Mapeamento genético em famílias simuladas de irmãos completos

• Autor(a) principal: Bhering, Leonardo Lopes
• Data de Publicação: 2008
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/1274
• topic: Estatística genômica; Populações exogâmicas; Detecção de QTLs; Genomic statistics; Exogamic populations; QTLs detection; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA QUANTITATIVA

O mapeamento genético facilita o trabalho de melhoramento, uma vez que uma ou mais marcas podem estar associadas a genes controladores de características qualitativas e quantitativas (QTL), podendo ser utilizada na seleção assistida. O estabelecimento de mapas genéticos em populações exogâmicas apresenta determinadas complicações não encontradas ao utilizar populações endogâmicas. Dentre elas tem-se variação no número de alelos segregando por loco e, geralmente, há desconhecimento da fase de ligação. Em famílias de irmãos completos diferentes graus de informações são observados na progênie, podendo esta ser do tipo completamente informativa ou não completamente informativa. Outro fator de fundamental importância para se obter dados consistentes que resultem em mapas genéticos fidedignos é o tamanho da amostra ou da população de mapeamento. Assim, objetivou-se com este trabalho fornecer subisídios para melhor entender o processo de estimação da freqüência de recombinação entre diferentes configurações gênicas presentes em família de irmãos completos, além de estimar o tamanho ideal de população para a obtenção de mapas de ligação confiáveis neste tipo de delineamento genético. Para isto foi simulado um genoma constituído de três grupos de ligação, sendo cada um constituído de 11 marcas moleculares multialélicas, codominantes, eqüidistantes, com saturação de 10 cM. A partir deste genoma foram simulados dois cenários, sendo um com genitores completamente informativos e outro com genitores formados aleatoriamente. Foi ainda considerado diferente tamanhos de população para cada cenário. Sendo estas populações constituídas de 100, 200, 300 e 400 indivíduos e 100 repetições de cada tamanho amostral. Após a obtenção de todas as estimativas da freqüência de recombinação concluiu-se que para locos completamente informativos pode- se calcular a freqüência de recombinação entre pares de locos tanto a partir da freqüência gamética de cada genitor quanto a partir da freqüência genotípica conjunta da progênie. Para locos parcialmente informativos a obtenção da freqüência de recombinação a partir da freqüência genotípica conjunta foi mais apropriada. Concluiu-se ainda que, para populações completamente informativas um tamanho populacional de 200 indivíduos seria o suficiente para resgatar as informações originais. Contudo, para a população não completamente informativa seria necessária a utilização de uma população maior, constituída de 600 indivíduos.