Subtipagem do virus da imunodeficiencia humana tipo I (HIV-1) em crianças infectadas via perinatal

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Molina, Rosana Mara
Data de Publicação: 2005
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1601267
Resumo: Orientador: Sandra Cecilia Botelho Costa
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spelling Subtipagem do virus da imunodeficiencia humana tipo I (HIV-1) em crianças infectadas via perinatalHIV (Vírus)Reação em cadeia da polimeraseSequência de nucleotídeosOrientador: Sandra Cecilia Botelho CostaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias MedicasResumo: A infecção pelo HIV-1 em mulheres, tem aumentado nesses últimos anos, neste caso, torna-se importante o diagnóstico precoce do HIV-1 nas crianças nascidas de mães contaminadas. Para detectar o HIV-1 nessa população pediátrica, a ¿Nested-PCR¿ está sendo amplamente utilizada. O genoma do HIV-1 é variável e atualmente, há vários métodos para se detectar essas variações, sendo que o sequenciamento direto de fragmentos genéticos do HIV-1 é considerado padrão ouro para determinação dos subtipos do HIV-1. No presente trabalho foi incluído 58 amostras de crianças HIV-1 positivas (via perinatal), sendo que em 20 o diagnóstico foi obtido pela ¿Nested-PCR¿ para diagnóstico do HIV-1 (primers JA4 ¿ JA7, JA9 ¿ JA12, JÁ13 ¿ JA16 e JA17 ¿ JA20, com produto de 131, 341, 172 2 129 pb respectivamente, referentes aos genes gag, env ¿ 2 regiões e pol) antes da realização da genotipagem viral; as demais amostras (38) já eram crianças previamente diagnosticadas. As 58 amostras foram submetidas a ¿Nested-PCR¿ de região do gen env para posterior sequenciamento viral, com a utilização dos primers EN 70 - EN 85 e EN 80 - EN 95, com produto de amplificação de 682 pb. Posteriormente foi realizada a purificação do produto da PCR e o sequenciamento direto em seqüenciador automático MegaBace 1000R. Das 58 amostras analisadas, foi possível um sequenciamento e conseqüente subtipagem viral em 56. Dessas, 47 (83,93 %) foram portadoras do subtipo B e 9 (16,07 %) do subtipo F (F1) do HIV-1. Os resultados obtidos confirmam a predominância do subtipo B, seguido pelo F no BrasilAbstract: The HIV-1 infection in women has been increased these recent years, this way the early diagnosis of HIV-1 infected children born to contaminated mothers becomes very important. The ¿Nested-PCR¿ has been widely utilized in order to detect the HIV-1 in this pediatric population. The HIV-1 genome is variable, and nowadays, there are several methods to detect these variations and furthermore the direct sequencing of the HIV-1 genetic fragments is considered gold pattern for the determination of the HIV-1 subtypes. In the present study 58 samples from positive HIV-1 children (perinatal via) were included, seeing that the diagnosis in 20 of them was obtained by the ¿Nested-PCR¿ to the HIV-1 diagnosis (primers JA4 ¿ JA7, JA9 ¿ JA12, JÁ13 ¿ JA16 and JA17 ¿ JA20, with product of 131, 341, 172 2 129 pb respectively relating to genes gag, env ¿ 2 regions e pol) before the performance of the viral genotyping; the rest of the samples (38) were children previously diagnosed. The 58 samples were submitted to the ¿Nested-PCR¿ of the region of the env gen to posterior viral sequencing with the utilization of the primers EN 70 - EN 85 and EN 80 - EN 95, with the amplification product of 682 bp. Afterwards the purification of the PCR was carried out and the direct sequencing in a MegaBace 1000R automatic sequencer. From the 58 samples analyzed it was possible a sequencing and posterior viral subtyping in 56. From those ones, 47 (83,92 %) were HIV-1 subtype B infected and 9 (16,07 %) subtype F infected (F1). The results obtained assure the predominance of subtype B, followed by subtype F in BrazilDoutoradoCiências BásicasDoutor em Clínica Médica[s.n.]Costa, Sandra Cecília Botelho, 1951-Gonçales Junior, Fernando LopesAoki, Francisco HideoMelo, Mônica Barbosa deMarteline, Marco AurelioUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação em Clínica MédicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASMolina, Rosana Mara20052005-02-24T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf144p. : il.(Broch.)https://hdl.handle.net/20.500.12733/1601267MOLINA, Rosana Mara. Subtipagem do virus da imunodeficiencia humana tipo I (HIV-1) em crianças infectadas via perinatal. 2005. 144p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1601267. Acesso em: 2 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/359159porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T04:20:42Zoai::359159Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T04:20:42Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
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