Análise das variantes nos genes FOXC1 (rs2745572), ATXN2 (rs7137828) e TXNRD2 (rs35934224) como fatores de risco para o desenvolvimento de glaucoma primário de ângulo aberto em uma amostra da população brasileira
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/20.500.12733/7730 |
Resumo: | Orientadores: Monica Barbosa de Melo, Jose Paulo Cabral de Vasconcellos |
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Análise das variantes nos genes FOXC1 (rs2745572), ATXN2 (rs7137828) e TXNRD2 (rs35934224) como fatores de risco para o desenvolvimento de glaucoma primário de ângulo aberto em uma amostra da população brasileiraAssociation of variants in the ATXN2 (rs7137828), FOXC1 (rs2745572) and TXNRD2 (rs35934224) genes as risk factors for primary open-angle glaucoma development in a brazilian cohortGlaucoma primário de ângulo abertoPolimorfismo de nucleotídeo únicoFOXC1 geneATXN2 geneTXNRD2 genePrimary open angle glaucomaSingle nucleotide variantFOXC1 geneATXN2 geneTXNRD2 geneOrientadores: Monica Barbosa de Melo, Jose Paulo Cabral de VasconcellosDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: Introdução: O glaucoma primário de ângulo aberto (GPAA) é a principal causa de cegueira irreversível no mundo, sendo descrito como uma doença assintomática, neurodegenerativa e de etiologia multifatorial, cuja principal característica é o dano progressivo do nervo óptico e perda progressiva das células ganglionares da retina (CGRs). Portanto, a identificação de fatores genéticos e ambientais é de máxima importância para um diagnóstico precoce e para o estabelecimento de um manejo clínico apropriado. Estudo de associação de amplitude genômica (GWAS) identificaram variantes de nucleotídeo único (SNVs) nos genes FOXC1, TXNRD2 e ATXN2, que podem estar associados à fisiopatologia e endofenótipos do GPAA. Entretanto, estas variantes ainda não foram investigadas em populações miscigenadas, como a população brasileira. Propósito: O principal objetivo deste estudo de modelo caso-controle foi investigar a associação das variantes rs2745572 (FOXC1), rs7137828 (ATXN2) e rs35934224 (TXNRD2), como fatores de risco para o desenvolvimento de GPAA em uma coorte brasileira da região sudeste e sul do país. Métodos: Este estudo envolveu 506 casos (indivíduos glaucomatosos) e 501 controles (indivíduos sem glaucoma e histórico familiar negativo para cegueira). As variantes rs2745572 e rs35934224 foram genotipadas através de ensaios TaqMan® e validadas por sequenciamento de Sanger. A variante rs7137828 foi exclusivamente avaliada por sequenciamento direto. A associação genética foi estabelecida por meio de teste de Qui-quadrado e regressão logística. Resultados: O grupo caso consistiu em 50,99% de homens, enquanto o grupo controle foi composto por 43,11% (p=0,011). Não houve diferença estatisticamente significativa quanto a idade entre casos e controles. O achado inicial da pesquisa revela que a variante rs7137828 (ATXN2) foi associada com um aumento no risco para o desenvolvimento de GPAA na presença do alelo T (p=0,0024). Por meio de regressão logística multivariada ajustada por sexo, foi observado que o genótipo TT esteve associado com um aumento no risco para desenvolvimento da doença quando comparado ao genótipo CC (p = 0,006; OR = 1,717; IC95% = 1,169-2,55). Não foi observada associação entre as variantes rs2745572 (FOXC1) e rs35934224 (TXNRD2), para alelos e genótipos. O genótipo CT da SNV rs7137828 foi associado com a variável escavação do disco óptico no primeiro exame (p=0.023), mas não com a idade de diagnóstico ou alteração da variável MD no exame de campimetria automatizada acromática (CV-MD). Conclusão: Nossos dados indicam associação da variante rs7137828 em homozigose assim como na presença do alelo T com o aumento do risco para o desenvolvimento de GPAA na coorte estudada. Se validada em outras populações, estes achados podem permitir o desenvolvimento de estratégias relevantes no diagnóstico precoce e tratamento personalizado para glaucoma no futuroAbstract: Introduction: Primary Open Angle Glaucoma (POAG) is the main cause of irreversible blindness worldwide, being described as an asymptomatic and neurodegenerative disease of multifactorial etiology, whose major characteristic is the progressive damage of the optic nerve and a progressive loss of retinal ganglion cells (RGCs). Thus, the identification of genetic and environmental factors is of utmost importance for early diagnosis and to establish an appropriate clinical management. Genome Wide Association Studies (GWAS) identified single nucleotide variants (SNVs) on FOXC1, TXNRD2 and ATXN2 genes that may be associated with the pathophysiology and endophenotypes of POAG. However, these variants haven't yet been investigated on admixed populations, such as the Brazilian population. Purpose: The aim of this case-control study was to investigate the association of the variants rs2745572 (FOXC1), rs7137828 (ATXN2) and rs35934224 (TXNRD2), as risk or protective factors for the development of POAG in a Brazilian cohort from the Southeast and South regions. Methods: This study comprised 506 cases and 501 controls. Variants rs2745572 and rs35934224 were genotyped through TaqMan® assay and validated by Sanger sequencing in 10% of the samples. Variant rs7137828 was genotyped exclusively by Sanger sequencing. Genetic association was estimated through Chi-Square and Logistic Regression tests. Results: The case group was consisted of 50.99% males, while the control group was composed by 43.11% males (p=0.011). There was no statistical difference in age between cases and controls. The primary research outcome has revealed that the variant rs7137828 (ATXN2) was associated with an increased risk for the development of POAG in the presence of the T allele (p=0.0024). Through multivariate logistic regression adjusted by gender, the TT genotype was associated with an increased risk for development of POAG compared to the CC genotype (p=0.006; OR=1.717; IC95%=1.169-2.535). There was no significant association of rs2745572 (FOXC1) and rs35934224 (TXNRD2) variants for alleles and genotypes with POAG. The CT genotype of the rs7137828 was associated with vertical cup-to-disk ratio (VCDR) (p=0.023) but not with age at diagnosis or mean deviation. Conclusion: Our data indicate an association of the variant rs7137828 in homozygosity as well as in the presence of the T allele with an increased risk for the development of POAG in a Brazilian cohort. If validated in additional populations, this finding may enable the development of relevant strategies for early diagnosis of glaucoma in the futureMestradoGenética MédicaMestre em CiênciasCAPES88887.489152/2020-00FAPESP2018/20628-8[s.n.]Melo, Mônica Barbosa de, 1968-Vasconcellos, José Paulo Cabral de, 1963-Vieira, Tarsis Antonio PaivaPaula, Jayter Silva deUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação em Ciências MédicasUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASRodrigues, Thiago Adalton Rosa, 1997-20222022-12-14T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdf1 recurso online (168 p.) : il., digital, arquivo PDF.https://hdl.handle.net/20.500.12733/7730RODRIGUES, Thiago Adalton Rosa. Análise das variantes nos genes FOXC1 (rs2745572), ATXN2 (rs7137828) e TXNRD2 (rs35934224) como fatores de risco para o desenvolvimento de glaucoma primário de ângulo aberto em uma amostra da população brasileira. 2022. 1 recurso online (168 p.) Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/7730. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/1260868Requisitos do sistema: Software para leitura de arquivo em PDFporreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2023-03-07T10:16:18Zoai::1260868Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2023-03-07T10:16:18Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false |
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