Análise de polimorfismos genéticos em BMP4 (proteína morfogenética óssea 4) na susceptibilidade das fissuras labiais com ou sem fissura palatina não-sindrômica na população brasileira

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Oliveira, Lilianny Querino Rocha de, 1997-
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/12661
Resumo: Orientadores: Ricardo Della Coletta, Renato Assis Machado
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Embora vários genes e loci genéticos foram descritos como de risco para estas malformações congênitas, a susceptibilidade genética varia entre as populações. Isso é particularmente importante na população brasileira, na qual cada indivíduo apresenta níveis variados de ancestralidade, principalmente africana, ameríndia e europeia. Como a associação de variantes no gene da proteína morfogenética óssea 4 (BMP4) com as fissuras labiais com ou sem fissura palatina não-sindrômica (FL±PNS) parece variar em relação a etnia e os poucos estudos com a população brasileira foram realizados sem considerar a proporção de ancestralidade de cada participante e com amostras de tamanho relativamente pequeno, o objetivo deste estudo caso-controle foi avaliar a associação dos tag-SNPs rs11623717, rs17563, rs2071047 e rs2761887 em BMP4 com a susceptibilidade das FL±PNS na população brasileira, além de verificar o impacto das interações destas variantes com genes envolvidos na via de sinalização celular de BMP4, incluindo FGFR1, GREM1, NOG, VAX1 e o lócus 4p16.2. Para isso, 800 pacientes com FL±PNS (232 com fissura labial não-sindrômica - FLNS e 568 com fissura lábio-palatina não-sindrômica - FLPNS) e 881 controles foram genotipados com ensaios de discriminação alélica com sondas florescentes discriminantes. A ancestralidade de cada amostra foi determinada com um painel discriminante contendo 40 marcadores de anscetralidade da população brasileira. As interações SNP-SNP entre os polimorfismos em BMP4 e nos genes FGFR1, GREM1, NOG e VAX1 e o lócus 4p16.2 foi realizada por uma análise de regressão logística ajustada para gênero e ancestralidade genômica. Considerando a amostra total, nenhuma associação significativa entre os SNPs em BMP4 e o risco de desenvolvimento de FL±PNS, FLNS e FLPNS foi identificada. Contudo, quando apenas os pacientes com alta ancestralidade africana foram analisados, uma associação significante com o SNP rs2761887 foi observada [(ORhom: 2,16; 95%IC: 1,21-3,85; p=0.01) e (ORrec: 2,05; 95%IC: 1,21-3,47); p=0.0006)]. A análise de haplótipos, baseado em combinações de 2, 3 e 4 SNPs, também não revelou nenhuma associação significante. Dezesseis interações SNP-SNP de risco para as FL±PNS envolvendo BMP4 e os SNPs em FGFR1, GREM1, NOG e VAX1 e no lócus 4p16.2 foram identificadas. Conjuntamente, nossos resultados demonstram um risco aumentado de FL±PNS em indivíduos brasileiros com enriquecimento da ancestralidade africana na presença do polimorfismo rs2762887 em BMP4 e revelam que as interações entre BMP4 e FGFR1, GREM1, NOG e VAX1 e o lócus 4p16.2 podem estar relacionadas com a patogênese dessa malformação craniofacial comumAbstract: Non-syndromic orofacial clefts (NSOC) are the most common congenital malformations in the craniofacial region, with a multifactorial and complex etiology. Although several genes and genetic loci have been described as risk for these congenital malformations, genetic susceptibility varies between populations. This is particularly important in the Brazilian population, in which each individual has varying levels of ancestry, mainly African, Amerindian and European. As the association of variants in the bone morphogenetic protein 4 (BMP4) gene with non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL±P) seems to vary in relation to ethnicity and few studies with the Brazilian population were carried out without considering the proportion of ancestry of each participant and with samples of relatively small size, the objective of this case-control study was to evaluate the association of tag-SNPs rs11623717, rs17563, rs2071047 and rs2761887 in BMP4 with the susceptibility of NSCL±P in the Brazilian population, in addition to verifying the impact of the interactions of these variants with genes involved in the BMP4 cell signaling pathway, including FGFR1, GREM1, NOG, VAX1 and the 4p16.2 locus. For this, 800 patients with NSCL±P (232 with non-syndromic cleft lip - NSCL and 568 with non-syndromic cleft lip and palate - NSCLP) and 881 controls were genotyped with allelic discrimination assays with fluorescent discriminant probes. The ancestry of each sample was determined with a discriminant panel containing 40 markers of ancestrally of the Brazilian population. SNP-SNP interactions between polymorphisms in BMP4 and in the FGFR1, GREM1, NOG and VAX1 genes and the 4p16.2 locus were performed by a logistic regression analysis adjusted for gender and genomic ancestry. Considering the total sample, no significant association between the SNPs in BMP4 and the risk of developing NSCL±P, NSCL and NSCLP was identified. However, when only patients with high African ancestry were analyzed, a significant association with SNP rs2761887 was observed [(ORhom: 2.16; 95%CI: 1.21-3.85; p=0.01) and (ORrec: 2.05; 95%CI: 1.21-3.47); p=0.0006)]. Haplotype analysis, based on combinations of 2, 3 and 4 SNPs, also did not reveal any significant association. Sixteen significant SNP-SNP interactions for NSCL±P involving BMP4 and the SNPs at FGFR1, GREM1, NOG and VAX1 and at locus 4p16.2 were identified. Together, our results demonstrate an increased risk of NSCL±P in Brazilian individuals with enrichment of African ancestry in the presence of the rs2762887 polymorphism in BMP4 and reveal those interactions between BMP4 and FGFR1, GREM1, NOG and VAX1 and the 4p16.2 locus may be related to the pathogenesis of this common craniofacial malformationMestradoHistologia e EmbriologiaMestra em Biologia Buco-DentalCAPES001[s.n.]Della Coletta, Ricardo, 1972-Machado, Renato Assis, 1989-Planello, Aline CristianeVolpato, Luiz Evaristo RicciUniversidade Estadual de Campinas. Faculdade de Odontologia de PiracicabaPrograma de Pós-Graduação em Biologia Buco-DentalUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASOliveira, Lilianny Querino Rocha de, 1997-20222022-07-29T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (84 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/12661OLIVEIRA, Lilianny Querino Rocha de. Análise de polimorfismos genéticos em BMP4 (proteína morfogenética óssea 4) na susceptibilidade das fissuras labiais com ou sem fissura palatina não-sindrômica na população brasileira. 2022. 1 recurso online (84 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba, Piracicaba, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/12661. 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