Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://hdl.handle.net/11600/71059
Resumo: Introdução: O carcinoma espinocelular (CEC) oral é uma neoplasia maligna do epitélio escamoso de elevada morbidade e mortalidade. Fatores predisponentes para o seu desenvolvimento incluem o consumo de álcool e o tabagismo. Entretanto, outros agentes têm sido investigados na sua etiopatogênese, dentre eles os vírus. O envolvimento dos poliomavírus na carcinogênese oral ainda não foi inteiramente elucidado. Objetivo: Investigar a presença do material genético de quatro diferentes tipos de poliomavírus humanos em amostras de CEC oral provenientes de um centro de referência oncológico na cidade de São Paulo (Brasil) e avaliar a possível correlação entre a positividade destes vírus com fatores clínicos e sociodemográficos dos pacientes. Material e Métodos: Sessenta amostras frescas congeladas obtidas do Biobanco do ICESP, de três diferentes sítios (língua, assoalho de boca e orofaringe), com 20 amostras para cada localização, foram selecionadas retrospectivamente dentro de um período de diagnóstico firmado entre 2015 e 2019. Dados de prontuário como sexo, idade, consumo de álcool, tabagismo, estadiamento tumoral e óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico foram coletados, bem como a presença da pesquisa da proteína p16, quando disponível. As amostras foram preparadas e tiveram o DNA extraído para pesquisa do material genético dos poliomavírus MCPyV, BKPyV, JCPyV e TSPyV por meio da técnica de reação de cadeia da polimerase (PCR). Os produtos de PCR foram submetidos a sequenciamento e suas identidades foram confirmadas por comparação àquelas depositadas no GenBank®. Resultados: A investigação da presença do DNA dos poliomavírus mostrou positividade de 5% para MCPyV (n=3), 0% para BKPyV, 60% para JCPyV (n=36) e 0% para TSPyV. A identidade das sequências de DNA geradas foi confirmada por meio do alinhamento com àquelas de referência. Não foi constatada qualquer correlação entre a positividade de um determinado poliomavírus nas amostras de CEC oral com fatores clínicos ou sociodemográficos dos pacientes, nem com determinado sítio anatômico, exceto para a associação entre o óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico e a positividade para o JCPyV (p=0,009). Também não foi observado qualquer tipo de associação na positividade simultânea dos diferentes poliomavírus entre si ou com a proteína p16. Conclusões: A positividade para poliomavírus no CEC oral foi baixa para MCPyV, alta para JCPyV e nula para BKPyV e TSPyV. Mais estudos são necessários para se compreender com maior clareza a alta prevalência encontrada de JCPyV no CEC oral.
id UFSP_ab67a2dc5a9c39183020fd4abb6b4a73
oai_identifier_str oai:repositorio.unifesp.br/:11600/71059
network_acronym_str UFSP
network_name_str Repositório Institucional da UNIFESP
repository_id_str 3465
spelling Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oralDetection of polyomavirus in oral squamous cell carcinomaCâncer oralCarcinoma espinocelularPoliomavírusReação em cadeia da polimeraseOral cancerSquamous cell carcinomaPolyomavirusPolymerase chain reactionIntrodução: O carcinoma espinocelular (CEC) oral é uma neoplasia maligna do epitélio escamoso de elevada morbidade e mortalidade. Fatores predisponentes para o seu desenvolvimento incluem o consumo de álcool e o tabagismo. Entretanto, outros agentes têm sido investigados na sua etiopatogênese, dentre eles os vírus. O envolvimento dos poliomavírus na carcinogênese oral ainda não foi inteiramente elucidado. Objetivo: Investigar a presença do material genético de quatro diferentes tipos de poliomavírus humanos em amostras de CEC oral provenientes de um centro de referência oncológico na cidade de São Paulo (Brasil) e avaliar a possível correlação entre a positividade destes vírus com fatores clínicos e sociodemográficos dos pacientes. Material e Métodos: Sessenta amostras frescas congeladas obtidas do Biobanco do ICESP, de três diferentes sítios (língua, assoalho de boca e orofaringe), com 20 amostras para cada localização, foram selecionadas retrospectivamente dentro de um período de diagnóstico firmado entre 2015 e 2019. Dados de prontuário como sexo, idade, consumo de álcool, tabagismo, estadiamento tumoral e óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico foram coletados, bem como a presença da pesquisa da proteína p16, quando disponível. As amostras foram preparadas e tiveram o DNA extraído para pesquisa do material genético dos poliomavírus MCPyV, BKPyV, JCPyV e TSPyV por meio da técnica de reação de cadeia da polimerase (PCR). Os produtos de PCR foram submetidos a sequenciamento e suas identidades foram confirmadas por comparação àquelas depositadas no GenBank®. Resultados: A investigação da presença do DNA dos poliomavírus mostrou positividade de 5% para MCPyV (n=3), 0% para BKPyV, 60% para JCPyV (n=36) e 0% para TSPyV. A identidade das sequências de DNA geradas foi confirmada por meio do alinhamento com àquelas de referência. Não foi constatada qualquer correlação entre a positividade de um determinado poliomavírus nas amostras de CEC oral com fatores clínicos ou sociodemográficos dos pacientes, nem com determinado sítio anatômico, exceto para a associação entre o óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico e a positividade para o JCPyV (p=0,009). Também não foi observado qualquer tipo de associação na positividade simultânea dos diferentes poliomavírus entre si ou com a proteína p16. Conclusões: A positividade para poliomavírus no CEC oral foi baixa para MCPyV, alta para JCPyV e nula para BKPyV e TSPyV. Mais estudos são necessários para se compreender com maior clareza a alta prevalência encontrada de JCPyV no CEC oral. Introduction: Oral squamous cell carcinoma (SCC) is a malignant neoplasm of the squamous epithelium with high morbidity and mortality. Predisposing factors for its development include alcohol consumption and smoking. However, other agents have been investigated in their etiopathogenesis, including viruses. The involvement of polyomavirus in oral carcinogenesis has not yet been fully elucidated. Objective: To investigate the presence of the genetic material of four different types of human polyomavirus in samples of oral SCC from an oncological reference center in the city of São Paulo (Brazil) and evaluate the possible correlation between the positivity of these viruses with clinical and sociodemographic characteristics of patients. Methods: Sixty fresh frozen samples obtained from the ICESP Biobank, from three different sites (tongue, floor of the mouth and oropharynx), with 20 samples for each location, were retrospectively selected within a diagnosis period established between 2015 and 2019. Data from medical records such as sex, age, alcohol consumption, smoking, tumor staging and death within 5 years of diagnosis were collected, as well as p16 protein status, when available. Samples were prepared and their DNA was extracted for identification of the genetic material of MCPyV, BKPyV, JCPyV and TSPyV using the polymerase chain reaction (PCR) technique. PCR products were submitted to sequencing and their identities were compared to those deposited in GenBank®. Results: The investigation of the presence of polyomavirus DNA showed positivity of 5% for MCPyV (n=3), 0% for BKPyV, 60% for JCPyV (n=36) and 0% for TSPyV. The identity of the generated DNA sequences was confirmed by alignment with those of reference. No correlation was found between the positivity of polyomavirus in samples with any clinical or sociodemographic characteristics of the patients, nor with a certain anatomical site, except for the association between death in less than 5 years after diagnosis and positivity for o JCPyV (p=0.009). Also, no association was observed in the co-positivity of the different polyomaviruses among themselves or p16 protein. Conclusions: Positivity for polyomavirus in oral SCC was low for MCPyV, high for JCPyV and null for BKPyV and TSPyV. Further studies should be carried out in order to clearly understand the high prevalence of JCPyV found in oral SCC.OutraFUNADERSP 86/2019Universidade Federal de São PauloTomimori, Jane [UNIFESP]Pimentel Neto, Dalva Regina [UNIFESP]Sichero, Laurahttp://lattes.cnpq.br/7837968419392824http://lattes.cnpq.br/3814292055967483http://lattes.cnpq.br/1123390691453566http://lattes.cnpq.br/9979615848188403Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]2024-04-29T17:31:02Z2024-04-29T17:31:02Z2024-04-05info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion102 f.application/pdfGOMES, Rafael Tomaz. Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral. 2024, 102 f. Tese (Doutorado em Medicina Translacional) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). São Paulo, 2024.https://hdl.handle.net/11600/71059porSão Pauloinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESP2024-08-13T23:35:02Zoai:repositorio.unifesp.br/:11600/71059Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652024-08-13T23:35:02Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
dc.title.none.fl_str_mv Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
Detection of polyomavirus in oral squamous cell carcinoma
title Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
spellingShingle Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]
Câncer oral
Carcinoma espinocelular
Poliomavírus
Reação em cadeia da polimerase
Oral cancer
Squamous cell carcinoma
Polyomavirus
Polymerase chain reaction
title_short Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
title_full Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
title_fullStr Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
title_full_unstemmed Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
title_sort Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral
author Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]
author_facet Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Tomimori, Jane [UNIFESP]
Pimentel Neto, Dalva Regina [UNIFESP]
Sichero, Laura
http://lattes.cnpq.br/7837968419392824
http://lattes.cnpq.br/3814292055967483
http://lattes.cnpq.br/1123390691453566
http://lattes.cnpq.br/9979615848188403
dc.contributor.author.fl_str_mv Gomes, Rafael Tomaz [UNIFESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Câncer oral
Carcinoma espinocelular
Poliomavírus
Reação em cadeia da polimerase
Oral cancer
Squamous cell carcinoma
Polyomavirus
Polymerase chain reaction
topic Câncer oral
Carcinoma espinocelular
Poliomavírus
Reação em cadeia da polimerase
Oral cancer
Squamous cell carcinoma
Polyomavirus
Polymerase chain reaction
description Introdução: O carcinoma espinocelular (CEC) oral é uma neoplasia maligna do epitélio escamoso de elevada morbidade e mortalidade. Fatores predisponentes para o seu desenvolvimento incluem o consumo de álcool e o tabagismo. Entretanto, outros agentes têm sido investigados na sua etiopatogênese, dentre eles os vírus. O envolvimento dos poliomavírus na carcinogênese oral ainda não foi inteiramente elucidado. Objetivo: Investigar a presença do material genético de quatro diferentes tipos de poliomavírus humanos em amostras de CEC oral provenientes de um centro de referência oncológico na cidade de São Paulo (Brasil) e avaliar a possível correlação entre a positividade destes vírus com fatores clínicos e sociodemográficos dos pacientes. Material e Métodos: Sessenta amostras frescas congeladas obtidas do Biobanco do ICESP, de três diferentes sítios (língua, assoalho de boca e orofaringe), com 20 amostras para cada localização, foram selecionadas retrospectivamente dentro de um período de diagnóstico firmado entre 2015 e 2019. Dados de prontuário como sexo, idade, consumo de álcool, tabagismo, estadiamento tumoral e óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico foram coletados, bem como a presença da pesquisa da proteína p16, quando disponível. As amostras foram preparadas e tiveram o DNA extraído para pesquisa do material genético dos poliomavírus MCPyV, BKPyV, JCPyV e TSPyV por meio da técnica de reação de cadeia da polimerase (PCR). Os produtos de PCR foram submetidos a sequenciamento e suas identidades foram confirmadas por comparação àquelas depositadas no GenBank®. Resultados: A investigação da presença do DNA dos poliomavírus mostrou positividade de 5% para MCPyV (n=3), 0% para BKPyV, 60% para JCPyV (n=36) e 0% para TSPyV. A identidade das sequências de DNA geradas foi confirmada por meio do alinhamento com àquelas de referência. Não foi constatada qualquer correlação entre a positividade de um determinado poliomavírus nas amostras de CEC oral com fatores clínicos ou sociodemográficos dos pacientes, nem com determinado sítio anatômico, exceto para a associação entre o óbito em menos de 5 anos após o diagnóstico e a positividade para o JCPyV (p=0,009). Também não foi observado qualquer tipo de associação na positividade simultânea dos diferentes poliomavírus entre si ou com a proteína p16. Conclusões: A positividade para poliomavírus no CEC oral foi baixa para MCPyV, alta para JCPyV e nula para BKPyV e TSPyV. Mais estudos são necessários para se compreender com maior clareza a alta prevalência encontrada de JCPyV no CEC oral.
publishDate 2024
dc.date.none.fl_str_mv 2024-04-29T17:31:02Z
2024-04-29T17:31:02Z
2024-04-05
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv GOMES, Rafael Tomaz. Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral. 2024, 102 f. Tese (Doutorado em Medicina Translacional) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). São Paulo, 2024.
https://hdl.handle.net/11600/71059
identifier_str_mv GOMES, Rafael Tomaz. Detecção de poliomavírus no carcinoma espinocelular oral. 2024, 102 f. Tese (Doutorado em Medicina Translacional) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). São Paulo, 2024.
url https://hdl.handle.net/11600/71059
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 102 f.
application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv São Paulo
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNIFESP
instname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron:UNIFESP
instname_str Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron_str UNIFESP
institution UNIFESP
reponame_str Repositório Institucional da UNIFESP
collection Repositório Institucional da UNIFESP
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
repository.mail.fl_str_mv biblioteca.csp@unifesp.br
_version_ 1814268268842582016