Determinacao do numero de marcadores rapd para estudos da diversidade genetica em soja utilizando o metodo BOOTSTRAP

• Autor(a) principal: Pequeno, Susete Araujo
• Data de Publicação: 2006
• Outros Autores: Pinheiro, Jose Baldin, Zucchi, Maria Imaculada, Vencovsky, Roland, Guedes Coelho, Alexandre Siqueira, Gloria Trindade, Maria da
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: Bioscience journal (Online)
• Texto Completo: https://seer.ufu.br/index.php/biosciencejournal/article/view/6451
• topic: RAPD; Glycine max.; Diversidade genetica

Vinte e seis cultivares de soja pertencentes ao grupo de maturação tardio foram avaliados com base em 85 locos RAPD, obtidos de 27 primers, submetendo-se os dados obtidos à técnica de bootstrap para determinar o número mínimo de locos necessários para se ter uma boa precisão nos estudos de diversidade genética. O procedimento de bootstrap dos locos foi utilizado para estimar o coeficiente de variação (CV) do índice de similaridade de Jaccard, utilizando-se 1000 permutações. O número mínimo de locos foi encontrado através da expressão xc= [ a2b2(2b-1)/(b-2)] 1/(2-2b) onde xc é o ponto de máxima curvatura da função, e corresponde à quantidade mínima de locos a ser amostrado no genoma. Foi obtido um coeficiente de determinação de 0,98, indicando um bom ajuste da curva estimada aos dados observados. Para este conjunto de dados, o ponto de curvatura máxima foi xc = 12,41, que corresponde a um CV de 33 %, e indica que o uso de 12 a 13 locos marcadores proporcionaria a precisão obtida para as estimativas. O parâmetro b da equação representa uma medida da heterogeneidade entre bandas. O valor encontrado neste estudo, de b = 0,426, mostra uma alta heterogeneidade entre bandas, já que o valor máximo esperado para este parâmetro é de 0,5. UNITERMOS: RAPD, Glycine max, diversidade genética