoderma sp. (DR19) from the initial screening and 3 other isolates identified as Paecilomyces sp. (DR26), Alternaria sp. (DR45) and Annulohypoxylon stygium (DR47) were selected among the collection and added to the following studies. Concentrated liquid cultures of the 4 fungi isolates were tested by agar diffusion method. The DR47 isolate presented the most prominent antimicrobial potential, presenting an inhibition halo against two strains of Staphylococcus aureus and one strain of Candida albicans in all tested conditions. Due to the antimicrobial potential presented by the isolate DR47, its fungal extract was obtained from a solid-state culture followed by extraction using ethyl acetate. Subsequently, the extract was tested by agar diffusion method, showing an inhibitory halo against the three staphylococcal strains and the C. albicans strain, as well as a clinical MRSA strain. Thus, an analysis of the whole genome sequencing of the isolate DR47 (A. stygium DR47) was performed and it was possible to identify probable antimicrobial biosynthetic clusters. The results regarding the genomic analysis found percentages of similarity for 15 biosynthetic clusters of molecules already known. Among them, 6 clusters presented 100% of similarity. The compounds codified by those clusters have been reported as food coloring (Monascorubrin) and also as mycotoxins, such as Fusarin. The combination between in silico exploration and in vitro antimicrobial assays made it possible to demonstrate that the fungus A. stygium represents a promising new source in the search for compounds against human microbial pathogens. This fungal specie is still little explored in terms of its biological activities. Thus, the identification of new molecules showing antimicrobial potential may contribute to the expansion of treatment options against microbial infections, especially caused by resistant microorganisms. It will contribute to decrease of the mortality and morbidity rates related to these microorganisms.88 p.| il., gráfs.porBiotecnologiaFungosAgentes antiinfecciososAvaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSCinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALPBTC0313-D.pdfPBTC0313-D.pdfapplication/pdf2553096https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/216699/-1/PBTC0313-D.pdf87cbc45a2885becf424d4e9cc9295e8fMD5-1123456789/2166992020-10-21 18:32:56.796oai:repositorio.ufsc.br:123456789/216699Repositório de PublicaçõesPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732020-10-21T21:32:56Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
dc.title.none.fl_str_mv Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
title Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
spellingShingle Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
Moura, Sayonara Stéfane Tavares de
Biotecnologia
Fungos
Agentes antiinfecciosos
title_short Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
title_full Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
title_fullStr Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
title_full_unstemmed Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
title_sort Avaliação da atividade antimicrobiana de fungos endofíticos isolados de plantas no Brasil contra patógenos humanos
author Moura, Sayonara Stéfane Tavares de
author_facet Moura, Sayonara Stéfane Tavares de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Universidade Federal de Santa Catarina
dc.contributor.author.fl_str_mv Moura, Sayonara Stéfane Tavares de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Ferreira, Fabienne Antunes
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Robl, Diogo
contributor_str_mv Ferreira, Fabienne Antunes
Robl, Diogo
dc.subject.classification.none.fl_str_mv Biotecnologia
Fungos
Agentes antiinfecciosos
topic Biotecnologia
Fungos
Agentes antiinfecciosos
description Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2020.
publishDate 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-10-21T21:32:56Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-10-21T21:32:56Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2020
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216699
dc.identifier.other.none.fl_str_mv 370279
identifier_str_mv 370279
url https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/216699
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 88 p.| il., gráfs.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSC
instname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron:UFSC
instname_str Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron_str UFSC
institution UFSC
reponame_str Repositório Institucional da UFSC
collection Repositório Institucional da UFSC
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/bitstream/123456789/216699/-1/PBTC0313-D.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 87cbc45a2885becf424d4e9cc9295e8f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1766805438306713600

Registros relacionados