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Perfil taxonômico e funcional do microbioma subgengival associado ao Diabetes Mellitus tipo 2 e a periodontiteMicrobioma humano.Microbioma oral.Periodontite.Diabetes mellitus.Biomarcador funcional.Biomarcador taxonômico.Fluído crevicular gengival.Human microbiome.Oral microbiome.Periodontitis.Diabetes mellitus.Taxonomic biomarker.Functional biomarker.Gingival crevicular fluid.CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASO microbioma oral desempenha papel ativo na saúde oral e o mesmo sofre consideráveis mudanças em alterações de condições sistêmicas, bem como é determinante no percurso de várias doenças. Esse trabalho buscou realizar um levantamento do microbioma oral de um ambiente específico, o sulco gengival, de quatro grupos de participantes voluntários a fim de estabelecer uma relação entre condições de saúde específicas e suas respectivas interferências na distribuição e predomínio dos diferentes gêneros e espécies de bactérias presentes, bem como identificar possíveis biomarcadores taxonômicos e funcionais para Diabetes Mellitus tipo 2 e periodontite. O fluído crevicular gengival foi coletado de 42 participantes que foram alocados em 4 grupos “Saudáveis (S)”, “Diabéticos (D)”, “Periodontite (P)”, “Diabéticos/Periodontite (DP)”. O sequenciamento do amplicon 16s rRNA foi realizado e utilizado o pipeline EzBioCloud para determinar o perfil taxonômico do microbioma, para a aferição das diversidades alfa (Dα) e beta (Dβ) e para predição de biomarcadores taxonômicos (BT) e funcionais (BF) utilizando a análise discriminante linear do tamanho do efeito (LEfSe). Espécies bacterianas como Fusobacterium nucleatum group (22,09% (S), 19,92% (D) e 10,34% (DP)) e Porphyromonas gingivalis (15,82% (P)) apresentaram maiores abundâncias relativas. Para (Dα) especificamente quanto a riqueza de espécies, resultados estatisticamente significativos foram encontrados entre: (S) versus (P) com maior riqueza para o grupo (S) (Jackfnife (p=0,050)); (D) versus (P), com maior riqueza para o grupo (D) (Jackfnife (p=0,050)); (P) versus (DP) com maior riqueza para o grupo (DP) (ACE (p=0,050), Chao 1 (p=0,050), Jackknife (p=0,050)). Quanto a diversidade de espécies, resultados estatisticamente significativos foram encontrados quando comparados os grupos (P) versus (DP), com maior diversidade para o grupo (DP) (NPShannon (p=0,050), Shannon (p=0,050), Simpson (p=0,050) e Phylogenetic Diversity (p=0,050). Para a (Dβ) não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas entre os grupos. Como (BT) as espécies Neisseria perflava, Porphyromonas gingivalis, Veillonella atypica, dentre outras, foram mais abundantes nos grupos (D), (P) e (DP) respectivamente. As vias KEEG “ko03010-Ribosome” “ko02040-Flagellar assembly” e “ko01100-Metabolic pathways”, dentre outras, foram mais abundantes respectivamente nos grupos (D), (P) e (DP). Para todos os grupos, o perfil taxonômico do microbioma foi alterado e a presença da bactéria Porphyromonas gingivalis nas amostras do grupo (D) sugere que a doença é capaz de alterar o microbioma e predispor ao desenvolvimento da periodontite. Pesquisas com amostras maiores, bem como com participantes em vários estágios de evolução das doenças são necessárias.The oral microbiome can play an active role in oral health and it suffers considerable changes in systemic conditions, as well as it is not a determinant of diseases. This work sought to carry out a survey of the oral microbiome of a specific environment, the gingival sulcus, of four groups of voluntary participants in order to establish a relationship between specific health conditions and their respective interference in the distribution and predominance of different genera and species of bacteria. present, as well as to identify possible taxonomic and functional biomarkers for type 2 Diabetes Mellitus and periodontitis.Gingival crevicular fluid was collected from 42 participants who were allocated into 4 groups “Healthy (H)”, “Diabetics (D)”, “Periodontitis (P)”, “Diabetics/Periodontitis (PD)”. The sequencing of the 16s rRNA amplicon was performed and the EzBioCloud pipeline was used to determine the taxonomic profile of the microbiome, to measure alpha (αD) and beta (βD) diversities and to predict taxonomic (TB) and functional (FB) biomarkers using linear discriminant effect size analysis (LEfSe). Bacterial species such as Fusobacterium nucleatum group (22.09% (H), 19.92% (D) and 10.34% (DP)) and Porphyromonas gingivalis (15.82% (P)) showed higher relative abundances. For (αD) specifically regarding species richness, statistically significant results were found between: (H) versus (P) with greater richness for the group (H) (Jackfnife (p=0.050)); (D) versus (P), with greater richness for group (D) (Jackfnife (p=0.050)); (P) versus (DP) with greater richness for the (DP) group (ACE (p=0.050), Chao 1 (p=0.050), Jackknife (p=0.050)). As for species diversity, statistically significant results were found when comparing the groups (P) versus (DP), with greater diversity for the group (DP) (NPShannon (p=0.050), Shannon (p=0.050), Simpson (p=0.050) and Phylogenetic Diversity (p=0.050)). For a (βD) no statistically significant differences were found between the groups. As (TB) the species Neisseria perflava, Porphyromonas gingivalis, Veillonella atypica, among others, were more abundant in groups (D), (P) and (DP) respectively. The KEEG pathways “ko03010-Ribosome” “ko02040-Flagellar assembly” and “ko01100-Metabolic pathways”, among others, were more abundant in groups (D), (P) and (DP) respectively. For all groups, the taxonomic profile of the microbiome was altered and the presence of the bacterium Porphyromonas gingivalis in the samples from group (D) suggests that the disease is capable of altering the microbiome and predisposing to the development of periodontitis. Research with larger samples, as well as with participants at various stages of disease evolution, is necessary.Universidade Federal do Triângulo MineiroInstituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de MedicinaBrasilUFTMPrograma de Pós-Graduação em Ciências FisiológicasSOARES, Siomar Castro05695182611http://lattes.cnpq.br/4393381414254469RODRIGUES, Wellington Francisco05969467677http://lattes.cnpq.br/1904261854534415AGOSTINHO, Ferdinando2023-12-04T17:34:05Z2022-09-292023-12-04T17:34:05Z2022-09-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdfhttp://bdtd.uftm.edu.br/handle/123456789/1506porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTMinstname:Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)instacron:UFTM2023-12-05T02:02:45Zoai:bdtd.uftm.edu.br:123456789/1506Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.uftm.edu.br/PUBhttp://bdtd.uftm.edu.br/oai/requestbdtd@uftm.edu.br||bdtd@uftm.edu.bropendoar:2024-04-24T09:59:18.645740Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTM - Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)false
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