Otimização da PCR para detecção de Xanthomonas campestris pv. viticola em videiras assintomáticas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Miranda, Tatiana David
Data de Publicação: 2011
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UnB
Texto Completo: http://bdm.unb.br/handle/10483/1835
Resumo: Monografia (graduação)—Consórcio Setentrional de Educação a Distância, Universidade de Brasília, Universidade Estadual de Goiás, Curso de Licenciatura em Biologia a Distância, 2011.
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spelling Miranda, Tatiana DavidFerreira, Marisa Álvares da Silva VellosoMIRANDA, Tatiana David. Otimização da PCR para detecção de Xanthomonas campestris pv. viticola em videiras assintomáticas. 2011. 37 f., il. Monografia (Licenciatura em Ciências Biológicas)—Consórcio Setentrional de Educação a Distância, Universidade de Brasília, Universidade Estadual de Goiás, Brasília, 2011.http://bdm.unb.br/handle/10483/1835Monografia (graduação)—Consórcio Setentrional de Educação a Distância, Universidade de Brasília, Universidade Estadual de Goiás, Curso de Licenciatura em Biologia a Distância, 2011.O cancro bacteriano da videira, causado por Xanthomonas campestris pv. viticola Nayudu (Dye), foi detectado no Brasil pela primeira vez em 1998, no município de Petrolina, Pernambuco. Posteriormente, casos da doença foram relatados na Bahia, Piauí, Ceará, Goiás e Roraima. O cancro da videira representa a doença bacteriana mais importante da região do Vale do Submédio São Francisco, apresentando incidência expressiva e grande importância econômica. Considerando a crescente preocupação com o uso de material propagativo livre da doença, a possibilidade de sua disseminação para outras regiões produtoras e a necessidade de comprovação da sanidade de mudas, este trabalho teve como objetivo a detecção de X.c. pv. viticola em frutos e cachos assintomáticos, de forma a otimizar a detecção molecular do patógeno, e de determinar o limite mínimo de detecção da bactéria por PCR (Reação da Polimerase em Cadeia) e Bio-PCR aliado ao uso de meio semi-seletivo NYDAM. Nos ensaios realizados para detecção de X.c. pv. viticola foram utilizados cachos de videira inoculados artificialmente com suspensões de diferentes concentrações da bactéria. Os cachos inoculados foram lavados e foi realizada a PCR direta após centrifugação de alíquotas do lavado. Para a Bio-PCR, foi utilizada uma etapa de enriquecimento da população bacteriana presente nos frutos em meio NYDAM. Os ensaios demonstraram que é possível detectar X.c. pv. viticola a partir de frutos assintomáticos que possuem uma baixa concentração de células da bactéria aderidas a sua superfície (~103 ufc/ml), por meio da Nested-PCR realizada direto do lavado destes frutos ou através da Bio-PCR. Os resultados indicaram que o tempo de enriquecimento influenciou diretamente na sensibilidade do método de detecção, assim como a diluição do lavado das placas.Submitted by Luiza Moreira Camargo (luizaamc@gmail.com) on 2011-08-05T13:38:54Z No. of bitstreams: 1 2011_TatianaDavidMiranda.pdf: 432698 bytes, checksum: d94207abbb1b72fc022e8b9e865f52bd (MD5)Approved for entry into archive by Elna Araujo (elna@bce.unb.br) on 2011-08-17T21:23:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_TatianaDavidMiranda.pdf: 432698 bytes, checksum: d94207abbb1b72fc022e8b9e865f52bd (MD5)Made available in DSpace on 2011-08-17T21:23:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_TatianaDavidMiranda.pdf: 432698 bytes, checksum: d94207abbb1b72fc022e8b9e865f52bd (MD5)Uva - cultivoBactérias fitopatogênicasUva - doenças e pragasReação em cadeia de polimeraseOtimização da PCR para detecção de Xanthomonas campestris pv. viticola em videiras assintomáticasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis2011-08-17T21:23:49Z2011-08-17T21:23:49Z2011-08-17T21:23:49Z2011-06-11info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Biblioteca Digital de Monografias da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNBORIGINAL2011_TatianaDavidMiranda.pdf2011_TatianaDavidMiranda.pdfapplication/pdf432698http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/1/2011_TatianaDavidMiranda.pdfd94207abbb1b72fc022e8b9e865f52bdMD51CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain49http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/2/license_urlfd26723f8d7edacdb29e3f03465c3b03MD52license_textlicense_textapplication/octet-stream21199http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/3/license_text6d8c89d46a9129165bb6f6604d940460MD53license_rdflicense_rdfapplication/octet-stream23631http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/4/license_rdf0ebfb63a28ea1d6f51b802c66ebf651cMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1860http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/5/license.txt0cea7d0dce4983b57da9dd621d8bdce2MD55TEXT2011_TatianaDavidMiranda.pdf.txt2011_TatianaDavidMiranda.pdf.txttext/plain47215http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/1835/6/2011_TatianaDavidMiranda.pdf.txtef15ec3ce746aac8fa36df09d486635dMD5610483/18352013-02-05 12:12:03.8oai:bdm.unb.br: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 Digital de Monografiahttps://bdm.unb.br/PUBhttp://bdm.unb.br/oai/requestbdm@bce.unb.br||patricia@bce.unb.bropendoar:115712013-02-05T14:12:03Biblioteca Digital de Monografias da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
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