Efficiency of mapping epistatic quantitative trait loci

• Autor(a) principal: Souza, Camila Angélica Santos
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30131; https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2022.253
• topic: Mapeamento cromossômico; Epistasia genética; Reações falso-positivas; Locus de caracteres quantitativos; Genética Quantitativa

Investigações metodológicas anteriores sobre mapeamento QTL epistático mostraram que esse procedimento é poderoso, eficiente para controlar a taxa de falso positivo (FP), e preciso para localizar QTLs. O objetivo desse estudo baseado em simulação é mostrar que o mapeamento de QTLs epistáticos não é perfeito. Os procedimentos padrões do software mais importante disponível maximizaram o poder de detecção dos QTLs (média de 56-74%), associado a um FP muito alto (65%) e um baixo poder para os pares epistáticos (7%). Aumentar a média do poder para pares epistáticos (14%) aumentou a taxa de FP. Adotando um procedimento para encontrar o melhor equilíbrio entre poder e FP, houve uma diminuição significativa no poder de detecção de QTL (em média 17-31%), associado a uma baixa potência média para pares epistáticos (8%) e um FP médio de 31% para QTLs e 16% para pares epistáticos. Acreditamos que as principais razões para esses resultados negativos sejam a modelagem simplificada dos efeitos epistáticos e a não inclusão de genes menores (2/3 do FP para QTLs foram devidos a genes menores). Palavras-chave: Epistasia. Poder detecção. Falso positivo. Mapeamento QTL.