Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Anastácio, Rogério
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFU
Texto Completo: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/14099
https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200
Resumo: Liver cancer is highly complex to be diagnosed and treated, but is not the most frequent in Brazil, and the detection is the best way to reduce cancer mortality. And the computed tomography of the abdomen is often used in the analysis and diagnosis of hepatic lesion. The computer aided diagnosis can be used as a tool for the radiologists in the detection of liver cancer. One of the first steps of building a computer aided diagnosis for liver is the segmentation of the organ. The radiological liver contrast to the other organs in the abdominal region is low, and generally being a problem, depending on which slice is observed, to be overcome in the segmentation. The main objective of this work is to perform the automatic segmentation of the liver and calculate its volume, using the region growing algorithm segmentation. Before being performed the liver segmentation, the computed tomography slices of the abdomen are pre-processed for noise reduction and contrast enhancement. The segmentation was then performed beginning from the pre-processed slices using region growing algorithm and automatic seed launch. The seed launch area was also automated in different formats, rectangular, elliptical and circular, that influenced the performance of the segmentation technique and consequently the success rate of the hepatic volume calculation with average hit rate of 66.008% for segmentation with seed launch on rectangular area, 75.56% for the elliptical area and 94.14% for the circular area. Therefore the automatic selection of seed launching area in circular format proved to be a robust technique and with a good result in liver segmentation, and so can be considered a contribution to region growing algorithm used in this project.
id UFU_c54ace4fbb719708534f54104fffc6b0
oai_identifier_str oai:repositorio.ufu.br:123456789/14099
network_acronym_str UFU
network_name_str Repositório Institucional da UFU
repository_id_str
spelling Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficasProcessamento de imagensFígado - TomografiaSegmentação automática do fígadoVolumetria hepáticaCrescimento de regiãoAutomatic liver segmentationLiver volumeRegion growingCNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICALiver cancer is highly complex to be diagnosed and treated, but is not the most frequent in Brazil, and the detection is the best way to reduce cancer mortality. And the computed tomography of the abdomen is often used in the analysis and diagnosis of hepatic lesion. The computer aided diagnosis can be used as a tool for the radiologists in the detection of liver cancer. One of the first steps of building a computer aided diagnosis for liver is the segmentation of the organ. The radiological liver contrast to the other organs in the abdominal region is low, and generally being a problem, depending on which slice is observed, to be overcome in the segmentation. The main objective of this work is to perform the automatic segmentation of the liver and calculate its volume, using the region growing algorithm segmentation. Before being performed the liver segmentation, the computed tomography slices of the abdomen are pre-processed for noise reduction and contrast enhancement. The segmentation was then performed beginning from the pre-processed slices using region growing algorithm and automatic seed launch. The seed launch area was also automated in different formats, rectangular, elliptical and circular, that influenced the performance of the segmentation technique and consequently the success rate of the hepatic volume calculation with average hit rate of 66.008% for segmentation with seed launch on rectangular area, 75.56% for the elliptical area and 94.14% for the circular area. Therefore the automatic selection of seed launching area in circular format proved to be a robust technique and with a good result in liver segmentation, and so can be considered a contribution to region growing algorithm used in this project.Mestre em CiênciasO câncer de fígado é de alta complexidade para ser diagnosticado e tratado, porém não é o de maior ocorrência no Brasil, e a detecção é a melhor forma de reduzir a mortalidade por câncer. O exame de Tomografia Computadorizada (TC) da região abdominal é frequentemente utilizado na análise e diagnóstico de lesões hepáticas. O sistema de auxílio ao diagnóstico pode ser utilizado como uma ferramenta pelos médicos radiologistas na detecção do câncer hepático. Uma das primeiras etapas da construção de um sistema de auxílio ao diagnóstico para fígado é segmentação do órgão. O contraste radiológico do fígado com os outros órgãos da região abdominal é baixo e, dependendo da fatia que é observada na TC, um grande desafio que deverá ser contornado na segmentação. O objetivo deste trabalho é realizar a segmentação automática do fígado e calcular seu volume, utilizando para a segmentação o algoritmo de crescimento de região. Antes de ser realizada a segmentação do fígado, as fatias de tomografia computadorizada da região abdominal foram pré-processadas para a redução de ruído e realce de contraste. A segmentação foi então realizada a partir das fatias pré-processadas usando algoritmo de crescimento de região e lançamento automático de semente. A área de lançamento de semente também foi automatizada em formatos diferentes, retangular, elíptica e circular, o que influenciou no desempenho da técnica de segmentação e consequentemente na taxa de acerto do volume hepático. Obteve-se um acerto médio de 66,08% para a segmentação com lançamento de semente em região retangular, 75,56% para região elíptica e 94,14% para região circular. Logo, a seleção automática da área de lançamento de semente em formato circular se mostrou uma técnica robusta e com um bom resultado na segmentação hepática, sendo então considerada uma contribuição para o algoritmo de crescimento de região utilizado neste projeto.Universidade Federal de UberlândiaBRPrograma de Pós-graduação em Engenharia BiomédicaEngenhariasUFUPatrocinio, Ana Claudiahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707794U3Carneiro, Milena Bueno Pereirahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4550919J0Schiabel, Homerohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784797Z6Anastácio, Rogério2016-06-22T18:37:00Z2015-11-272016-06-22T18:37:00Z2015-03-25info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfANASTÁCIO, Rogério. Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas. 2015. 152 f. Dissertação (Mestrado em Engenharias) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015. DOI https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/14099https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFUinstname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU)instacron:UFU2021-09-27T13:39:28Zoai:repositorio.ufu.br:123456789/14099Repositório InstitucionalONGhttp://repositorio.ufu.br/oai/requestdiinf@dirbi.ufu.bropendoar:2021-09-27T13:39:28Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU)false
dc.title.none.fl_str_mv Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
title Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
spellingShingle Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
Anastácio, Rogério
Processamento de imagens
Fígado - Tomografia
Segmentação automática do fígado
Volumetria hepática
Crescimento de região
Automatic liver segmentation
Liver volume
Region growing
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA
title_short Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
title_full Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
title_fullStr Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
title_full_unstemmed Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
title_sort Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas
author Anastácio, Rogério
author_facet Anastácio, Rogério
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Patrocinio, Ana Claudia
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707794U3
Carneiro, Milena Bueno Pereira
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4550919J0
Schiabel, Homero
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784797Z6
dc.contributor.author.fl_str_mv Anastácio, Rogério
dc.subject.por.fl_str_mv Processamento de imagens
Fígado - Tomografia
Segmentação automática do fígado
Volumetria hepática
Crescimento de região
Automatic liver segmentation
Liver volume
Region growing
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA
topic Processamento de imagens
Fígado - Tomografia
Segmentação automática do fígado
Volumetria hepática
Crescimento de região
Automatic liver segmentation
Liver volume
Region growing
CNPQ::ENGENHARIAS::ENGENHARIA BIOMEDICA
description Liver cancer is highly complex to be diagnosed and treated, but is not the most frequent in Brazil, and the detection is the best way to reduce cancer mortality. And the computed tomography of the abdomen is often used in the analysis and diagnosis of hepatic lesion. The computer aided diagnosis can be used as a tool for the radiologists in the detection of liver cancer. One of the first steps of building a computer aided diagnosis for liver is the segmentation of the organ. The radiological liver contrast to the other organs in the abdominal region is low, and generally being a problem, depending on which slice is observed, to be overcome in the segmentation. The main objective of this work is to perform the automatic segmentation of the liver and calculate its volume, using the region growing algorithm segmentation. Before being performed the liver segmentation, the computed tomography slices of the abdomen are pre-processed for noise reduction and contrast enhancement. The segmentation was then performed beginning from the pre-processed slices using region growing algorithm and automatic seed launch. The seed launch area was also automated in different formats, rectangular, elliptical and circular, that influenced the performance of the segmentation technique and consequently the success rate of the hepatic volume calculation with average hit rate of 66.008% for segmentation with seed launch on rectangular area, 75.56% for the elliptical area and 94.14% for the circular area. Therefore the automatic selection of seed launching area in circular format proved to be a robust technique and with a good result in liver segmentation, and so can be considered a contribution to region growing algorithm used in this project.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-11-27
2015-03-25
2016-06-22T18:37:00Z
2016-06-22T18:37:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv ANASTÁCIO, Rogério. Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas. 2015. 152 f. Dissertação (Mestrado em Engenharias) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015. DOI https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200
https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/14099
https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200
identifier_str_mv ANASTÁCIO, Rogério. Segmentação e volumetria automática de fígado a partir de imagens tomográficas. 2015. 152 f. Dissertação (Mestrado em Engenharias) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015. DOI https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200
url https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/14099
https://doi.org/10.14393/ufu.di.2015.200
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Uberlândia
BR
Programa de Pós-graduação em Engenharia Biomédica
Engenharias
UFU
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Uberlândia
BR
Programa de Pós-graduação em Engenharia Biomédica
Engenharias
UFU
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFU
instname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU)
instacron:UFU
instname_str Universidade Federal de Uberlândia (UFU)
instacron_str UFU
institution UFU
reponame_str Repositório Institucional da UFU
collection Repositório Institucional da UFU
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU)
repository.mail.fl_str_mv diinf@dirbi.ufu.br
_version_ 1805569643885101056