Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2023 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNIFESP |
Texto Completo: | https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/69811 |
Resumo: | A síndrome da deleção 22q11.2 (SD22q11.2) resulta de uma microdeleção no braço longo do cromossomo 22, sendo a síndrome de microdeleção mais frequente na população, com incidência entre 1:3000 e 1:6000 nascidos vivos. É caracterizada por um fenótipo altamente variável entre as pessoas acometidas pela condição. Alguns indivíduos, apesar de terem os principais sinais clínicos da síndrome, podem possuir resultados citogenômicos normais. Sendo assim, este trabalho teve o objetivo de estudar 20 pacientes com hipótese diagnóstica da SD22q11.2, mas que, ao realizarem os exames de MLPA e/ou array genômico, não foi constatada a deleção. Devido aos resultados negativos dos testes moleculares realizados, levantou-se a hipótese de que esses pacientes apresentam variantes gênicas, localizadas tanto na região 22q11.2 quanto em outras regiões do genoma, que explicam o fenótipo deles. Para isso, a investigação foi ampliada com o uso de sequenciamento completo do exoma (WES, do inglês, whole exome sequencing). Entre os pacientes estudados, obtiveram-se dois resultados positivos, dois inconclusivos e os demais negativos. Em ambos os resultados positivos, o WES, realizado pela empresa 3billion, revelou duas variantes gênicas no gene KMT2A nas pacientes 1 e 2, sendo, respectivamente, uma patogênica e outra possivelmente patogênica, associadas à síndrome de Weidemann-Steiner (WSS). A partir desses resultados, foi possível avaliar a sobreposição de sinais clínicos entre as síndromes. Já dentre os inconclusivos, o sequenciamento evidenciou uma variante patogênica no gene TNFRSF13B no paciente 3, relacionada à síndrome de imunodeficiência comum variável 2, e no paciente 4, uma variante de significado incerto (VUS, do inglês, variant of uncertain significance) no gene CBL, a qual causa o transtorno semelhante à síndrome de Noonan com ou sem leucemia mielomonocítica juvenil. O estudo da segregação da variante da paciente 2 e uma revisão da literatura mais detalhada do paciente 4 possibilitaram a reclassificação das variantes para patogênicas. Dessa maneira, o estudo em questão contribui para uma melhor compreensão do genoma humano e de suas alterações, que são de alto interesse científico e clínico, uma vez que possibilitou o melhor prognóstico e acompanhamento dos pacientes e o aconselhamento genético das famílias estudadas |
id |
UFSP_c653c81fc5eab652cab8cf065ac73267 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unifesp.br/:11600/69811 |
network_acronym_str |
UFSP |
network_name_str |
Repositório Institucional da UNIFESP |
repository_id_str |
3465 |
spelling |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômicoSequenciamento completo do exomaSíndrome de deleão 22q11.2Variantes gênicasA síndrome da deleção 22q11.2 (SD22q11.2) resulta de uma microdeleção no braço longo do cromossomo 22, sendo a síndrome de microdeleção mais frequente na população, com incidência entre 1:3000 e 1:6000 nascidos vivos. É caracterizada por um fenótipo altamente variável entre as pessoas acometidas pela condição. Alguns indivíduos, apesar de terem os principais sinais clínicos da síndrome, podem possuir resultados citogenômicos normais. Sendo assim, este trabalho teve o objetivo de estudar 20 pacientes com hipótese diagnóstica da SD22q11.2, mas que, ao realizarem os exames de MLPA e/ou array genômico, não foi constatada a deleção. Devido aos resultados negativos dos testes moleculares realizados, levantou-se a hipótese de que esses pacientes apresentam variantes gênicas, localizadas tanto na região 22q11.2 quanto em outras regiões do genoma, que explicam o fenótipo deles. Para isso, a investigação foi ampliada com o uso de sequenciamento completo do exoma (WES, do inglês, whole exome sequencing). Entre os pacientes estudados, obtiveram-se dois resultados positivos, dois inconclusivos e os demais negativos. Em ambos os resultados positivos, o WES, realizado pela empresa 3billion, revelou duas variantes gênicas no gene KMT2A nas pacientes 1 e 2, sendo, respectivamente, uma patogênica e outra possivelmente patogênica, associadas à síndrome de Weidemann-Steiner (WSS). A partir desses resultados, foi possível avaliar a sobreposição de sinais clínicos entre as síndromes. Já dentre os inconclusivos, o sequenciamento evidenciou uma variante patogênica no gene TNFRSF13B no paciente 3, relacionada à síndrome de imunodeficiência comum variável 2, e no paciente 4, uma variante de significado incerto (VUS, do inglês, variant of uncertain significance) no gene CBL, a qual causa o transtorno semelhante à síndrome de Noonan com ou sem leucemia mielomonocítica juvenil. O estudo da segregação da variante da paciente 2 e uma revisão da literatura mais detalhada do paciente 4 possibilitaram a reclassificação das variantes para patogênicas. Dessa maneira, o estudo em questão contribui para uma melhor compreensão do genoma humano e de suas alterações, que são de alto interesse científico e clínico, uma vez que possibilitou o melhor prognóstico e acompanhamento dos pacientes e o aconselhamento genético das famílias estudadas22q11.2 deletion syndrome (22q11.2DS) results from a microdeletion in the long arm of chromosome 22. It is the most common microdeletion syndrome in the population, with an incidence between 1:3000 and 1:6000 live births. It is characterized by a highly variable phenotype among people affected by the condition. Some individuals, despite expressing the main clinical signs of the syndrome, may have normal cytogenomic results. Therefore, this work aimed to study 20 patients with diagnostic hypotheses of 22q11.2DS, but who, when performing MLPA and/or genomic array tests, did not find the deletion. Due to the negative results of the molecular tests performed, the hypothesis was raised that these patients present gene variants, located both in the 22q11.2 region and in other regions of the genome, which explain their phenotype. To this end, the investigation was expanded with the use of whole exome sequencing (WES). Among the trained patients, two positive results were obtained, two were inconclusive and the rest were negative. In both positive results, WES, released by the company 3billion, revealed two gene variants in the KMT2A gene in patients 1 and 2, one being pathogenic and the other possibly pathogenic, respectively, associated with Weidemann-Steiner syndrome (WSS). From these results, it was possible to evaluate the overlap of clinical signs between the syndromes. Among the inconclusive ones, sequencing showed a pathogenic variant in the TNFRSF13B gene in patient 3, related to common variable immunodeficiency syndrome 2, and in patient 4, a variant of uncertain significance (VUS, variant of uncertain significance) in the gene CBL, a cause Noonan syndrome-like with or without juvenile myelomonocytic leukemia. The study of variant segregation in patient 2 and a more detailed literature review in patient 4 made it possible to reclassify the variants as pathogenic. In this way, the study in question contributes to a better understanding of the human genome and its changes, which are of high scientific interest, as it enabled better prognosis and monitoring of patients and genetic counseling for scientific families.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)2022/00829-4Universidade Federal de São PauloMelaragno, Maria Isabel de Souza Aranha [UNIFESP]http://lattes.cnpq.br/0678071850781758http://lattes.cnpq.br/5023714947939403Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Silveira, Henrique Garcia [UNIFESP]2023-12-18T14:16:54Z2023-12-18T14:16:54Z2023-12-11info:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion59 f.application/pdfSILVEIRA, Henrique Garcia. Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico. 2023. Trabalho de conclusão de curso (Graduação em Biomedicina) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, 2023.https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/69811porSão Pauloinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESP2024-08-13T11:39:05Zoai:repositorio.unifesp.br/:11600/69811Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652024-08-13T11:39:05Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
title |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
spellingShingle |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico Silveira, Henrique Garcia [UNIFESP] Sequenciamento completo do exoma Síndrome de deleão 22q11.2 Variantes gênicas |
title_short |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
title_full |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
title_fullStr |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
title_full_unstemmed |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
title_sort |
Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico |
author |
Silveira, Henrique Garcia [UNIFESP] |
author_facet |
Silveira, Henrique Garcia [UNIFESP] |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Melaragno, Maria Isabel de Souza Aranha [UNIFESP] http://lattes.cnpq.br/0678071850781758 http://lattes.cnpq.br/5023714947939403 Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Silveira, Henrique Garcia [UNIFESP] |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Sequenciamento completo do exoma Síndrome de deleão 22q11.2 Variantes gênicas |
topic |
Sequenciamento completo do exoma Síndrome de deleão 22q11.2 Variantes gênicas |
description |
A síndrome da deleção 22q11.2 (SD22q11.2) resulta de uma microdeleção no braço longo do cromossomo 22, sendo a síndrome de microdeleção mais frequente na população, com incidência entre 1:3000 e 1:6000 nascidos vivos. É caracterizada por um fenótipo altamente variável entre as pessoas acometidas pela condição. Alguns indivíduos, apesar de terem os principais sinais clínicos da síndrome, podem possuir resultados citogenômicos normais. Sendo assim, este trabalho teve o objetivo de estudar 20 pacientes com hipótese diagnóstica da SD22q11.2, mas que, ao realizarem os exames de MLPA e/ou array genômico, não foi constatada a deleção. Devido aos resultados negativos dos testes moleculares realizados, levantou-se a hipótese de que esses pacientes apresentam variantes gênicas, localizadas tanto na região 22q11.2 quanto em outras regiões do genoma, que explicam o fenótipo deles. Para isso, a investigação foi ampliada com o uso de sequenciamento completo do exoma (WES, do inglês, whole exome sequencing). Entre os pacientes estudados, obtiveram-se dois resultados positivos, dois inconclusivos e os demais negativos. Em ambos os resultados positivos, o WES, realizado pela empresa 3billion, revelou duas variantes gênicas no gene KMT2A nas pacientes 1 e 2, sendo, respectivamente, uma patogênica e outra possivelmente patogênica, associadas à síndrome de Weidemann-Steiner (WSS). A partir desses resultados, foi possível avaliar a sobreposição de sinais clínicos entre as síndromes. Já dentre os inconclusivos, o sequenciamento evidenciou uma variante patogênica no gene TNFRSF13B no paciente 3, relacionada à síndrome de imunodeficiência comum variável 2, e no paciente 4, uma variante de significado incerto (VUS, do inglês, variant of uncertain significance) no gene CBL, a qual causa o transtorno semelhante à síndrome de Noonan com ou sem leucemia mielomonocítica juvenil. O estudo da segregação da variante da paciente 2 e uma revisão da literatura mais detalhada do paciente 4 possibilitaram a reclassificação das variantes para patogênicas. Dessa maneira, o estudo em questão contribui para uma melhor compreensão do genoma humano e de suas alterações, que são de alto interesse científico e clínico, uma vez que possibilitou o melhor prognóstico e acompanhamento dos pacientes e o aconselhamento genético das famílias estudadas |
publishDate |
2023 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2023-12-18T14:16:54Z 2023-12-18T14:16:54Z 2023-12-11 |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
format |
bachelorThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
SILVEIRA, Henrique Garcia. Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico. 2023. Trabalho de conclusão de curso (Graduação em Biomedicina) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, 2023. https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/69811 |
identifier_str_mv |
SILVEIRA, Henrique Garcia. Investigação de variantes gênicas em pacientes com fenótipo da síndrome de deleção 22q11.2 sem o desequilíbrio genômico. 2023. Trabalho de conclusão de curso (Graduação em Biomedicina) - Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo, 2023. |
url |
https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/69811 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
59 f. application/pdf |
dc.coverage.none.fl_str_mv |
São Paulo |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Paulo |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de São Paulo |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UNIFESP instname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) instacron:UNIFESP |
instname_str |
Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) |
instacron_str |
UNIFESP |
institution |
UNIFESP |
reponame_str |
Repositório Institucional da UNIFESP |
collection |
Repositório Institucional da UNIFESP |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) |
repository.mail.fl_str_mv |
biblioteca.csp@unifesp.br |
_version_ |
1814268426670047232 |