Investigação teórica por meio de métodos de primeiros princípios de dímeros de timina e uracila.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: CONCEIÇÃO, Victor Manoel Soares.
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFT
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11612/6598
Resumo: O uso de radiação UV-C (ultravioleta) como agente germicida tem sido empregado no combate à pandemia global causada pelo novo corona vírus (SARS-CoV-2) e a caracterização das estruturas que são geradas a partir da interação do material biológico com a radiação constitui uma importante área de pesquisa. Posto isto, apresenta-se um estudo teórico realizado por meio de métodos computacionais de primeiros princípios que se propõe a analisar as propriedades estruturais, eletrônicas e cinéticas de sistemas compostos pelas bases nitrogenadas que compõem o DNA ou RNA (Timina, Uracila, Guanina, Adenina e Citosina) dando ênfase aos dímeros de pirimidina (Timina e Uracila), os quais constituem um dos principais fotoprodutos gerados a partir da interação da radiação UV-C com material biológico. Os dímeros são formados em decorrência do surgimento de ligações carbono-carbono (C–C) diferentes daquelas já identificadas nas bases isoladas. Nossos resultados para propriedades eletrônicas evidenciam que as novas ligações C–C são responsáveis pelo aumento dos valores de gaps de energia e alterações nas banda de valência dos dímeros. Os cálculos de barreiras de reação para dímeros de Timina evidenciam que o processo de dessorção é um evento sem barreira.
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Posto isto, apresenta-se um estudo teórico realizado por meio de métodos computacionais de primeiros princípios que se propõe a analisar as propriedades estruturais, eletrônicas e cinéticas de sistemas compostos pelas bases nitrogenadas que compõem o DNA ou RNA (Timina, Uracila, Guanina, Adenina e Citosina) dando ênfase aos dímeros de pirimidina (Timina e Uracila), os quais constituem um dos principais fotoprodutos gerados a partir da interação da radiação UV-C com material biológico. Os dímeros são formados em decorrência do surgimento de ligações carbono-carbono (C–C) diferentes daquelas já identificadas nas bases isoladas. Nossos resultados para propriedades eletrônicas evidenciam que as novas ligações C–C são responsáveis pelo aumento dos valores de gaps de energia e alterações nas banda de valência dos dímeros. Os cálculos de barreiras de reação para dímeros de Timina evidenciam que o processo de dessorção é um evento sem barreira.The use of UV-C radiation as a germicidal agent has been employed in combating the global pandemic caused by the novel coronavirus (SARS-CoV-2), and the characterization of the structures generated from the interaction of biological material with radiation constitutes an important area of research. With this in mind, a theoretical study is presented, conducted through first principles computational methods, which aims to analyze the structural, electronic, and kinetic properties of systems composed of the nitrogenous bases that make up DNA or RNA (Thymine, Uracil, Guanine, Adenine, and Cytosine), with emphasis on pyrimidine dimers (Thymine and Uracil), which are one of the main photoproducts generated from the interaction of UV-C radiation with biological material. The dimers are formed due to the emergence of carbon-carbon (C-C) bonds different from those already identified in isolated bases. Our results for electronic properties show that the new C-C bonds are responsible for increasing the energy gap values and altering the valence band of the dimers. Reaction barrier calculations for Thymine dimers show that the desorption process is a barrierless event.Universidade Federal do TocantinsAraguaínaCURSO::ARAGUAÍNA::PRESENCIAL::LICENCIATURA::FÍSICAAraguaínaGraduaçãoAcesso Livre.info:eu-repo/semantics/openAccessCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICAUV-C; BASES NITROGENADAS; RADIAC¸AO GERMICIDA; DFT.Investigação teórica por meio de métodos de primeiros princípios de dímeros de timina e uracila.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisporreponame:Repositório Institucional da UFTinstname:Universidade Federal do Tocantins (UFT)instacron:UFTORIGINALTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdfTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdfapplication/pdf3499408http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/6598/1/TCC%20-%20VICTOR%20MANOEL%20SOARES%20CONCEI%c3%87%c3%83O%20-%20FIS%c3%8dCA.pdf8a95acf6e96d15686443c8b251ba8a60MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/6598/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdf.txtTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdf.txtExtracted texttext/plain74924http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/6598/3/TCC%20-%20VICTOR%20MANOEL%20SOARES%20CONCEI%c3%87%c3%83O%20-%20FIS%c3%8dCA.pdf.txte7178adb8b3ce3f03b4ce50393d10917MD53THUMBNAILTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdf.jpgTCC - VICTOR MANOEL SOARES CONCEIÇÃO - FISÍCA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1250http://repositorio.uft.edu.br/bitstream/11612/6598/4/TCC%20-%20VICTOR%20MANOEL%20SOARES%20CONCEI%c3%87%c3%83O%20-%20FIS%c3%8dCA.pdf.jpg36ea63bccc1ca9d75677918fafd8daaeMD5411612/65982024-04-01 03:15:17.091oai:repositorio.uft.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.uft.edu.br/oai/requestbiblioarraias@uft.edu.br || bibliogpi@uft.edu.br || bibliomira@uft.edu.br || bibliopalmas@uft.edu.br || biblioporto@uft.edu.br || biblioarag@uft.edu.br || dirbib@ufnt.edu.br || bibliocca@uft.edu.br || bibliotoc@uft.edu.bropendoar:2024-04-01T06:15:17Repositório Institucional da UFT - Universidade Federal do Tocantins (UFT)false
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