Polimorfismo "KIF13B" c.*3163G>A no risco, aspectos clinicopatológicos e prognóstico de pacientes com carcinoma de células escamosas de orofaringe

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Costa, Ericka Francislaine Dias, 1988-
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/7727
Resumo: Orientador: Carmen Silvia Passos Lima
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spelling Polimorfismo "KIF13B" c.*3163G>A no risco, aspectos clinicopatológicos e prognóstico de pacientes com carcinoma de células escamosas de orofaringePolymorphism KIF13B c.*3163G>A in risk, clinicopathological aspects and prognosis of oropharyngeal squamous cell carcinoma patientsNeoplasias orofaríngeasRiscoPrognósticoProteína KIF13B humanaMicroRNAsPolimorfismo (Genética)Oropharyngeal neoplasmsRiskPrognosisKIF13B protein, humanMicroRNAsPolymorphism, GeneticOrientador: Carmen Silvia Passos LimaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: As diferenças individuais geradas por polimorfismos de base única (SNPs) em genes que atuam no mecanismo de transporte intracelular indicam que a constituição genética pode predispor indivíduos ao carcinoma de células escamosas (CCE) de orofaringe (OF) e influenciar no prognóstico de pacientes portadores do tumor. O SNP c.*3163G>A do gene KIF13B cria sítios de ligação para o microRNA (miRNA) let-7e-3p e, até onde atinge o nosso conhecimento, o papel desempenhado pelo referido SNP e do microRNA no CCEOF ainda são desconhecido. Frente ao exposto, os objetivos do estudo foram de avaliar se os diferentes genótipos do referido SNP influenciam o risco de ocorrência e os aspectos clínicos e biológicos do CCEOF, assim como o prognóstico dos pacientes e a expressão do gene KIF13B e do let-7e-3p dos controles. Foram avaliados 250 pacientes com CCEOF e 250 controles O DNA genômico foi obtido das amostras de leucócitos do sangue periférico dos pacientes e dos controles inseridos no estudo. Os genótipos do SNP "KIF13B" c.*3163G>A foram identificados pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) em tempo real. O RNA foi obtido das amostras de leucócitos de sangue periférico dos controles inseridos no estudo. A expressão gênica e do miRNA foram avaliadas pela técnica de PCR quantitativa. As diferenças entre os grupos foram avaliadas pelos testes da probabilidade exata de Fisher ou qui-quadrado, regressão logística múltipla, Kaplan-Meier, análises uni e multivariada de Cox e teste-t ou Mann-Whitney. O genótipo KIF13B c.*3163GG (42,0% versus 32,4%; P= 0,03) foi mais comum em pacientes com CCEOF do que em controles; indivíduos portadores do genótipo "KIF13B" c.*3163GG estiveram sob risco 1,73 vez maior de desenvolver o CCEOF do que os demais. O genótipo KIF13B c.*3163GG foi mais comum em pacientes com tumores volumosos do que nos demais (46,5% versus 28,3%, P= 0,01) e foi também mais comum em pacientes com tumores volumosos do que em controles (46,5% versus 32,4%; P= 0,004); indivíduos portadores do genótipo "KIF13B" c.*3163GG estiveram sob risco 2,47 vezes maior de desenvolver o CCEOF de grande extensão do que os demais. O referido SNP não influenciou a sobrevida livre de evento e a sobrevida global dos pacientes com CCEOF. Indivíduos com o genótipo GG apresentaram menor expressão do "KIF13B" (1,02 unidade arbitrária (UA) ± 0,35 desvio padrão (DP) versus 1,28 UA ± 0,53 DP; P= 0,05). O nível de expressão do miRNA let-7e-3p foi similar em indivíduos com os distintos genótipos do SNP KIF13B c.*3163G>A (0,52UA ± 0,31DP versus 0,48UA ± 0,26DP versus 0,55UA ± 0,39DP, respectivamente; P= 0,85). Nosso estudo sugere, pela primeira vez, que o SNP KIF13B c.*3163G>A está associado ao maior risco de ocorrência do CCEOF e do CCEOF de grande extensão, possivelmente devido à variação da expressão do gene KIF13B modulada pelo miRNA let-7e-3pAbstract: Individual differences generated by single base polymorphisms (SNPs) in genes that act on the mechanism of intracellular transport indicate that genetic constitution may predispose individuals to oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) and influence the prognosis of patients with this tumor. SNP KIF13B c.*3163G>A creates binding sites for microRNA (miRNA) let-7e-3p and, to the best of our knowledge, the role of c.*3163G>A genotypes in KIF13B gene and let-7e-3p of OPSCC is still uncertain. Thus, the present study aimed to verify whether the distinct genotypes of the SNP influence the OPSCC risk of occurrence tumor aspects of OPSCC, as well as the prognosis of patients and the KIF13B gene and let-7e-3p expression of controls. We evaluated 250 OPSCC patients and 250 controls. The genomic DNA was obtained from peripheral blood leukocyte samples from patients and controls entered into the study. The "KIF13B" c.*3163G>A SNP genotypes were identified by real-time polymerase chain reaction (PCR). The RNA was obtained from peripheral blood leukocyte samples from controls inserted into the study. The gene and let-7e-3p expression were evaluated by quantitative PCR. Differences between groups were assessed using the Fisher exact or chi-square test, multiple logistic regression, Kaplan-Meier, uni and multivariate Cox analyzes and test-t or Mann-Whitney. KIF13B c.*3163GG genotype was more common in OPSCC patients than in controls (42.0% versus 32.4%; P = 0.03); individuals with KIF13B c.*3163GG genotype were under 1.73-fold increased risk of OPSCC than others. KIF13B c.*3163GG genotype was more common in patients with greater tumor extension (46.5% versus 28.3%, P= 0.01) than others and in patients with greater tumor extension than in controls (46.5% versus 32.4%; P= 0.004); individuals with KIF13B c.*3163GG genotype were under 2.47-fold increased risk of aggressive OPSCC than others. Similar frequencies of KIF13B c.*3163G>A SNP were observed in event-free and overall survival. Individuals with KIF13B c.*3163GG genotype showed lower levels of KIF13B mRNA (1.02 arbitrary unit (AU) ± 0.35 standard deviation (SD) versus 1.28 AU ± 0.53 SD, P = 0.05). The expression level of miRNA let-7e-3p was similar in individuals with distinct genotypes KIF13B c.*3163G>A SNP (0.52AU ± 0.31DP versus 0.48AU ± 0.26DP versus 0.55AU ± 0.39DP, respectively; P= 0.85). Our data present, for the first time, evidence that KIF13B c.*3163G>A SNP is associated with increased risk of OPSCC possibly due to the variation of KIF13B gene expression, modulated by the miRNA let -7e-3pDoutoradoClínica MédicaDoutora em CiênciasCNPQ109275/2010-1CAPES88881.134328/2016-01FAPESP2015/18039-6[s.n.]Lima, Carmen Silvia Passos, 1957-Gonçalves, Marilda de SouzaBertuzzo, Carmen SílviaCastro Junior, GilbertoVassallo, JoséUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação em Clínica MédicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASCosta, Ericka Francislaine Dias, 1988-20182018-08-29T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf1 recurso online (117 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/7727COSTA, Ericka Francislaine Dias. Polimorfismo "KIF13B" c.*3163G>A no risco, aspectos clinicopatológicos e prognóstico de pacientes com carcinoma de células escamosas de orofaringe. 2018. 1 recurso online (117 p.) Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/7727. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1260866porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-03-06T16:04:25Zoai::1260866Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2023-03-06T16:04:25Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
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