Hierarchical genetic clusters for phenotypic analysis

• Autor(a) principal: Matta, Luiza Barbosa da
• Data de Publicação: 2013
• Outros Autores: Tomé, Lívia Gracielle Oliveira, Salgado, Caio Césio, Cruz, Cosme Damião, Silva, Letícia de Faria
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.4025/actasciagron.v37i4.19746; http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/18448
• topic: Hierarchical clustering; Genetic diversity; Backcrossing

Visando auxiliar o melhorista na escolha da melhor metodologia para análises de diversidade genética em populações de retrocruzamento avaliaram-se os métodos baseados em informações fenotípicas. Os fenótipos foram simulados para 13 características, geradas em 10 populações com 100 indivíduos cada. Geraram-se informações genotípicas de 100 locos, dos quais 20 foram tomados ao acaso para determinar as características, manifestando dois alelos. Medidas de dissimilaridade foram calculadas, e analisou-se a diversidade genética por meio agrupamento hierárquico e projeção gráfica das distâncias. A partir das duas populações mais divergentes fez-se o retrocruzamento. Considerou-se um conjunto de características com herdabilidade variável. Simulou-se o efeito ambiental admitindo distribuição normal, com média zero e variância σ2. Para as análises de agrupamentos hierárquicos utilizaram-se os métodos: Método de Gower, Ligação média dentro de grupo, Ligação média entre grupo, Vizinho mais distante, Vizinho mais próximo, Método de Ward, Método da mediana. O efeito ambiental e a herdabilidade das variáveis analisadas influenciaram o padrão de agrupamento de populações sob retrocruzamento. Em características de herdabilidade elevada, o método do Vizinho mais próximo foi o mais eficiente em reconstituir o retrocruzamento, além de ter apresentado a maior correlação cofenética, sendo considerada a melhor metodologia a priori e a posteriori.