Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Prates, Erica Teixeira, 1985-
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
Texto Completo: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023
Resumo: Orientador: Munir Salomão Skaf
id UNICAMP-30_e0022196af4d648407d25c65b3ad50df
oai_identifier_str oai::912324
network_acronym_str UNICAMP-30
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository_id_str
spelling Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatasMolecular dynamics study of hydrolases for saccharification of cellulose and related proteinsDinâmica molecularCelulasesCeluloseEndoglucanasesEnzimas termofílicasMolecular dynamicsCellulasesCelluloseEndoglucanasesThermophilic enzymesOrientador: Munir Salomão SkafTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: A biomassa lignocelulósica proveniente do bagaço de cana-de-açúcar e de outras matérias-primas é um material altamente promissor para a geração de biocombustíveis renováveis e ambientalmente positivos. A melhor opção para a conversão dessa biomassa em açúcares solúveis fermentáveis a etanol, em termos de rendimento e de vantagens ambientais, é a catálise enzimática. Mas esta é também a etapa mais cara do processo de obtenção de etanol de segunda geração devido à baixa eficiência e alto custo dos coquetéis enzimáticos atualmente disponíveis para este fim. Para tornar estes processos mais eficientes e economicamente viáveis, é preciso aprofundar nossa compreensão dos mecanismos de hidrólise celulolítica. Grande investimento em pesquisa tem sido empregado com esta finalidade e, como parte disto, este trabalho consiste em um conjunto de pesquisas desenvolvidas na área de simulação computacional via dinâmica molecular de três enzimas celulolíticas: 1) Laminarinase de Rodhothermus marinus; 2) Endoglucanase 3 de Trichoderma harzianum e 3) b- glicosidase de Aspergillus niger. De modo geral, estes estudos visaram investigar a relação entre o arranjo estrutural e propriedades mensuráveis em laboratório interessantes na avaliação da performance destes biocatalisadores, como afinidade pelo substrato e estabilidade térmica. Como parte do Projeto Temático BioEn, financiado pela FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo), estes estudos computacionais foram realizados em estreita colaboração com grupos de biofísicos estruturais e biólogos moleculares, sendo a escolha dos três temas embasada em resultados experimentaisAbstract: The lignocellulosic biomass from sugar cane bagasse and from other raw materials is a highly promising material for the generation of renewable and environmentally positive fuels. In terms of performance and environmental advantages, the best option for converting this biomass into soluble sugars to produce ethanol is the enzymatic catalysis. However, this is also the most expensive step of the second-generation ethanol production due to the low efficiency and high cost of the currently available enzyme cocktails. In order to make the process more efficient and economically viable, it is necessary to deepen the understanding of the cellulolytic hydrolysis mechanisms. Great investment in research has been employed for this purpose, and as part of these efforts, this work consists on a set of molecular dynamics studies of three cellulolytic enzymes, namely: 1) laminarinase from Rodhothermus marinus; 2) Endoglucanase 3 from Trichoderma harzianum and 3) b-glucosidase from Aspergillus niger. In general, these studies aimed to investigate the relationship between the structural arrangement and experimental data that are interesting for the biocatalyst performance evaluation, such as affinity to the substrate and thermal stability. As part of the BioEn Thematic Project, funded by FAPESP (Research Foundation of the State of São Paulo), these computational studies were carried out in close collaboration with structural biophysicists and molecular biologists. The choice of the three proteins considered here was based on these experimental studiesDoutoradoFísico-QuímicaDoutora em Ciências[s.n.]Skaf, Munir Salomão, 1963-Nascimento, Alessandro SilvaNetz, Paulo AugustoSilva, René Alfonso NomeAparicio, RicardoUniversidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de QuímicaPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINASPrates, Erica Teixeira, 1985-2013info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisapplication/pdf153 p. : il.https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023PRATES, Erica Teixeira. Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação: de celulose e proteínas correlatas. 2013. 153 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023. Acesso em: 3 set. 2024.https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/912324porreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)instacron:UNICAMPinfo:eu-repo/semantics/openAccess2017-02-18T07:05:28Zoai::912324Biblioteca Digital de Teses e DissertaçõesPUBhttp://repositorio.unicamp.br/oai/tese/oai.aspsbubd@unicamp.bropendoar:2017-02-18T07:05:28Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)false
dc.title.none.fl_str_mv Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
Molecular dynamics study of hydrolases for saccharification of cellulose and related proteins
title Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
spellingShingle Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
Prates, Erica Teixeira, 1985-
Dinâmica molecular
Celulases
Celulose
Endoglucanases
Enzimas termofílicas
Molecular dynamics
Cellulases
Cellulose
Endoglucanases
Thermophilic enzymes
title_short Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
title_full Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
title_fullStr Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
title_full_unstemmed Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
title_sort Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação : de celulose e proteínas correlatas
author Prates, Erica Teixeira, 1985-
author_facet Prates, Erica Teixeira, 1985-
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Skaf, Munir Salomão, 1963-
Nascimento, Alessandro Silva
Netz, Paulo Augusto
Silva, René Alfonso Nome
Aparicio, Ricardo
Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Química
Programa de Pós-Graduação em Química
UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
dc.contributor.author.fl_str_mv Prates, Erica Teixeira, 1985-
dc.subject.por.fl_str_mv Dinâmica molecular
Celulases
Celulose
Endoglucanases
Enzimas termofílicas
Molecular dynamics
Cellulases
Cellulose
Endoglucanases
Thermophilic enzymes
topic Dinâmica molecular
Celulases
Celulose
Endoglucanases
Enzimas termofílicas
Molecular dynamics
Cellulases
Cellulose
Endoglucanases
Thermophilic enzymes
description Orientador: Munir Salomão Skaf
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023
PRATES, Erica Teixeira. Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação: de celulose e proteínas correlatas. 2013. 153 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023. Acesso em: 3 set. 2024.
url https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023
identifier_str_mv PRATES, Erica Teixeira. Dinâmica molecular de hidrolases para sacarificação: de celulose e proteínas correlatas. 2013. 153 p. Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química, Campinas, SP. Disponível em: https://hdl.handle.net/20.500.12733/1621023. Acesso em: 3 set. 2024.
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv https://repositorio.unicamp.br/acervo/detalhe/912324
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
153 p. : il.
dc.publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
publisher.none.fl_str_mv [s.n.]
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instname:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron:UNICAMP
instname_str Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
instacron_str UNICAMP
institution UNICAMP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
repository.mail.fl_str_mv sbubd@unicamp.br
_version_ 1809189103847079936