Chromosomal distribution of the repetitive sequences in Zea mays and Psidium guajava, and its implications in karyotype

• Autor(a) principal: Silva, Jéssica Coutinho
• Data de Publicação: 2020
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/28739
• topic: Citogenética; Goiaba; Cariótipos; Milho; Genomas; Genética Vegetal

Os genomas das plantas são ricos em sequências repetitivas, inicialmente reconhecidas como "DNA lixo". Porém, atualmente tem sido demonstrado que elas desempenham papéis importantes em diferentes processos, como rearranjos cromossômicos, expressão e função gênica, além de influenciar nas diferenças de conteúdo de DNA nuclear entre as espécies. Neste cenário, a identificação, comparação e mapeamento de sequências repetitivas geram evidencias acerca da organização cariotípica das plantas. O presente estudo comparou cariótipos de três acessos de Zea mays, por meio de citogenética molecular, buscando responder se a variação do tamanho do genoma nuclear entre eles é promovida por quantidades diferenciais de sequências repetitivas e/ou por rearranjos cromossômicos estruturais. Além disso, identificamos e caracterizamos a distribuição de duas sequências de retrotransposons-LTR no cariótipo de Psidium guajava. No primeiro estudo, o conteúdo de DNA nuclear dos acessos de Z. mays revelou uma variação intraespecífica notável de 2C = 2,00 pg a 2C = 6,10 pg. A partir da análise comparativa dos cariótipos, uma deleção terminal heterozigótica no cromossomo 3 foi apontada como a causa do menor valor 2C, assim como foi observada uma translocação no braço curto do cromossomo 1. O maior valor 2C foi associado à distribuição mais abundante de retrotransposons-LTR da família Grande no cariótipo. Além disso, heteromorfismos foram encontrados em relação ao número e à posição da sequência de repetição em tandem de 180 pb. No segundo trabalho, identificamos e caracterizamos dois retrotransposons Copia LTR do ponto de vista genômico e cromossômico em P. guajava, uma árvore frutífera economicamente importante. A análise citogenômica evidenciou que essas duas sequências de Copia, identificadas como RLC_Pg_1 e RLC_Pg_2, estão relacionadas às linhagens RLC_egBianca_1 e RLC_egAle_2 de Eucalyptus grandis, respectivamente. Nosso trabalho fornece novos insights para esclarecer o papel dos elementos móveis na diversificação do cariótipo de P. guajava e Z. mays.Palavras-chave: Citogenética. Goiaba. Cariótipo. Milho. Genoma de planta. Sequências repetitivas.