Analise estatistica de polimorfismo molecular em sequencias de DNA utilizando informações filogeneticas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Kiihl, Samara Flamini, 1980-
Data de Publicação: 2005
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1599539
Resumo: Orientador: Hildete Prisco Pinheiro
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spelling Analise estatistica de polimorfismo molecular em sequencias de DNA utilizando informações filogeneticasModelos lineares (Estatística)Simulação (Computadores) - Métodos estatísticosBioestatísticaLinear models (Statistics)Simulation (Computers) - Statistical methodsBiostatisticsOrientador: Hildete Prisco PinheiroDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação CientificaResumo: Variacao genetica no nivel de nucleotideo e uma fonte poderosa de informacao para o estudo da evolucao de uma populacao. Importantes aspectos da evolucao de populacoes naturais tem sido investigados utilizando sequencias de nucleotideos. A quantidade ? = 4N?, em que N e o tamanho efetivo da populacao e ? e a taxa de mutacao por sequencia (gene, locus) por geracao, e um parametro essencial porque determina o grau de polimorfismo em um locus. O sucesso da inferencia sobre a evolucao de uma populacao e medido pela acuracia da estimacao deste parametro. Esta dissertacao de mestrado apresenta diversos metodos de estimacao do parametro ?, bem como uma comparacao entre eles atraves de simulacoes e aplicacoes a dados reais. Utilizando informacoes filogeneticas de amostras de sequencias de DNA, constr'oi-se um modelo linear onde o coeficiente da variavel independente e a estimativa do parametro ?. Verificou-se que utilizando informacoes filogeneticas dos dados obtem-se estimadores bem mais eficientesAbstract: Genetic variation at the nucleotide level is a powerful source of information for studying the evolution of a population. Important aspects of the evolution of a population have been investigated by using nucleotide sequences. The quantity ? = 4N?, where N is the effective size of the population and ? is the mutation rate per sequence (gene, locus) per generation, is an essential parameter because it determines the degree of polymorphism at the locus. The degree of success in our inference about the evolution of a population is measured to some extent by the accuracy of estimation of this essential parameter. This work presents some methods of estimation of this parameter, comparisons between the different methods through computational simulations and applications to real data. The evolution of a species can be seen through a phylogenetic tree and a linear model can be constructed by using the phylogenetic information to estimate ?. It has been verified that the use of such information leads us to more accurate estimators of ?MestradoEstatísticaMestre em Estatística[s.n.]Pinheiro, Hildete Prisco, 1966-Marques, Mauro Sergio de FreitasPaula, Gilberto AlvarengaUniversidade Estadual de Campinas. Instituto de Matemática, Estatística e Computação CientíficaPrograma de Pós-Graduação em EstatísticaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASKiihl, Samara Flamini, 1980-20052005-02-25T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf155p. : il.(Broch.)https://hdl.handle.net/20.500.12733/1599539KIIHL, Samara Flamini. Analise estatistica de polimorfismo molecular em sequencias de DNA utilizando informações filogeneticas. 2005. 155p. Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1599539. Acesso em: 14 mai. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/334868porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2022-09-13T14:46:39Zoai::334868Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2022-09-13T14:46:39Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
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