Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842 |
Resumo: | Orientador: Fábio Cesar Gozzo |
id |
UNICAMP-30_31ba47e39b2e3c19cdc8b44a3093da5e |
---|---|
oai_identifier_str |
oai::773703 |
network_acronym_str |
UNICAMP-30 |
network_name_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository_id_str |
|
spelling |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massaMethodological developments in structural proteomics by mass spectrometryEspectrometria de massaProteômica estruturalProteínas - Ligações cruzadasFootprintingMass spectrometryProteomics structuralCross-linking of proteinsFootprintingOrientador: Fábio Cesar GozzoTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: A espectrometria de massas (MS) consiste no estudo dos íons em fase gasosa, tendo como uma das suas principais aplicações a caracterização estrutural de moléculas. Desde o início da técnica, ela vem sendo empregada na elucidação estrutural de um grande número de moléculas orgânicas e é hoje uma das principais ferramentas de caracterização estrutural. Dentro os métodos baseado em MS para o estudo de estruturas superiores de proteínas desenvolvidos recentemente estão aqueles conhecidos como footprinting e ligação cruzada (cross-linking). Nesta tese, estudos foram realizados para o desenvolvimento, melhorias e otimização de técnicas de footprinting e ligação cruzada acopladas à espectrometria de massas para o estudo estrutural de proteínas. Em footprinting, foram desenvolvidas fontes alternativas de radiação UV para geração de radicais ¿OH a partir da fotólise do H2O2 para mapeamento da superfície exposta ao solvente de proteínas, bem como o desenvolvimento de uma técnica mais apropriada de quantificação de peptídeos oxidados. Os resultados obtidos demonstraram que as fontes propostas apresentaram boa eficiência no processo de fotólise do H2O2 Na técnica de ligação cruzada, foram realizados estudos fundamentais a respeito da reatividade dos Agentes de Ligação Cruzadas (ALC¿s) tanto com relação à especificidade dos ALC¿s frente às cadeias laterais dos aminoácidos quanto à cinética da reação com proteínas e reação competitiva de hidrólise. Nos experimentos realizados foi possível verificar a reatividade do ALC frente a diferentes grupos nucleofilicos presentes nas cadeias laterais dos resíduois de aminoacido bem como ser suscetivel a mudança de reatividade em virtude do pH utilizado.Abstract: Mass spectrometry (MS) study ions in the gas phase, and one of its main applications is the structural characterization of molecules. Since the beginning of the technique, it has been used in structural study of a large number of organic molecules and is now a major tool for structural characterization. Among the MSbased methods for the study of higher structures of proteins are the newly developed methods of footprinting and cross-linking. In this thesis, studies were undertaken for the development, improvement and optimization of, footprinting and cross-linking coupled with mass spectrometry for the structural analysis of proteins. In footprinting, we developed alternative sources of UV radiation to generate ¿OH radicals from the photolysis of H2O2 to map the solvent exposed surface of proteins as well as the development of a more appropriated technique for quantification of oxidized peptides. The results showed that the proposed sources showed good efficiency in the process of photolysis of H2O2. For cross-linking, fundamental studies were carried out concerning the reactivity of the cross-linkers regarding both the specificity of ALC in respect to amino acid side chains and the kinetics of reaction with proteins as well as hydrolysis reaction. In the experiments it was possible to verify the reactivity of ALC against different nucleophilic groups present in side chains of amino acid residues as well as being susceptible to change in reactivity due to the pH used.DoutoradoQuímica AnalíticaDoutor em Ciências[s.n.]Gozzo, Fábio Cesar, 1972-Moraes, Luiz Alberto Beraldo deAugusto, RodineyArruda, Marco Aurelio ZezziSimionato, Ana Valéria ColnaghiUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em CiênciasUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASPilau, Eduardo Jorge20102010-03-05T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf104 p. : il.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842PILAU, Eduardo Jorge. Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa. 2010. 104 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842. Acesso em: 15 mai. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/773703porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T05:58:36Zoai::773703Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T05:58:36Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa Methodological developments in structural proteomics by mass spectrometry |
title |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
spellingShingle |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa Pilau, Eduardo Jorge Espectrometria de massa Proteômica estrutural Proteínas - Ligações cruzadas Footprinting Mass spectrometry Proteomics structural Cross-linking of proteins Footprinting |
title_short |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
title_full |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
title_fullStr |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
title_full_unstemmed |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
title_sort |
Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa |
author |
Pilau, Eduardo Jorge |
author_facet |
Pilau, Eduardo Jorge |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Gozzo, Fábio Cesar, 1972- Moraes, Luiz Alberto Beraldo de Augusto, Rodiney Arruda, Marco Aurelio Zezzi Simionato, Ana Valéria Colnaghi Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Química Programa de Pós-Graduação em Ciências UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Pilau, Eduardo Jorge |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Espectrometria de massa Proteômica estrutural Proteínas - Ligações cruzadas Footprinting Mass spectrometry Proteomics structural Cross-linking of proteins Footprinting |
topic |
Espectrometria de massa Proteômica estrutural Proteínas - Ligações cruzadas Footprinting Mass spectrometry Proteomics structural Cross-linking of proteins Footprinting |
description |
Orientador: Fábio Cesar Gozzo |
publishDate |
2010 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2010 2010-03-05T00:00:00Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842 PILAU, Eduardo Jorge. Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa. 2010. 104 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842. Acesso em: 15 mai. 2024. |
url |
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842 |
identifier_str_mv |
PILAU, Eduardo Jorge. Desenvolvimentos metodológicos em proteômica estrutural por espectrometria de massa. 2010. 104 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1612842. Acesso em: 15 mai. 2024. |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.relation.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/773703 |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf 104 p. : il. |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
[s.n.] |
publisher.none.fl_str_mv |
[s.n.] |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) instacron:UNICAMP |
instname_str |
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
instacron_str |
UNICAMP |
institution |
UNICAMP |
reponame_str |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
collection |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository.name.fl_str_mv |
Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
repository.mail.fl_str_mv |
sbubd@unicamp.br |
_version_ |
1799138472649293824 |