Caracterização estrutural e funcional das HSP70 no genoma do feijão comum (Phaseolus vulgaris): Uma análise in silico
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Data de Publicação: | 2023 |
Outros Autores: | , , , , |
Tipo de documento: | Artigo |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Research, Society and Development |
Texto Completo: | https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/44073 |
Resumo: | O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é a leguminosa mais importante em todo o mundo, com produção global estimada em 26,8 milhões de toneladas métricas em 2016, além de ser cultivado por suas vagens verdes, bem como por suas sementes secas. As plantas, de uma maneira geral, respondem a estresses ambientais com uma série de mecanismos de adaptação fisiológica e molecular. As proteínas de choque térmico (HSPs) são proteínas protetoras contra uma ampla gama de condições de estresse bióticos e abióticos e são proteínas altamente conservadas que ocorrem em todos os organismos na natureza. Foi demonstrado pela primeira vez que as HSP70 eram induzidas por altas temperaturas, mas nos últimos anos elas foram consideradas como proteínas responsivas ao estresse geral, que são induzidas por muitas condições de estresse abiótico. Outros estudos verificaram que as HSP70s são altamente expressas sob condições de calor, frio e estresse por seca. Sendo assim, o aumento da tolerância devido à alta expressão de HSP70s foi demonstrado em algumas espécies de plantas. Diversas ferramentas computacionais têm sido utilizadas para uma ampla análise do genoma in silico têm sido utilizadas para identificação de novas proteínas e genes. Embora as tecnologias ômicas tenham se tornado significativamente populares, são poucos os estudos sobre identificação e caracterização da HSP70 em Phaseolus vulgaris. Portanto, o objetivo do presente estudo foi realizar uma caracterização estrutural e identificação das HSP70 em Phaseolus vulgaris utilizando métodos computacionais de genoma amplo, sendo elas: análise fenética, análise de potencial alergênico e modelagem tridimensional das sequências. |
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Caracterização estrutural e funcional das HSP70 no genoma do feijão comum (Phaseolus vulgaris): Uma análise in silicoStructural and functional characterization of HSP70 in the common bean (Phaseolus vulgaris) genome: An in sílico analysisCaracterización estructural y funcional de HSP70 en el genoma del frijol (Phaseolous vulgaris): Un análisis in silicoStructural characterizationCommon beanHeat shock protein.Caracterización estructuralFrijol comúnProteína de choque térmico.Caracterização estruturalFeijão comumProteína de choque térmico.O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é a leguminosa mais importante em todo o mundo, com produção global estimada em 26,8 milhões de toneladas métricas em 2016, além de ser cultivado por suas vagens verdes, bem como por suas sementes secas. As plantas, de uma maneira geral, respondem a estresses ambientais com uma série de mecanismos de adaptação fisiológica e molecular. As proteínas de choque térmico (HSPs) são proteínas protetoras contra uma ampla gama de condições de estresse bióticos e abióticos e são proteínas altamente conservadas que ocorrem em todos os organismos na natureza. Foi demonstrado pela primeira vez que as HSP70 eram induzidas por altas temperaturas, mas nos últimos anos elas foram consideradas como proteínas responsivas ao estresse geral, que são induzidas por muitas condições de estresse abiótico. Outros estudos verificaram que as HSP70s são altamente expressas sob condições de calor, frio e estresse por seca. Sendo assim, o aumento da tolerância devido à alta expressão de HSP70s foi demonstrado em algumas espécies de plantas. Diversas ferramentas computacionais têm sido utilizadas para uma ampla análise do genoma in silico têm sido utilizadas para identificação de novas proteínas e genes. Embora as tecnologias ômicas tenham se tornado significativamente populares, são poucos os estudos sobre identificação e caracterização da HSP70 em Phaseolus vulgaris. Portanto, o objetivo do presente estudo foi realizar uma caracterização estrutural e identificação das HSP70 em Phaseolus vulgaris utilizando métodos computacionais de genoma amplo, sendo elas: análise fenética, análise de potencial alergênico e modelagem tridimensional das sequências.The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most important legume worldwide, with global production estimated at 26.8 million metric tons in 2016, and is cultivated for its green pods as well as its dry seeds. Plants, in general, respond to environmental stresses with a series of physiological and molecular adaptation mechanisms. Heat shock proteins (HSPs) are protective proteins against a wide range of biotic and abiotic stress conditions and are highly conserved proteins that occur in all organisms in nature. HSP70 was first shown to be induced by high temperatures, but in recent years they have been considered as general stress-responsive proteins, which are induced by many abiotic stress conditions. Other studies have found that HSP70s are highly expressed under conditions of heat, cold and drought stress. Therefore, increased tolerance due to high expression of HSP70s has been demonstrated in some plant species. Several computational tools have been used for a broad analysis of the genome in silico and have been used to identify new proteins and genes. Although omics technologies have become significantly popular, there are few studies on the identification and characterization of HSP70 in Phaseolus vulgaris. Therefore, the objective of the present study was to carry out a structural characterization and identification of HSP70 in Phaseolus vulgaris using genome-wide computational methods, namely: phenetic analysis, allergenic potential analysis and three-dimensional modeling of the sequences.El frijol común (Phaseolus vulgaris L.) es la leguminosa más importante a nivel mundial, con una producción global estimada en 26,8 millones de toneladas métricas en 2016, y se cultiva por sus vainas verdes y sus semillas secas. Las plantas, en general, responden al estrés ambiental con una serie de mecanismos de adaptación fisiológicos y moleculares. Las proteínas de choque térmico (HSP) son proteínas protectoras contra una amplia gama de condiciones de estrés biótico y abiótico y son proteínas altamente conservadas que se encuentran en todos los organismos de la naturaleza. Se demostró por primera vez que la HSP70 era inducida por altas temperaturas, pero en los últimos años se ha considerado como proteínas generales que responden al estrés, que son inducidas por muchas condiciones de estrés abiótico. Otros estudios han encontrado que las HSP70 se expresan altamente en condiciones de calor, frío y estrés por sequía. Por lo tanto, se ha demostrado en algunas especies de plantas una mayor tolerancia debido a la alta expresión de HSP70. Se han utilizado varias herramientas computacionales para un análisis amplio del genoma in silico y se han utilizado para identificar nuevas proteínas y genes. Aunque las tecnologías ómicas se han vuelto significativamente populares, existen pocos estudios sobre la identificación y caracterización de HSP70 en Phaseolus vulgaris. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue llevar a cabo una caracterización estructural e identificación de HSP70 en Phaseolus vulgaris utilizando métodos computacionales de todo el genoma, a saber: análisis fenético, análisis de potencial alergénico y modelado tridimensional de las secuencias.Research, Society and Development2023-11-19info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/4407310.33448/rsd-v12i12.44073Research, Society and Development; Vol. 12 No. 12; e112121244073Research, Society and Development; Vol. 12 Núm. 12; e112121244073Research, Society and Development; v. 12 n. 12; e1121212440732525-3409reponame:Research, Society and Developmentinstname:Universidade Federal de Itajubá (UNIFEI)instacron:UNIFEIporhttps://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/44073/35352Copyright (c) 2023 Maria Letícia Pereira Aquino; Dalton Ferreira Matos; Genesio José do Amaral Ramos; José Alfredo dos Santos Júnior; José Valdemilson dos Santos Silva; Delma Holanda de Almeidahttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0info:eu-repo/semantics/openAccess Aquino, Maria Letícia PereiraMatos, Dalton Ferreira Ramos, Genesio José do Amaral Santos Júnior, José Alfredo dos Silva, José Valdemilson dos Santos Almeida, Delma Holanda de 2023-11-24T09:58:06Zoai:ojs.pkp.sfu.ca:article/44073Revistahttps://rsdjournal.org/index.php/rsd/indexPUBhttps://rsdjournal.org/index.php/rsd/oairsd.articles@gmail.com2525-34092525-3409opendoar:2023-11-24T09:58:06Research, Society and Development - Universidade Federal de Itajubá (UNIFEI)false |
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