Presença do domínio Archaea em biofilmes associados à cárie dentária

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cena, Jéssica Alves de
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UnB
Texto Completo: https://bdm.unb.br/handle/10483/27353
http://dx.doi.org/10.26512/2020.TCC.27353
Resumo: Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Departamento de Odontologia, 2020.
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spelling Cena, Jéssica Alves deDias, Aline Belmok de AraújoTeixeira, Nailê DaméCENA, Jéssica Alves de. Presença do domínio Archaea em biofilmes associados à cárie dentária. 2020. 56 f., il. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Odontologia)—Universidade de Brasília, Brasília, 2020.https://bdm.unb.br/handle/10483/27353http://dx.doi.org/10.26512/2020.TCC.27353Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Departamento de Odontologia, 2020.(1) Objetivo: Avaliar a presença do domínio Archaea em biofilmes associados à cárie a partir do sequenciamento do gene 16S rRNA de Archaea. (2) Materiais e métodos: Para detectar a presença de Archaea na cárie dentária, foram coletadas três amostras de dentina cariada e duas amostra controle de biofilmes supragengivais, o DNA microbiano total foi extraído e a composição da microbiota investigada de duas formas. Primeiro fez-se a amplificação do gene 16S rRNA utilizando iniciadores procarióticos universais; os amplicons foram sequenciados por sequenciamento de DNA de alto rendimento. Como segunda estratégia para detectar sequências de Archaea, uma amostra representativa de cárie foi escolhida e outras reações de PCR foram realizadas usando iniciadores específicos visando o gene 16S rRNA de archaeas; amplicons foram clonados e sequenciados. A anotação das sequências foi realizada usando o banco de dados SILVA e a abundância relativa de unidades taxonómicas operacionais (OTUs) em nível de gênero foi calculada. (3) Resultados: O método de sequenciamento de alto rendimento detectou sequências de archaeas em todas as amostras (identificadas como grupo I.1c do filo Thaumarchaeota), embora em abundância muito baixa (≤ 0,03% do total de sequências). Com a segunda estratégia, foram detectados nove sequências de archaea, com uma OTU afiliada ao clado Methanocella e outra afiliada ao grupo I.1b do filo Thaumarchaeota. (4) Conclusões: Sequências de archaeas foram detectadas em cárie dentária e biofilmes de superfícies sem lesões de cárie. Sequências de DNA de Thaumarchaeota também foram identificadas, mostrando que a diversidade global de archaeas na cavidade oral humana pode estar atualmente subestimada e não restrita a metanogênicos.Submitted by Luiza Alves (luizaalves004@gmail.com) on 2021-04-24T19:47:32Z No. of bitstreams: 1 2020_JessicaAlvesDeCena_tcc.pdf: 415331 bytes, checksum: f366b6728d312441da41fe710c347d62 (MD5)Approved for entry into archive by Luanna Maia (luanna@bce.unb.br) on 2021-04-28T13:14:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2020_JessicaAlvesDeCena_tcc.pdf: 415331 bytes, checksum: f366b6728d312441da41fe710c347d62 (MD5)Made available in DSpace on 2021-04-28T13:14:40Z (GMT). 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Annotation of sequences was performed using SILVA database and the relative abundance of genus level OTUs was calculated. (3) Results: The highthroughput sequencing method detected archaeal sequences in all samples (identified as group I.1c of the phylum Thaumarchaeota), although in a very low abundance (≤ 0.03% of the total sequences). For the second strategy, nine archaeal sequences were detected, with an OTU affiliated to Methanocella clade, and another one affiliated to group I.1b of the phylum Thaumarchaeota. (4) Conclusions: Archaeal sequences were detected in dental caries and biofilms from surfaces without caries lesions. DNA sequences of Thaumarchaeota were also identified, showing that overall archaeal diversity in the human oral cavity could be currently underestimated and not restricted to methanogens.A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor que autoriza a Biblioteca Digital da Produção Intelectual Discente da Universidade de Brasília (BDM) a disponibilizar o trabalho de conclusão de curso por meio do sítio bdm.unb.br, com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 International, que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que seja citado o autor e licenciante. 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