Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Andrade, Tiago Gomes de
Data de Publicação: 2006
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065
Resumo: Orientador: Fernando Ferreira Costa
id UNICAMP-30_db1737ee839864a16dcf73ce4e022573
oai_identifier_str oai::362920
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemiaRegulatory mechanisms of globin syntheis : functional evaluation of R/PYR region and differential gene expression analysis in hereditary persistence of etal hemoglobin and delta-beta thalassemiaGlobinasTalassemiaExpressão gênicaDNAGlobinThalassemiasGene expressionDNAOrientador: Fernando Ferreira CostaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias MedicasResumo: Persistência Hereditária de Hemoglobina Fetal (PHHF) consiste num grupo heterogêneo de alterações hereditárias, sem manifestações clínicas significativas, onde ocorrem falhas na mudança perinatal normal de hemoglobina fetal para hemoglobina adulta, resultando em altos níveis de Hb F durante a vida adulta. Nos tipos delecionais ocorre normalmente aumento de ambas as cadeias, ? A e ? G, até 30%, estando associadas a deleções de seqüências de DNA dentro do grupo de genes ß. As (dß)º - talassemias também se originam a partir de deleções, em muitos casos bastante similares às que originam as formas delecionais de PHHF, entretanto com níveis de Hb F aumentados em menor proporção (5-20%), sendo acompanhadas nos heterozigotos por hipocromia e microcitose nas hemácias. Três hipóteses principais foram propostas para explicar a relação destas deleções com a ausência de supressão normal dos genes ? na fase adulta: competição entre promotores pelo LCR (Locus Control Region); justaposição de elementos acentuadores, normalmente encontrados a 3' do cluster, nas proximidades dos genes ?; remoção de elementos silenciadores, localizados entre ? A e d. Neste trabalho, realizamos estudos funcionais com uma região intergênica, aqui denominada R/PYR, potencialmente envolvida com o silenciamento de ? e a troca na síntese das cadeias de globinas. Os resultados obtidos com transfecção estável em células MEL apontam uma possível participação deste elemento na regulação dos genes de globina. Também investigamos o possível envolvimento de fatores de transcrição, construindo Bibliotecas de cDNA Subtrativas Supressivas para identificar transcritos diferencialmente expressos em reticulócitos de um sujeito com PHHF-2. A análise dos perfis diferenciais de expressão gênica em reticulócitos de PHHF-2 e normais mostram alterações em larga escala e que podem estar associadas com o fenótipo de PHHF. Estas modificações podem ser decorrentes de perturbações nas interações cromossômicas e/ou nos níveis de RNAs regulatórios não codificantes e ajudarem a melhor compreender a disposição e organização dos genes transcricionalmente ativos no genoma, e de que maneira são regulados. A presença de fatores de transcrição e remodeladores de cromatina, como ARID1B, TSPYL1 e ZHX2, dentre outros, com expressão alterada indicam fortemente que outros mecanismos genéticos estão envolvidos com o aumento da síntese de gama globina no estágio adulto, além dos modelos previamente descritos na literatura. Além disto, são candidatos potenciais a reguladores de globina que ainda não haviam sido descritos, e podem ajudar a compreender as diferenças fenotípicas encontradas entre dß-talassemia e PHHF delecional. Identificamos ainda outros genes com expressão diferencial, além de seqüências sem similaridade a genes categorizados, como ORFs, ESTs e seqüências genômicas, que podem ter papel importante na fisiologia normal das células vermelhas ou nas hemoglobinopatias hereditárias. Além disto, a observação de que os níveis de RNAm de alfa globina estão diminuídos em PHHF-2 e dß-Talassemia Siciliana sugere um mecanismo de regulação pós-transcripcional compensatório para as cadeias de globina ou de regulação gênica por interação física direta entre os cromossomos 11 e 16. Ao nosso conhecimento, esta é a primeira descrição demonstrando as implicações na expressão gênica em larga escala em células contendo alterações no DNA como as deleções apresentadaAbstract: The genetic mechanisms underlying the continued expression of the ?-globin genes during the adult stage in deletional hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH) and dß-thalassemias are not completely understood. For deletional HPFH, three main hypotheses were proposed to explain the relationship between these deletions and the non-suppression of ? -genes in the adult; 1- the removal of competitive regions that interact with the LCR; 2- the juxtaposition of enhancer elements located downstream from the breakpoint region; and 3- the removal of gene silencer elements. Herein, we studied a region, called R/PYR, that lies 1-3 Kb upstream from the d gene. This region has been implicated in ? globin repression and globin gene switching. Stable transfections in MEL cells suggest a possible involvement of R/PYR in globin regulation. We also investigated the possible involvement of transcription factors, using the SSH method to identify differentially expressed transcripts in reticulocytes from a normal and a HPFH-2 subject. Some of the detectable transcripts may participate in globin gene regulation. Quantitative RT-PCR experiments confirmed the downregulation of ZHX2, a transcriptional repressor, in two HPFH-2 subjects and in a carrier of the Sicilian dß-thalassemia trait. The chromatin remodeling factors ARID1B and TSPYL1 had a very similar pattern of expression with an incremental increase in HPFH and decreased expression in dß-thalassemia. These differences suggest a mechanism to explain the heterocellular and pancellular distribution of F cells in dß-thalassemia and deletional HPFH, respectively. Interestingly, a-globin mRNA levels were decreased, similar to ß-globin in all reticulocyte samples analyzed, which may be the result of a common regulatory process affecting a-like and ß-like globin synthesis. Part of the altered gene expression detected within the subtracted libraries may be an indirect effect due to the increased concentration of HbF in the cells. However, genetic alterations similar to those presented in this work may be implicated in the perturbation of chromosome interactions and/or disruption of the expression of regulatory non-coding transcripts with functional consequences for cellular gene expression. Additionally, other genes may have modifications of their expression, but were not detected in our experiments. To our knowledge, this is the first description of wide-ranging gene expression alterations in cells containing deletional HPFH and thalassemia. Finally, the dissection of the differential expression data presented in this study may help elucidate important pathways of erythroid differentiation and maintenance of red cells in peripheral circulation, as well as aid in the understanding of genetic mechanisms involved in erythrocyte pathologies such as sickle cell disease and thalassemiasDoutoradoBiologia Estrutural, Celular, Molecular e do DesenvolvimentoDoutor em Fisiopatologia Médica[s.n.]Costa, Fernando Ferreira, 1950-Figueiredo, Maria StellaMelo, Mônica Barbosa deBertuzzo, Carmen SílviaSonati, Maria de FátimaUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências MédicasPrograma de Pós-Graduação não informadoUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASAndrade, Tiago Gomes de20062006-08-02T00:00:00Zinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf195p. : il.(Broch.)https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065ANDRADE, Tiago Gomes de. Mecanismos reguladores da sintese de globinas: avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia. 2006. 195p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065. Acesso em: 2 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/362920porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T04:27:15Zoai::362920Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T04:27:15Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
Regulatory mechanisms of globin syntheis : functional evaluation of R/PYR region and differential gene expression analysis in hereditary persistence of etal hemoglobin and delta-beta thalassemia
title Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
spellingShingle Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
Andrade, Tiago Gomes de
Globinas
Talassemia
Expressão gênica
DNA
Globin
Thalassemias
Gene expression
DNA
title_short Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
title_full Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
title_fullStr Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
title_full_unstemmed Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
title_sort Mecanismos reguladores da sintese de globinas : avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia
author Andrade, Tiago Gomes de
author_facet Andrade, Tiago Gomes de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Costa, Fernando Ferreira, 1950-
Figueiredo, Maria Stella
Melo, Mônica Barbosa de
Bertuzzo, Carmen Sílvia
Sonati, Maria de Fátima
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências Médicas
Programa de Pós-Graduação não informado
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Andrade, Tiago Gomes de
dc.subject.por.fl_str_mv Globinas
Talassemia
Expressão gênica
DNA
Globin
Thalassemias
Gene expression
DNA
topic Globinas
Talassemia
Expressão gênica
DNA
Globin
Thalassemias
Gene expression
DNA
description Orientador: Fernando Ferreira Costa
publishDate 2006
dc.date.none.fl_str_mv 2006
2006-08-02T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv (Broch.)
https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065
ANDRADE, Tiago Gomes de. Mecanismos reguladores da sintese de globinas: avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia. 2006. 195p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065. Acesso em: 2 set. 2024.
identifier_str_mv (Broch.)
ANDRADE, Tiago Gomes de. Mecanismos reguladores da sintese de globinas: avaliação funcional da região R/PYR e analise da expressão genica diferencial na persistencia hereditaria de hemoglobina fetal e na delta-beta talassemia. 2006. 195p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065. Acesso em: 2 set. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1602065
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/362920
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
195p. : il.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1809188939563532288

Registros relacionados