Proteomic applications for studies of bull fertility

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Viana, Arabela Guedes de Azevedo
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Tese
Idioma: eng
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30380
https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2022.651
Resumo: Durante a espermatogênese, o espermatozoide imaturo sofre uma série de mudanças morfológicas, e o núcleo é condensado para proteger o DNA. Assim, o espermatozoide aparentemente transcricionalmente silenciado depende exclusivamente dos fatores extracelulares para sua sobrevivência e funcionalidade. O plasma seminal (PS) é um fluido produzido pelas glândulas sexuais acessórias, epidídimos e testículos, e desempenha papéis cruciais no espermatozoide. Compreender a complexidade das proteínas seminais ainda é um desafio e abordagens proteômicas têm sido amplamente utilizadas para descrevê-las e indicar potenciais biomarcadores de fertilidade. Para investigar o proteoma seminal e sua relação com a fertilidade espermática em touros, aplicamos uma extensa e sistemática pesquisa bibliográfica, selecionando 71 e 29 estudos para revisão sistemática e meta-análise, respectivamente. Qualitativamente, a exposição a uma única proteína, como a osteopontina (OPN), proteína ligadora do espermatozoide (BSPs) e proteínas de ligação à heparina (HBPs), se associa positivamente com motilidade, capacitação e fertilização dos espermatozoides. Quantitativamente, nossa meta-análise revelou que as proteínas seminais melhoram os parâmetros espermáticos. BSPs e beta-defensina 126 atuam positivamente na proteção espermática quando as células foram coletadas do epidídimo por fluxo retrógrado e analisadas em condições de temperatura ambiente. As proteínas seminais totais melhoraram a motilidade e a qualidade dos espermatozoides Bos taurus coletados por vagina artificial, principalmente na presença de HBPs. Devido à diversidade de metodologias aplicadas nos estudos, os aspectos translacionais da pesquisa em PS devem ser levados em consideração para definir com precisão como as proteínas seminais podem ser aproveitadas para o avanço da biotecnologia reprodutiva. Então, sugerimos que estudos futuros avaliem proteínas intactas para averiguar suas funções biológicas. Para abordar esta questão, avaliamos as associações entre proteoformas seminais e o status de congelabilidade de sêmen. Empregamos a espectrometria de massa top-down para gerar o atlas de proteoformas de espermatozóides e PS de touros com baixa (BC; n = 6) e alta (AC; n = 9) congelabilidade do sêmen. As proteínas espermáticas e seminais foram fracionadas por cromatografia de exclusão de molecular (< 30 kDa), e analisadas por espectrometria de massa (operado no modo proteína intacta). Caracterizamos 299 e 267 proteoformas de espermatozoide e PS de touro, respectivamente; a maioria delas, truncado. Curiosamente, as duas proteínas que apresentaram maior número de proteoformas desempenham papéis opostos na regulação de cálcio intracelular, o peptídeo natriurético tipo c e a caltrina. Uma proteoforma truncada de beta-defensina 10 com ácido pirrolidona carboxílico no N-terminal foi identificada exclusivamente no PS de touros AC e, após futuras investigações, poderá ser apontada como um potencial biomarcador. Oito truncações de OPN, incluindo uma com um sítio de fosforilação da serina, foram expressos exclusivamente no SP de touros BC. Em relação às proteoformas espermáticas, descrevemos uma proteoforma acetilada da histona H2A tipo 1 e uma proteoforma de ligação à proteína c-Myc em touros BC, o que pode indicar uma deficiência na condensação do DNA e/ou atividade nuclear. Este primeiro atlas de proteoformas espermáticas e seminais dentre quaisquer outras espécies mostrou que o processamento pós- traducional pode definir atributos biológicos às proteínas e suas associações empíricas com a crio resistência espermática. Palavras-chave: Touro. Fertilidade. Plasma seminal. Proteínas. Proteoformas. Revisão sistemática. Meta-análise.
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spelling Moura, Arlindo de Alencar Araripe NoronhaViana, Arabela Guedes de Azevedohttp://lattes.cnpq.br/3257628340084374Neves, Mariana Machado2023-01-18T14:17:42Z2023-01-18T14:17:42Z2022-10-20VIANA, Arabela Guedes de Azevedo. Proteomic applications for studies of bull fertility. 2022. 208 f. Tese (Doutorado em Medicina Veterinária) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2022.https://locus.ufv.br//handle/123456789/30380https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2022.651Durante a espermatogênese, o espermatozoide imaturo sofre uma série de mudanças morfológicas, e o núcleo é condensado para proteger o DNA. Assim, o espermatozoide aparentemente transcricionalmente silenciado depende exclusivamente dos fatores extracelulares para sua sobrevivência e funcionalidade. O plasma seminal (PS) é um fluido produzido pelas glândulas sexuais acessórias, epidídimos e testículos, e desempenha papéis cruciais no espermatozoide. Compreender a complexidade das proteínas seminais ainda é um desafio e abordagens proteômicas têm sido amplamente utilizadas para descrevê-las e indicar potenciais biomarcadores de fertilidade. Para investigar o proteoma seminal e sua relação com a fertilidade espermática em touros, aplicamos uma extensa e sistemática pesquisa bibliográfica, selecionando 71 e 29 estudos para revisão sistemática e meta-análise, respectivamente. Qualitativamente, a exposição a uma única proteína, como a osteopontina (OPN), proteína ligadora do espermatozoide (BSPs) e proteínas de ligação à heparina (HBPs), se associa positivamente com motilidade, capacitação e fertilização dos espermatozoides. Quantitativamente, nossa meta-análise revelou que as proteínas seminais melhoram os parâmetros espermáticos. BSPs e beta-defensina 126 atuam positivamente na proteção espermática quando as células foram coletadas do epidídimo por fluxo retrógrado e analisadas em condições de temperatura ambiente. As proteínas seminais totais melhoraram a motilidade e a qualidade dos espermatozoides Bos taurus coletados por vagina artificial, principalmente na presença de HBPs. Devido à diversidade de metodologias aplicadas nos estudos, os aspectos translacionais da pesquisa em PS devem ser levados em consideração para definir com precisão como as proteínas seminais podem ser aproveitadas para o avanço da biotecnologia reprodutiva. Então, sugerimos que estudos futuros avaliem proteínas intactas para averiguar suas funções biológicas. Para abordar esta questão, avaliamos as associações entre proteoformas seminais e o status de congelabilidade de sêmen. Empregamos a espectrometria de massa top-down para gerar o atlas de proteoformas de espermatozóides e PS de touros com baixa (BC; n = 6) e alta (AC; n = 9) congelabilidade do sêmen. As proteínas espermáticas e seminais foram fracionadas por cromatografia de exclusão de molecular (< 30 kDa), e analisadas por espectrometria de massa (operado no modo proteína intacta). Caracterizamos 299 e 267 proteoformas de espermatozoide e PS de touro, respectivamente; a maioria delas, truncado. Curiosamente, as duas proteínas que apresentaram maior número de proteoformas desempenham papéis opostos na regulação de cálcio intracelular, o peptídeo natriurético tipo c e a caltrina. Uma proteoforma truncada de beta-defensina 10 com ácido pirrolidona carboxílico no N-terminal foi identificada exclusivamente no PS de touros AC e, após futuras investigações, poderá ser apontada como um potencial biomarcador. Oito truncações de OPN, incluindo uma com um sítio de fosforilação da serina, foram expressos exclusivamente no SP de touros BC. Em relação às proteoformas espermáticas, descrevemos uma proteoforma acetilada da histona H2A tipo 1 e uma proteoforma de ligação à proteína c-Myc em touros BC, o que pode indicar uma deficiência na condensação do DNA e/ou atividade nuclear. Este primeiro atlas de proteoformas espermáticas e seminais dentre quaisquer outras espécies mostrou que o processamento pós- traducional pode definir atributos biológicos às proteínas e suas associações empíricas com a crio resistência espermática. Palavras-chave: Touro. Fertilidade. Plasma seminal. Proteínas. Proteoformas. Revisão sistemática. Meta-análise.During spermatogenesis, the immature spermatozoon undergoes a series of morphological changes, and the nucleus is highly condensed to protect the DNA. Thus, the apparently transcriptionally silent sperm exclusively depends on the extracellular factors for survival and functionality. The seminal plasma (SP) is a fluid produced by accessory sexual glands, epididymides, and testes, and plays crucial roles in the ejaculated sperm. Understanding the complexity of the SP proteins is still a challenge and proteomic approaches have been widely used to uncover SP proteins and, consequently, potential protein biomarkers of bull fertility. To verify the state of the art of the SP proteome and its relationship with sperm fertility in bulls, we applied an extensive and systematic literature search to select 71 and 29 studies for systematic review and meta-analysis research, respectively. Qualitatively, the exposure to a single protein, such as osteopontin (OPN), binder of sperm proteins (BSPs), and heparin- binding proteins (HBPs), positively associates with sperm motility, capacitation, and fertilizing ability. Quantitatively, our meta-analysis revealed that seminal proteins ameliorate sperm parameters. BSPs and beta-defensin 126 highly favored sperm protection when cells were collected from the epididymis by retrograde flux and analyzed under room temperature conditions. Total SP proteins improved the motility and quality of Bos taurus sperm collected by artificial vagina, mainly in the presence of HBPs. Due to the diversity of methodologies applied in the eligible studies, the translational aspects of SP research should be taken into consideration to precisely define how seminal proteins can be harnessed to advance reproductive biotechnology. Then, we suggested that future studies should evaluate intact proteins to ascertain their biological functions. To address this question, we evaluated the associations between seminal proteoforms in bulls with contrasting freezability statuses. We employed top-down mass spectrometry to generate sperm and seminal plasma proteoform atlas of bulls with low (LF; n = 6 ) and high (HF; n = 9) semen freezability. Sperm and seminal plasma proteins were fractionated by tandem size exclusion chromatography (< 30 kDa) and analyzed by mass spectrometry (operated in protein intact mode). We characterized 299 and 267 bull SP and sperm proteoforms, respectively; most of them, truncated. Interestingly, the two proteins that presented the greatest number of proteoforms play opposite roles in the regulation of calcium intake, the c-type natriuretic peptide and the caltrin. A truncated proteoform of beta-defensin 10 with pyrrolidone carboxylic acid in the N-terminal was exclusively identified in the SP of HF bulls and may be further investigated to be pointed out as a potential biomarker. Eight truncations of OPN, including one with a serine phosphorylation site, were uniquely expressed in the SP of LF bulls. Regarding sperm proteoforms, we described the acetylation of histone H2A type 1 and c-Myc protein binding proteoform in LF sires, which may indicate a deficiency in DNA packing and/or nuclear activity. This first sperm and seminal plasma proteoform atlas of any species, showed that post-translational processing appears to define bio-attributes of proteins and their empirical associations with sperm cryoresistance. Keywords: Bull. Fertility. Seminal plasma. Proteins. Proteoforms. Systematic review. Meta- analysis.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoengUniversidade Federal de ViçosaMedicina VeterináriaBovinosSêmenFecundidadeProteomasProteinasFisiopatologia da Reprodução AnimalProteomic applications for studies of bull fertilityAplicações proteômicas no estudo da fertilidade de tourosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de VeterináriaDoutor em Medicina VeterináriaViçosa - MG2022-10-20Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtextocompleto.pdftextocompleto.pdftexto completoapplication/pdf4046051https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30380/1/textocompleto.pdf5eec9181f193ac0c09c7af6767be77cbMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30380/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/303802023-01-18 11:17:44.39oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452023-01-18T14:17:44LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
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