Detecção da linhagem st105-sccmecII-t002 (clone rdj) em isolados clínicos de staphylococcus aureus resistentes a meticilina (mrsa) em santa catarina

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Duarte, Matheus Luis
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253597
Resumo: TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Ciências Biológicas.
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spelling Detecção da linhagem st105-sccmecII-t002 (clone rdj) em isolados clínicos de staphylococcus aureus resistentes a meticilina (mrsa) em santa catarinaclone RdJstaphylococcus aureusMRSAinfecções de corrente sanguíneatipagem molecularTCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Ciências Biológicas.Staphylococcus aureus são bactérias de alta incidência e severidade em uma diversidade de infecções humanas, que podem apresentar difícil tratamento devido à origem de cepas resistentes como os MRSA (Staphylococcus aureus resistente à meticilina). Um clone de MRSA denominado Clone Rio de Janeiro (Clone RdJ), pertencente à linhagem ST105-SCCmecII-t002, foi recentemente identificado como causa de diversas infecções em pacientes, associado principalmente a infecções de corrente sanguínea. Este clone tem maior eficácia na evasão da resposta imune relacionada a monócitos quando comparado a outros clones, representando ameaça à saúde da população. A incidência deste clone em Santa Catarina (SC) era até então desconhecida, mas sua presença era sugestiva devido a estudos anteriores do nosso grupo de pesquisa, que detectaram MRSA isolados de hemoculturas e pertencentes ao SCCmecII, incluindo um isolado ST105. Assim, este estudo visou a identificação do clone RdJ entre a coleção de 26 isolados clínicos SCCmecII de MRSA do laboratório, oriundos de pacientes atendidos em SC. Para isso, foi utilizado um protocolo de detecção baseado em PCR (Polymerase chain reaction) multiplex para os genes aur, agrII e mecA, além de restrição enzimática do DNA com a endonuclease BglI. Adicionalmente, foi analisado o genoma de um isolado da coleção (16-007), anteriormente classificado como ST105- SCCmecII. O protocolo permitiu a identificação do clone RdJ em 11 (42%) dos isolados, sendo 4 (36,4%) isolados de sangue. O isolado 16007 foi classificado como CC5-não RdJ, confirmado pela análise do genoma, já que não possui a mutação no gene aur, característica que faz parte da definição do clone. Os isolados confirmados como RdJ apresentaram multirresistência em testes de sensibilidade a antibióticos (TSA) e sua presença no estado é preocupante. Estes dados servem de horizonte para posteriores pesquisas referentes à questão de saúde pública envolvendo a detecção do clone RdJ em SC, especialmente para avaliar os riscos clínicos e epidemiológicos associados, além da base biológica envolvida em sua disseminação.Staphylococcus aureus is a high incidence and severity bacterial pathogen in a variety of human infections, which are challenging to treat due to the emergence of resistant strains such as MRSA (Methicillin-resistant Staphylococcus aureus). A MRSA clone referred as Rio de Janeiro Clone (Clone RdJ) from the ST105-SCCmecII-t002 lineage has recently been identified as the cause of multiple infections in patients, primarily in bloodstream. When compared to other clones, the RdJ clone exhibits a higher efficiency in evading the host-immune response, particularly in relation to monocytes, which poses a threat to public health. The incidence of this clone in Santa Catarina (SC) was previously unknown, but its presence was suggested based on prior studies conducted by our research group, which detected MRSA isolates from blood cultures that belonged to SCCmecII, with one of them typed as ST105. Therefore, this study aimed to identify the RdJ clone among a collection of 26 clinical SCCmecII MRSA isolates from the laboratory, sourced from patients treated in SC. To achieve this, a detection protocol based on multiplex Polymerase Chain Reaction (PCR) was used for the aur, agrII, and mecA genes, alongside of DNA restriction using the BglI endonuclease. Additionally, the genome of one isolate from the collection (16-007), previously classified as ST105-SCCmecII, was analyzed. The protocol allowed the identification of the RdJ clone in 11 (42%) of the isolates, with 4 (36.4%) of them being blood isolates. Isolate 16-007 was classified as CC5-non RdJ, confirmed by genome analysis, as it did not present the aur gene mutation, a recognizing characteristic for the clone's detection. The confirmed RdJ isolates exhibited multi-drug resistance in antibiotic sensitivity tests (AST), and their presence in the state is concerning. These data provide a foundation for future research concerning the public health scenario related to the RdJ clone detection in SC, particularly to assess the clinical and epidemiological risks associated with it, as well as the biological basis involving its spreading.Florianópolis, SC.Ferreira, Fabienne AntunesUniversidade Federal de Santa Catarina.Duarte, Matheus Luis2023-12-20T13:20:19Z2023-12-20T13:20:19Z2023-11-17info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis41 f.application/pdfhttps://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253597Open Access.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSC2023-12-20T13:20:20Zoai:repositorio.ufsc.br:123456789/253597Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732023-12-20T13:20:20Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
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